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细毛羊皮肤毛囊不同发育时期miR-1298-5p靶基因预测及验证

发布时间:2019-06-14 04:01
【摘要】:为了探讨miR-1298-5p及其靶基因与细毛羊毛囊生长发育的关系,以细毛羊不同发育时期皮肤毛囊组织为材料,通过生物信息学方法预测miR-1298-5p的靶基因,采用RT-PCR对miR-1298-5p与其潜在靶基因FGF_2进行核酸水平相对定量检测,利用Western Blot对潜在靶基因FGF_2进行蛋白相对定量检测。生物信息学预测结果表明,FGF_2的3'UTR存在miR-1298-5p种子区结合位点;miR-1298-5p在皮肤毛囊不同发育时期呈现差异性表达;miR-1298-5p与其潜在靶基因之间呈现一种负调控趋势,说明miR-1298-5p可能通过负调控FGF_2从而调控皮肤毛囊生长发育。表明结合靶基因预测结果、miR-1298-5p在核酸水平表达规律及FGF_2在核酸水平表达规律和蛋白表达水平表达规律初步确定FGF_2为miR-1298-5p的靶基因。
[Abstract]:In order to investigate the relationship between miR-1298-5p and its target genes and the growth and development of fine wool sheep hair follicles, the target genes of miR-1298-5p were predicted by bioinformatics methods. The nucleic acid levels of miR-1298-5p and its potential target gene FGF_2 were detected by RT-PCR, and the proteins of potential target gene FGF_2 were detected by Western Blot. The results of bioinformatics prediction showed that there were miR-1298-5p seed region binding sites in 3'UTR of FGF_2, differential expression of miR-1298-5p in different developmental stages of skin hair follicles, and a negative regulatory trend between miR-1298-5p and its potential target genes, indicating that miR-1298-5p may regulate the growth and development of skin hair follicles through negative regulation of FGF_2. The results showed that FGF_2 was identified as the target gene of miR-1298-5p at nucleic acid level and FGF_2 at nucleic acid level and protein expression level combined with the prediction results of target gene.
【作者单位】: 长春科技学院动物科学技术学院;吉林农业大学动物科学技术学院;
【基金】:吉林省教育厅项目(2015566)
【分类号】:S826

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本文编号:2499079

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