辣椒下胚轴不定根发生相关差异表达基因分析

发布时间：2018-11-14 14:57

【摘要】：为了探析辣椒(Capsicum annuum)下胚轴不定根发生的分子机制,采用转录组学方法研究了不定根发生诱导期和启动期的差异表达基因。结果表明:在AR24/AR0、AR120/AR0和AR120/AR24比较组中分别鉴定到4 991、6 658和4 128个差异表达基因,其中1 321个为3个比较组所共有。对差异表达基因进行GO和KEGG显著性富集分析,发现辣椒下胚轴不定根发生的诱导期主要涉及激素应答、激素信号转导、细胞壁降解与重塑,启动期则是DNA复制、转录与翻译、细胞分裂和细胞壁合成等;纵观两个时期,不定根的发生由生长素、细胞分裂素、乙烯和油菜素内酯相关基因调控,并且与GRAS、AP2、ERF、LBD、SRS、WRKY家族转录因子表达密切相关。由上可知,辣椒下胚轴不定根发生是由一系列信号分子参与且极其复杂的器官发生过程。
[Abstract]:In order to explore the molecular mechanism of adventitious root formation in (Capsicum annuum) Hypocotyl of capsicum, the differentially expressed genes in the induction and initiation of adventitious root formation were studied by transcriptome method. The results showed that the differentially expressed genes were identified in the AR24/AR0,AR120/AR0 and AR120/AR24 comparison groups, respectively. GO and KEGG analysis showed that the induction of adventitious roots in the Hypocotyl of capsicum mainly involved in hormone response, hormone signal transduction, cell wall degradation and remodeling, and DNA replication, transcription and translation during initiation. Cell division and cell wall synthesis; Throughout the two periods, adventitious root formation was regulated by auxin, cytokinin, ethylene and Brassinolactone related genes, and was closely related to the expression of GRAS,AP2,ERF,LBD,SRS,WRKY family transcription factors. It can be concluded that adventitious root formation in the Hypocotyl of capsicum is an extremely complex organogenesis process involving a series of signaling molecules.
【作者单位】： 中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金(31172001) 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-25) 公益性行业(农业)科研专项(201303014) 中国农业科学院科技创新工程项目(CAASASTIP-IVFCAAS)~~
【分类号】：S641.3

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本文编号：2331499