绿色杜氏藻不同β-胡萝卜素羟化酶基因家族胁迫应答模式研究

发布时间：2018-11-20 16:45

【摘要】：β-胡萝卜素羟化酶(β-carotenoid hydroxylase,CHYB)是植物类胡萝卜素生物合成途径中的一个重要限速酶。本研究对绿色杜氏藻转录组测序数据进行分析,获得2条β-胡萝卜素羟化酶家族基因chyb1和chyb2。采用染色体步移法分别克隆并获得了绿色杜氏藻chyb1和chyb2基因的启动子序列,全长分别为1080 bp(Gen Bank登录号:KY012338)和1155 bp(Gen Bank登录号:KY012339)。利用Plantcare软件分析两个启动子的顺式作用元件,结果表明绿色杜氏藻chyb1基因启动子含有与甲基茉莉酸、花生四烯酸、水杨酸等非生物胁迫相关的顺式作用元件,而绿色杜氏藻chyb2基因启动子含有与光照相关的顺式作用元件。通过q RT-PCR分析了绿色杜氏藻CHYB基因家族在不同胁迫下的基因表达水平,结果表明该基因家族的基因表达水平与启动子调控相关,且不同的家族基因应答不同的胁迫。
[Abstract]:尾-carotene hydroxylase (尾-carotenoid hydroxylase,CHYB) is an important rate-limiting enzyme in plant carotenoid biosynthesis pathway. In this study, two 尾 -carotene hydroxylase family genes, chyb1 and chyb2., were obtained by analyzing the transcriptome sequencing data of Dunaliella viridis. The promoter sequences of chyb1 and chyb2 genes of Dunaliella viridis were cloned and obtained by chromosome step method. The full length of promoter was 1080 bp (Gen Bank accession number: KY012338) and 1155 bp (Gen Bank accession number: KY012339). The cis-acting elements of two promoters were analyzed by Plantcare software. The results showed that the promoter of chyb1 gene of Dunaliella viridis contained cis-acting elements related to abiotic stress, such as methyljasmonic acid, arachidonic acid, salicylic acid, etc. The promoter of the chyb2 gene of Dunaliella viridis contains cis-acting elements related to light. Q RT-PCR was used to analyze the gene expression level of CHYB gene family of Dunaliella viridis under different stresses. The results showed that the gene expression level of the gene family was related to the regulation of promoter, and different families of genes responded to different stresses.
【作者单位】： 宁波大学海洋学院;
【基金】：浙江省科技厅重点科技创新团队项目(编号:2012R10029-07,2010R50029) 宁波科技攻关项目(编号:2013C10018) 宁波大学优秀学位论文培育基金资助项目(编号:py2014020)资助~~
【分类号】：Q943.2

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：2345434