直肠癌循环肿瘤细胞与原发肿瘤组织基因表达谱的差异分析

发布时间：2019-08-28 12:50

【摘要】：目的:通过直肠癌循环肿瘤细胞(circulating tumor cell,CTC)与原发肿瘤组织基因表达谱的差异分析,筛选直肠癌CTC的特异性基因。方法:选取2015年9月至2015年12月福建省肿瘤医院收治的直肠癌患者4例,取肿瘤组织和相应的癌旁组织并采集外周血20 ml。应用流式细胞术检测血液CTC,抽提癌组织和CTC的总RNA,采用人全转录组表达谱芯片检测CTC及相应肿瘤组织mRNA表达谱,经聚类分析筛选CTC特异性基因,并采用生物分子注释系统MAS软件对其进行基因功能及其相关的信号通路分析。结果:4例直肠癌患者检测到CTC数目分别是67、78、53和120个。筛选出肿瘤与癌旁组织差异基因共7 755个、CTC与白细胞差异基因共567个,肿瘤组织及CTC差异基因交集后共同上调或下调的特异性基因共36个,其中上调16个、下调20个(P0.05或P0.01)。CTC特异性基因与肿瘤转移和干细胞功能有关,涉及与细胞转移、干细胞功能和免疫功能相关的22条信号通路。结论:CTC与原发肿瘤基因相比,具有独特的表达谱,是肿瘤复发和转移的重要基础。
【图文】：

tp://bioinfo．capitalbio．com/mas3/)软件进行GO(GeneOntology)分析，其中MAS系统包括3个公共数据库:MolecularFunction、BiologicalProcess和CellularComponent，从而探讨差异基因的功能以及可能涉及的相关信号通路。1．7统计学处理采用SPSS19．0统计学软件，两组数据比较采用非配对t检验，以P＜0．05或P＜0．01表示差异有统计学意义。2结果2．1成功检测出直肠癌CTC入选病例一般资料及检测CTC数见表1。利用流式细胞术检测CTC(DAPI+/CD45/Epcam+)和白细胞对照(DAPI+/CD45－/Epcam－)见图1，4例患者检测出CTC数量为53～120个。表1入选病例一般资料和分选CTC个数Tab．1ClinicalfeaturesandsortedCTCnumberofthe4patientswithrectalcancerNo．SexAge(t/a)PathologicaltypeGradingandStaging(WHO2010)CTCnumber1Male44ModeratelydifferentiatedulcerativeadenocarcinomaofrectumpT3N1M0，ⅢB672Male59SameasabovepT3N0M0，ⅡA783Female60SameasabovepT2N0M0，Ⅰ534Female66SameasabovepT2N1cM0，ⅢA120图1流式细胞仪检测和分选CTCFig．1IdentificationandsortingofCTCsbyflowcytometry2．2直肠癌组织及血液CTC中部分基因表达明显上调或下调2．2．1肿瘤组织及血液CTC基因芯片散点分布散点图(图2)中肿瘤组织用T表示，癌旁正常组织用N表示，CTC用C表示，白细胞用W表示。散点图分别展示了T/N和C/W样品之间基因表达的差异情况。其中X轴和Y轴分别以荧光信号强度为坐标，图中每个点代表芯片上一个探针集(基因)的荧光信号强度，其中标注为红色的分别是T/N和C/W发生上调的基因，标注为绿色的是T/N和C/W发生下调的基因，标注为黑色的是表达无差异基因。A:Ｒectalcarcinomaandnormalintestinaltis

sandsortedCTCnumberofthe4patientswithrectalcancerNo．SexAge(t/a)PathologicaltypeGradingandStaging(WHO2010)CTCnumber1Male44ModeratelydifferentiatedulcerativeadenocarcinomaofrectumpT3N1M0，ⅢB672Male59SameasabovepT3N0M0，ⅡA783Female60SameasabovepT2N0M0，Ⅰ534Female66SameasabovepT2N1cM0，ⅢA120图1流式细胞仪检测和分选CTCFig．1IdentificationandsortingofCTCsbyflowcytometry2．2直肠癌组织及血液CTC中部分基因表达明显上调或下调2．2．1肿瘤组织及血液CTC基因芯片散点分布散点图(图2)中肿瘤组织用T表示，癌旁正常组织用N表示，CTC用C表示，，白细胞用W表示。散点图分别展示了T/N和C/W样品之间基因表达的差异情况。其中X轴和Y轴分别以荧光信号强度为坐标，图中每个点代表芯片上一个探针集(基因)的荧光信号强度，其中标注为红色的分别是T/N和C/W发生上调的基因，标注为绿色的是T/N和C/W发生下调的基因，标注为黑色的是表达无差异基因。A:Ｒectalcarcinomaandnormalintestinaltissues(T/N);B:CTCsandwhitecells(C/W)图2直肠癌组织与血液CTC细胞表达谱散点图Fig．2ScatterplotofbothrectalcancertissuesandbloodCTCsexpressionprofile2．2．2聚类分析显示直肠癌组织与CTC的基因表达谱差异较大根据4例样品表达模式的相关性用Cluster3．0软件进行聚类分析，TreeView绘制聚类图(图3)。直肠癌组织与正常肠组织、CTC与白细胞各组之间均聚类良好;组织(T和N)与细胞(C和W)这两大组的表达谱差异很大，大于单独T/N或·350·
【作者单位】： 福建医科大学附属肿瘤医院福建省肿瘤医院国家临床重点肿瘤专科福建省肿瘤生物治疗重点实验室;
【基金】：福建省医学创新基金资助项目(No.2015-CXB-4) 福建省自然科学基金资助项目(No.2016J01436) 国家临床重点专科建设基金资助项目(No.2015-544)~~
【分类号】：R730.231;;R735.3

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 李帅;刘晓强;;循环肿瘤细胞的检测[J];医学综述;2010年06期

2 曹璐;徐文;殷正丰;;循环肿瘤细胞分离与检测[J];第二军医大学学报;2010年03期

3 董印军;宋平平;张百江;张为迪;;肺癌患者外周血循环肿瘤细胞检测的研究进展[J];中国肺癌杂志;2009年05期

4 周晴接;杨建民;;循环肿瘤细胞研究进展[J];世界华人消化杂志;2010年11期

5 平伟;付向宁;;肺癌循环肿瘤细胞临床应用的研究进展[J];中国肺癌杂志;2011年06期

6 马琼;周勇;裘秀春;;循环肿瘤细胞自激注入的研究进展[J];现代肿瘤医学;2011年06期

7 周长春;范传波;宋现让;;循环肿瘤细胞的检测和应用[J];分子诊断与治疗杂志;2012年01期

8 宋英健;王正;杨林;;肺癌循环肿瘤细胞的研究进展[J];中国肺癌杂志;2012年10期

9 李慧;崔洪霞;程颖;;循环肿瘤细胞在肺癌中的研究进展[J];中国肺癌杂志;2012年11期

10 ;从400多亿个血细胞中揪出1个循环肿瘤细胞[J];山东中医药大学学报;2012年06期

相关会议论文 前10条

1 陈倩;崔巍;戈烽;林平;;循环肿瘤细胞和肺癌TNM分期的相关性研究[A];中华医学会第九次全国检验医学学术会议暨中国医院协会临床检验管理专业委员会第六届全国临床检验实验室管理学术会议论文汇编[C];2011年

2 宋彦龄;安源;张薇婷;朱志;俞春东;杨朝勇;;循环肿瘤细胞捕获检测新方法[A];中国化学会第28届学术年会第3分会场摘要集[C];2012年

3 马丽;文仲光;;循环肿瘤细胞的检测及其在肺癌患者中的临床应用[A];中国肿瘤内科进展 中国肿瘤医师教育（2014）[C];2014年

4 张品南;许杨扬;杨小敏;;血循环肿瘤细胞研究进展[A];2008年浙江省病理学学术年会论文汇编[C];2008年

5 彭佳茜;白林灵;赵琼;杨延莲;王琛;;基于多肽的循环肿瘤细胞富集与检测研究[A];中国化学会第29届学术年会摘要集——第35分会：纳米生物医学中的化学问题[C];2014年

6 梅林航;;循环肿瘤细胞在乳腺癌中的应用[A];2013年浙江省外科学学术年会论文汇编[C];2013年

7 黄士昂;胡艳洁;范灵灵;刘伟;李欣;郑金娥;贺艳丽;;运用多参数流式细胞计数监测乳腺癌Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ和Ⅳ期病人外周血中的循环肿瘤细胞及对其预后的评估[A];第12届全国实验血液学会议论文摘要[C];2009年

8 任传利;韩崇旭;薛小平;朱小平;吕炜;周林;;胰腺癌外周血凋亡循环肿瘤细胞的检测和辅助治疗敏感性的关系[A];中华医学会第七次全国中青年检验医学学术会议论文汇编[C];2012年

9 陈晓霞;任胜祥;李雪飞;张玲;李玮;周菲;高广辉;李帅;周彩存;;循环肿瘤细胞在肺癌诊断中的作用[A];第13届全国肺癌学术大会论文汇编[C];2013年

10 杨卓;付静轩;王斐;崔巍;;外周血循环肿瘤细胞的特性及其检测分析的研究进展[A];中华医学会第七次全国中青年检验医学学术会议论文汇编[C];2012年

相关重要报纸文章 前7条

1 江苏省人民医院肿瘤科主任医生 殷咏梅;循环肿瘤细胞检测防癌症复发[N];健康报;2012年

2 刘海英;循环肿瘤细胞具有“自激注入”能力[N];科技日报;2009年

3 记者 王雪飞;从400多亿个血细胞中揪出1个循环肿瘤细胞[N];健康报;2012年

4 刘海英;“捕蝇纸”型循环肿瘤细胞检测装置问世[N];科技日报;2009年

5 刘海英;上皮间质转化基因可用于检测循环肿瘤细胞[N];科技日报;2009年

6 张中桥;EGFR mRNA可用于乳癌循环肿瘤细胞检测[N];中国医药报;2005年

7 闻谊;美评出年度十大医疗技术创新[N];中国医药报;2009年

相关博士学位论文 前10条

1 方主亭;肝癌动脉栓塞对循环肿瘤细胞的影响及机制实验与临床研究[D];复旦大学;2014年

2 孙文洁;循环肿瘤细胞及功能影像在预测和评估直肠癌放化疗疗效方面的研究[D];复旦大学;2014年

3 黄文涛;胆道肿瘤循环肿瘤细胞的检测及基因组扩增[D];福建医科大学;2015年

4 马燕春;过滤装置与腺病毒相结合捕获活的循环肿瘤细胞的研究[D];西北农林科技大学;2015年

5 沈庆林;适配子修饰的纳米基底特异性捕获和释放循环肿瘤细胞研究[D];武汉大学;2013年

6 朱融融;应用循环肿瘤细胞解析胰腺癌上皮—间质转化全程及其临床意义探究[D];北京协和医学院;2016年

7 唐文博;微流控芯片分离胰腺癌患者循环肿瘤细胞的基础实验及其临床应用[D];中国人民解放军医学院;2016年

8 王其美;益气化瘀解毒方对结直肠癌循环肿瘤细胞干预作用的研究[D];湖南中医药大学;2016年

9 秦英刚;循环肿瘤细胞与中、西医治疗肺癌患者疗效及预后的相关性研究[D];北京中医药大学;2013年

10 刘道永;肝细胞癌病人外周血中循环肿瘤细胞的检测和临床意义[D];复旦大学;2007年

相关硕士学位论文 前10条

1 吴志清;结直肠癌外周血循环肿瘤细胞检测的临床诊疗价值研究[D];福建医科大学;2015年

2 宋云飞;循环肿瘤细胞对晚期乳腺癌预后影响的初步探究[D];福建中医药大学;2015年

3 阴丽媛;循环肿瘤细胞新型检测方法的建立及其在临床样本中的应用[D];北京协和医学院;2015年

4 真德智;非小细胞肺癌患者术后辅助治疗期间外周血循环肿瘤细胞EpCAM表达水平监测的临床意义[D];北京市结核病胸部肿瘤研究所;2015年

5 朱玲;免疫磁珠法富集肺癌循环肿瘤细胞及临床意义研究[D];昆明医科大学;2015年

6 张亮;乳腺癌不同表型循环肿瘤细胞的检测及其临床意义[D];河北医科大学;2015年

7 董超群;羧酸甜菜碱两性聚合物功能化尼龙导管及其捕获循环肿瘤细胞的研究[D];南京大学;2015年

8 罗小辉;循环肿瘤细胞快速自动识别研究[D];西安电子科技大学;2014年

9 刘敏;吖啶橙荧光染色法检测肾癌循环肿瘤细胞及其临床意义[D];天津医科大学;2015年

10 李浩;食管鳞癌患者外周血循环肿瘤细胞检测及临床意义的研究[D];济南大学;2015年

本文编号：2530150