拟南芥与水稻AAAP家族基因的鉴定与比较分析

发布时间：2018-11-19 14:26

【摘要】：AAAP蛋白广泛存在于各种生物中,在生物生长与发育过程中扮演重要作用。本研究基于生物信息学方法对水稻和拟南芥AAAP进行系统剖析,旨在深入认识该家族基因的序列、表达及进化特征。结果显示:拟南芥包括49个AAAP基因,水稻包括71个AAAP基因,这些基因被分为3个类群,细分为13个亚类群;不同类群基因结构和保守基序均显示较高的多样性,亚类群水平基因结构和保守基序显示出较高的保守性,这说明该家族基因具有多样化的功能;进化树末端的同源基因对之间表达情况分化程度较高,但其进化速率具有较高的同质性,这说明同源基因对的分化主要体现在表达变化上。这些结果有助于研究其它植物AAAP家族基因的功能。
[Abstract]:AAAP protein exists widely in various organisms and plays an important role in biological growth and development. Based on bioinformatics, the AAAP of rice and Arabidopsis thaliana were systematically analyzed in order to understand the sequence, expression and evolution of the genes in this family. The results showed that Arabidopsis contained 49 AAAP genes and rice contained 71 AAAP genes. These genes were divided into 3 groups and subdivided into 13 subgroups. The gene structure and conserved motif of different groups showed high diversity, while the subgroup horizontal gene structure and conserved motif showed high conservation, which indicated that the family gene had a variety of functions. The expression of homologous gene pairs at the end of the evolutionary tree was highly differentiated, but its evolution rate was high homogeneity, which indicated that the differentiation of homologous gene pairs was mainly reflected in the change of expression. These results are helpful to study the function of AAAP family genes in other plants.
【作者单位】： 周口师范学院生命科学与农学学院;周口师范学院河南省作物分子育种与生物反应器重点实验室;
【基金】：河南省教育厅项目(17B180009) 周口师范学院2015年度校本项目(ZKNUB215103)共同资助
【分类号】：Q943.2

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本文编号：2342600