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绵刺肌动蛋白基因的分离及特性分析

发布时间:2018-12-10 23:23
【摘要】:本研究采用兼并PCR(polymerase chain reaction)和RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术分离了绵刺(Potaninia mongolica Maxim.)肌动蛋白基因(Actin,Pm Actin)c DNA序列,该序列包含有1 134 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码377个氨基酸,预测蛋白分子量为41.8 k D,理论等电点为5.48;基因组DNA序列长度为1 134 bp,无内含子。该序列与其他植物Actin的一致性较高,核苷酸均高于88%,氨基酸则均高于96%。系统进化分析显示:Pm Actin与同属蔷薇科的草莓、碧桃,扁桃和蔷薇及葡萄科的葡萄Actin蛋白聚为一个亚类,与草莓Actin蛋白亲缘关系最为接近。RT-PCR分析显示,该基因在根、茎、叶中的表达量无明显变化,该结果验证了Pm Actin基因可作为分子内标的可靠性,为深入开展该植物的分子生物学研究提供理论依据。
[Abstract]:In this study, (Potaninia mongolica Maxim.) was separated by merging PCR (polymerase chain reaction) and RACE (rapid amplification of cDNA ends) techniques. Actin gene (Actin,Pm Actin) c DNA sequence, which contains an open reading frame (open reading frame,ORF of 1 134 bp), encodes 377 amino acids, the predicted molecular weight is 41.8 KD and the theoretical isoelectric point is 5.48; The length of genomic DNA sequence was 1 134 bp, without intron. The sequence was consistent with other plant Actin, the nucleotides were higher than 88 and amino acids were higher than 96. Phylogenetic analysis showed that: Pm Actin was clustered into a subclass of Actin protein of strawberry, bisporus, almond, rose and grape family, which was most closely related to Actin protein of strawberry. RT-PCR analysis showed that the gene was located in root and stem. There was no significant change in the expression of Pm Actin gene in leaves, which confirmed the reliability of Pm Actin gene as a molecular marker, and provided a theoretical basis for the further study of molecular biology of the plant.
【作者单位】: 内蒙古大学生命科学学院;
【基金】:国家自然科学基金项目(31360063) 内蒙古科技计划项目(20140707)共同资助
【分类号】:Q946.1

【参考文献】

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本文编号:2371402

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