多穗柯转录组分析及黄酮类化合物合成相关基因的挖掘

发布时间：2018-12-10 07:06

【摘要】：多穗柯具有甜味和保健功效,其中黄酮类化物是主要活性物质。为获取多穗柯转录组数据库以及黄酮类化合物生物合成相关基因,该研究用RNA-Seq中的Illumina Hi Seq 4000对多穗柯嫩叶进行转录组测序,共获得6 Gb数据,拼接后得到41 043条Unigene,与7个基因数据库进行比对,可归类于51个GO分类中,涉及到237个KEGG标准代谢通路。找到黄酮合成相关基因28条。通过Micro Satallite(MISA)软件分析筛选到18 161个SSR,其中单碱基重复最丰富,有7 346个。此研究得到大量转录本信息,为多穗柯的分子生物学研究提供了宝贵的转录组数据库资源。
[Abstract]:Corca polyphylla has sweet taste and health care, of which flavonoids are the main active substances. In order to obtain multipanicle offset transcriptional database and flavonoid biosynthesis related genes, Illumina Hi Seq 4000 in RNA-Seq was used to sequence the transcripts of young leaves. 6 Gb data were obtained and 41 043 Unigene, were obtained after splicing. Compared with 7 gene databases, it can be classified into 51 GO taxonomies, involving 237 KEGG standard metabolic pathways. 28 genes related to flavonoid synthesis were found. 18 161 SSR, were screened by Micro Satallite (MISA) software, among which the single base repeats were the most abundant, there were 7 346. A large number of transcripts were obtained in this study, which provided valuable transcriptome database resources for the molecular biology of Cortex mandshurica.
【作者单位】： 华北理工大学生命科学院;百色学院农业与食品工程学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31570683) 河北省教育厅科研项目(QN2014102) 华北理工大学培育基金项目(SP201508)
【分类号】：S567.19

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 李蜀眉;傅忠实;孙墨溪;田维平;塔娜;;不同提取条件对黄酮类化合物稳定性的影响[J];内蒙古农业大学学报(自然科学版);2010年02期

2 彭程程;王青山;赵国祥;邓放明;;黄酮类化合物的研究进展[J];农产品加工(学刊);2010年05期

3 赵国文;张丽萍;龚靖;白利涛;冯朋;;鱼腥草中黄酮类化合物提取分离方法的研究进展[J];广东农业科学;2011年06期

4 冯朋;张丽萍;白利涛;;银杏中黄酮类化合物提取分离方法研究进展[J];天津农业科学;2012年02期

5 郭芳彬;蜂产品中黄酮类化合物的保健作用[J];养蜂科技;2005年02期

6 石玉平,王永宁,郭珍;沙枣花中黄酮类化合物的提取[J];南京林业大学学报(自然科学版);2005年02期

7 黄峰华;;果产品中黄酮类化合物的开发及应用[J];现代农业科技;2006年09期

8 黄勇;张林;刘利;赵卫国;潘一乐;;桑资源中黄酮类化合物的研究进展[J];蚕桑通报;2006年04期

9 徐爱列;冯瑛;周建青;王永宁;;海娜中黄酮类化合物的提取及含量测定[J];安徽农业科学;2007年11期

10 郭雪峰;岳永德;;黄酮类化合物的提取·分离纯化和含量测定方法的研究进展[J];安徽农业科学;2007年26期

相关会议论文 前10条

1 李大方;;黄酮类化合物的分离分析方法研究[A];中国食品科学技术学会第五届年会暨第四届东西方食品业高层论坛论文摘要集[C];2007年

2 李响;王强;许丹;魏荣卿;刘晓宁;;功能化聚合物吸附树脂对银杏黄酮类化合物的吸附及解析[A];第三届全国化学工程与生物化工年会论文摘要集（下）[C];2006年

3 张文珠;刘霞;温博;蒋生祥;;反相高效液相色谱法测定肾复康胶囊中的黄酮类化合物[A];甘肃省化学会成立六十周年学术报告会暨二十三届年会论文集[C];2003年

4 刘芳芳;;黄酮类化合物药理作用研究进展[A];第九届全国药用植物及植物药学术研讨会论文集[C];2010年

5 王启发;程青芳;许冰;;从蜂胶中提取黄酮类化合物的研究[A];2005年中国养蜂学会蜜蜂产品专业委员会、蜜蜂保护专业委员会、蜜蜂授粉专业委员会联合工作会议和学术研讨会论文集[C];2005年

6 向德标;李新鑫;谭娟;皮建辉;;多穗柯黄酮类化合物对离体蛙心收缩特性影响研究[A];湖南省生理科学会2013年度学术年会论文摘要汇编[C];2013年

7 冯翠萍;庞侯英;王晓闻;程俊丽;刘喜文;;芦笋皮中黄酮类化合物的提取、纯化工艺的研究[A];中国青年农业科学学术年报[C];2004年

8 王远明;胡华英;郁威;;洋葱皮中黄酮类化合物的提取工艺研究[A];上海市化学化工学会2005年度学术年会论文摘要集[C];2005年

9 奚菊群;郭荣;;分子有序组合体中黄酮类化合物的抗氧化性能研究[A];第五届全国化学生物学学术会议论文摘要集[C];2007年

10 张沐新;杨晓虹;周小平;;高效液相色谱法在黄酮类化合物分析中的应用[A];“加入WTO和科学技术与吉林经济发展——机遇·挑战·责任”吉林省第二届科学技术学术年会论文集（下）[C];2002年

相关重要报纸文章 前5条

1 刘 斌;黄酮类化合物--中药化学（十四）[N];中国中医药报;2004年

2 刘 斌;黄酮类化合物——中药化学（十五）[N];中国中医药报;2004年

3 刘 斌;黄酮类化合物——中药化学（十六）[N];中国中医药报;2004年

4 中国农业科学院蔬菜花卉研究所研究员 张德纯;类黄酮 血管的保护神[N];健康报;2007年

5 本报记者 刘红兵;甜蜜事业打造甜蜜生活[N];中国食品质量报;2005年

相关博士学位论文 前10条

1 张慧荣;长叶红砂黄酮类化合物合成相关基因功能分析及其对逆境胁迫的响应[D];内蒙古大学;2016年

2 郭蒙;几种黄酮类化合物与核酸的相互作用及分析应用[D];中国矿业大学;2016年

3 雷光清;1，2，，4-三嗪类化合物和氮杂黄酮类化合物的研究[D];北京医科大学;1989年

4 朱华;拳卷地钱中黄酮类化合物的分离纯化、结构表征及生物活性研究[D];中南大学;2004年

5 王学军;系列黄酮类化合物的合成以及生物活性评价[D];西北大学;2012年

6 席军;高压加工技术在蜂胶黄酮类化合物提取中的应用研究[D];吉林大学;2005年

7 刘国柱;中药中黄酮类化合物全定性分析策略[D];湖南师范大学;2010年

8 李O

本文编号：2370173