马氏珠母贝STA RDL3基因的克隆与表达性分析

发布时间：2018-11-11 17:25

【摘要】：采用RACE技术克隆获得马氏珠母贝STARDL3基因c DNA全长序列(Pm-STARDL3);利用荧光定量技术检测Pm-STARDL3基因在各个组织中的表达量。结果表明,Pm-STARDL3基因c DNA序列全长3 655 bp,开放阅读框(ORF)长1 491 bp,编码496个氨基酸,5'非翻译区(5'UTR)长110 bp,3'UTR长2 054 bp。PmSTARDL3氨基酸序列同源比对分析显示与华贵类栉孔扇贝(Mimachlamys nobilis)STARDL3的序列的相似度最高。SMART软件分析得出,Pm-STARDL3有STARD类蛋白特有的结构域。荧光定量PCR检测结果表明Pm-STARDL3在肝胰腺中表达量最高,其后依次是外套膜、鳃与闭壳肌,各组织的表达量差异具统计学意义(p0.05)。
[Abstract]:The full-length sequence of STARDL3 gene c DNA (Pm-STARDL3) of Pinctada martensii was cloned by RACE, and the expression of Pm-STARDL3 gene in various tissues was detected by fluorescence quantitative technique. The results showed that the length of c DNA of Pm-STARDL3 gene was 3 655 bp, open reading frame (ORF) 1 491 bp, encoding 496 amino acids and 5 'untranslated region (5'UTR) 110 bp,. Homologous alignment analysis of 3'UTR 2054 bp.PmSTARDL3 amino acid sequence showed the highest similarity with (Mimachlamys nobilis) STARDL3 sequence of chlamys farreri. SMART software analysis showed that Pm-STARDL3 had a unique domain of STARD protein. The results of fluorescence quantitative PCR showed that the expression of Pm-STARDL3 was the highest in hepatopancreas, followed by capillaries, Gill and obturator muscle, and there was significant difference among the tissues (p0.05).
【作者单位】： 广东海洋大学水产学院;广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心;
【基金】：国家自然基金“马氏珠母贝生长性状QTLs精细定位与相关基因功能分析(31372526)” 广东省教育厅项目“珍珠贝良种培育与新型育种模式(GDOU2013050211)” 广东省海洋与渔业局科技专项“马氏珠母贝选系育珠性状测试与示范养殖(A201308A10)”共同资助
【分类号】：Q78;S917.4

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本文编号：2325602