辽宁地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因的遗传变异分析

发布时间：2018-11-07 14:31

【摘要】：为研究辽宁地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF5基因的生物学特性及遗传变异情况,通过RT-PCR方法对PRRSV阳性样品的ORF5基因进行扩增,应用DNA Star软件对检测的序列进行比对和遗传变异分析。结果显示,分离的8株PRRSV的ORF5基因全长为603 bp,均属北美型,不同分离株间的核苷酸、氨基酸同源性分别为91.5%~99.0%、88.1%~98.5%;遗传变异分析表明,分离株处于不同的进化分支,但均属于亚群3,为高致病性PRRSV。以上结果表明,辽宁地区主要流行毒株为高致病性PRRSV,在不同地区有不同的PRRSV毒株同时流行,但具有相同的进化来源。
[Abstract]:In order to study the biological characteristics and genetic variation of (PRRSV) ORF5 gene of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (RRSV) in Liaoning province, the ORF5 gene of PRRSV positive samples was amplified by RT-PCR. DNA Star software was used to analyze the sequence alignment and genetic variation. The results showed that the total length of the ORF5 gene of the 8 PRRSV isolates was 603 bp,. The nucleotide and amino acid homology of the 8 isolates were 91.5 ~ 99.0 and 88.51%, respectively. Genetic variation analysis showed that the isolates were in different evolutionary branches, but all belonged to subgroup 3, and were highly pathogenic PRRSV.. The results showed that the main epidemic strains in Liaoning province were high pathogenic PRRSV, different PRRSV strains in different regions, but with the same evolutionary origin.
【作者单位】： 东北农业大学;辽宁省动物疫病预防控制中心辽宁省动物医学研究院;
【基金】：辽宁省自然科学基金指导计划项目(20170540477) 辽宁省农业攻关项目(2015202013)
【分类号】：S852.651

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 沈宪文;李月红;王晓莉;宋德武;宣华;王贵平;母连志;丁壮;;猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株分离鉴定及遗传变异分析[J];中国兽医学报;2010年11期

2 袁小远;金维江;徐怀英;张玉霞;秦卓明;;鸡传染性支气管炎病毒山东株的遗传变异分析[J];山地农业生物学报;2009年02期

3 王金凤;王占峰;韩庆安;孙继国;;河北省2010年猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传变异分析[J];广东畜牧兽医科技;2011年04期

4 刘曙光,丁芳林,肖君泽,周进徐;小麦DNA导入水稻的遗传变异分析[J];湖南农业科学;2000年03期

5 周静;杜冬华;孙继国;;鸡新城疫病毒地方株的分离鉴定及其遗传变异分析[J];中国家禽;2007年10期

6 刘长明;危艳武;张朝霞;袁婧;黄立平;;高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒分离鉴定及其体外传代遗传变异分析[J];中国预防兽医学报;2008年05期

7 闫芳;岳文斌;吉文汇;李绪英;赵宇军;刘娟;刘风波;吴倩;任家琰;化丽珍;;一株鸡传染性支气管炎病毒地方分离株膜蛋白基因的遗传变异分析[J];中国农学通报;2009年12期

8 徐廷川;张亮权;王衡;粟硕;张桂红;;2007-2011年广东省猪圆环病毒2型分离株的遗传变异分析[J];中国兽医科学;2012年03期

9 邓碧亮;黄毓茂;顾万军;;广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的遗传变异分析[J];中国兽医杂志;2009年12期

10 王小敏;何孔旺;张文文;陈蔚;茅爱华;俞正玉;温立斌;倪艳秀;张雪寒;吕立新;郭容利;周俊明;李彬;;2008-2010年中国华东地区PRRSV ORF5基因遗传变异分析(英文)[J];Agricultural Science & Technology;2012年06期

相关会议论文 前6条

1 蒋万春;;猪繁殖与呼吸综合征病毒河北地方株主要基因遗传变异分析[A];“科技进步推进畜牧业现代化”科技论文集[C];2011年

2 刘长明;危艳武;张朝霞;袁婧;黄立平;;高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒分离鉴定及其体外传代遗传变异分析[A];中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第七次研讨会论文集[C];2008年

3 周铁忠;高慎阳;毕聪明;张利勃;高丰;;猪繁殖与呼吸综合征病毒LN/09/z1株的分离鉴定与遗传变异分析[A];中国畜牧兽医学会2010年学术年会——第二届中国兽医临床大会论文集(下册)[C];2010年

4 冷雪;李真光;王凤雪;温永俊;王炜;武华;;猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因遗传变异分析[A];中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十二次人兽共患病学术研讨会暨第六届第十四次教学专业委员会论文集[C];2012年

5 彭海滨;苏润环;潘永飞;宋延华;李玉谷;;2010～2011年广东地区PRRSV Nsp2和ORF5基因的遗传变异分析[A];中国畜牧兽医学会动物解剖学及组织胚胎学分会第十七次学术研讨会论文集（下）[C];2012年

6 王晓梦;牛贝贝;燕贺;高冬生;杨霞;陈陆;常洪涛;赵军;王川庆;;2010-2012年中国猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第八届全国会员代表大会暨第十五次学术研讨会论文集[C];2013年

相关博士学位论文 前1条

1 宋涛;PRRSV遗传变异分析及其nsp2蛋白的定量相互作用组学研究[D];华中农业大学;2016年

相关硕士学位论文 前6条

1 叶超;猪伪狂犬病病毒HeN1株全基因组测序与病毒遗传变异分析[D];中国农业科学院;2015年

2 王中强;志贺菌、猪链球菌和鲍曼不动杆菌分子分型及遗传变异分析[D];中国人民解放军军事医学科学院;2011年

3 李伟娟;猪繁殖与呼吸综合征病毒遗传变异分析及感染后抗体消长规律的研究[D];河南农业大学;2009年

4 粟艳琼;广西鸭圆环病毒遗传变异分析及Cap蛋白的原核表达[D];广西大学;2013年

5 刘彦玲;猪繁殖与呼吸综合征病毒N蛋白的遗传变异分析及间接ELISA检测方法的建立与应用[D];南京农业大学;2012年

6 陈静;重庆市部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5基因的遗传变异分析[D];西南大学;2009年

，

本文编号：2316653