安徽地方猪LDLR基因多态、表达及其与肉质的相关性分析

发布时间：2018-10-30 15:06

【摘要】：本研究以安徽地方猪种(圩猪、安庆六白猪、皖南黑猪和霍寿黑猪)为试验材料,以在动物体内胆固醇代谢过程中发挥重要功能的低密度脂蛋白受体(LDLR)基因为候选基因,采用PCR-SSCP技术检测LDLR基因部分区段的遗传变异,运用SPSS程序最小二乘分析法检测该遗传变异与血脂性状相关指标的相关性,并检测突变位点对LDLR基因在肌肉和肝脏组织表达的遗传效应;运用双变量相关性分析检测肝脏和背最长肌组织LDLR基因的表达水平对胴体及肉质性状的影响。研究影响血脂性状相关功能基因的构造、遗传与变异、表达及其与相关性状的相关性,选择可能会存在新的分子标记的多态性位点,以探讨利用该基因作为分子标记运用于猪遗传育种的可行性,为安徽地方猪种血脂及肉质性状的遗传改良提供科学根据。试验结果如下:(1)LDLR基因组织表达谱分析:LDLR基因的表达水平在肝脏中最高,脾脏上的表达水平最低,组织中从高到低的表达依次是肝脏、背肌、背脂、心脏、肾、脑、肺、脾。该试验验证了LDLR基因在肝脏中的高表达,为后续试验的开展提供了科学依据。(2)圩猪、安庆六白、皖南黑猪和霍寿黑猪LDLR基因第三内含子12088、12093碱基处发生A→G突变(g.12088AG)和C→T突变(g.12093CT)。通过群体遗传学分析表明:在g.12088AG突变位点中检测到AA、AG、GG三种基因型;在g.12093CT突变位点中检测到CC、CT、TT三种基因型,经过χ2适合性检验,被测猪群的基因型频率和基因频率都处于Hardy-Weinberg平衡状态,g.12088AG与g.12093CT两突变位点是连锁突变位点。(3)圩猪LDLR基因g.12088AG/g.12093CT突变位点与血液中胆固醇含量的相关性分析表明:在此两个位点的突变对血液总胆固醇、高密度和低密度脂蛋白胆固醇含量显著影响。(4)圩猪LDLR基因在不同基因型个体的肝脏和肌肉中的表达分析表明:不同基因型的圩猪LDLR在肝脏上的转录水平有显著差异,LDLR mRNA在AA/CC型圩猪肝脏中的表达显著高于GG/TT型(P0.05);LDLR mRNA在肌肉中的表达没有显著差异。(5)LDLR基因的表达与胴体、肉质性状的相关性分析表明:圩猪肝脏LDLR mRNA的表达量与背最长肌肌肉脂肪酸中的硬脂酸含量呈显著正相关(P0.05),与背膘厚呈显著负相关;圩猪背最长肌LDLR mRNA的表达量与背膘厚、肌肉胆固醇、肌内脂肪、十六碳烯酸、油酸呈显著正相关(P0.05),与肌肉脂肪酸中的硬脂酸和亚油酸呈显著负相关(P0.05)。研究结果提示:LDLRg.12088AG/g.12093CT位点可以作为圩猪血脂性状候选遗传标记,以应用于血脂性状的改良。猪LDLR基因可能在血脂性状和胴体、肉质性状的形成过程中发挥重要作用。
[Abstract]:In this study, Anhui local pig breeds (Wei pig, Anqing six white pig, southern Anhui black pig and Huoshou black pig) were used as experimental materials, and the candidate genes of low density lipoprotein receptor (LDLR), which play an important role in cholesterol metabolism, were used as candidate genes. PCR-SSCP technique was used to detect the genetic variation in some segments of LDLR gene, and the correlation between the genetic variation and the related indexes of lipid traits was detected by SPSS program least square analysis. The genetic effects of mutation sites on the expression of LDLR gene in muscle and liver were detected. The effects of LDLR gene expression level on carcass and meat quality in liver and longissimus dorsi were detected by bivariate correlation analysis. To study the structure, inheritance and variation of functional genes related to lipid traits, their expression and their correlation with related traits, the selection of polymorphic loci with new molecular markers may exist. To explore the feasibility of using this gene as a molecular marker in pig genetics and breeding, and to provide scientific basis for the genetic improvement of blood lipids and meat quality traits in Anhui local pig breeds. The results were as follows: (1) the expression of LDLR gene: the expression level of LDLR gene was the highest in the liver, the lowest in the spleen, and the highest in the liver, the dorsal muscle, the heart, the kidney and the brain in the tissue. Lung, spleen. This experiment verified the high expression of LDLR gene in liver and provided the scientific basis for the subsequent test. (2) Pigs, Anqing six white, The A G mutation (g.12088AG) and C taut mutation (g.12093CT) occurred in the third intron 12088 of the LDLR gene in southern Anhui black pigs and Huoshou black pigs. Population genetic analysis showed that three genotypes of AA,AG,GG were detected in g.12088AG mutation sites. Three genotypes of CC,CT,TT were detected in the g.12093CT mutation site. The genotype frequency and gene frequency of the tested pigs were in the Hardy-Weinberg equilibrium state after 蠂 2 fitness test. (3) the relationship between g.12088AG/g.12093CT mutation site of LDLR gene and cholesterol content in blood was analyzed. High density and low density lipoprotein cholesterol contents were significantly affected. (4) the expression of LDLR gene in liver and muscle of different genotype individuals showed that the transcriptional level of LDLR in liver of different genotypes was significantly different. The expression of LDLR mRNA in liver of AA/CC type pigs was significantly higher than that of GG/TT type (P0.05). There was no significant difference in the expression of LDLR mRNA in muscle. (5) the expression of LDLR gene and carcass. The correlation analysis of meat quality traits showed that the expression of LDLR mRNA in liver was positively correlated with the content of stearic acid in longissimus dorsi muscle (P0.05) and negatively correlated with backfat thickness. The expression of LDLR mRNA in longissimus dorsi muscle was positively correlated with backfat thickness, muscle cholesterol, intramuscular fat, hexadecenoic acid and oleic acid (P0.05), and negatively correlated with stearic acid and linoleic acid in muscle fatty acids (P0.05). The results suggested that LDLRg.12088AG/g.12093CT locus could be used as a candidate genetic marker for blood lipid traits in fair pigs. Porcine LDLR gene may play an important role in the formation of lipid traits, carcass traits and meat quality traits.
【学位授予单位】：安徽农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S828

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本文编号：2300340