大葱蜡质相关基因AfCER1和AfKCS6的克隆与表达分析
发布时间:2019-09-09 20:58
【摘要】:大葱(Allium fistulosum)是我国传统的蔬菜和调味品之一,其叶片表面覆盖有明显的蜡质层,本课题组发现一株大葱少蜡突变体,是研究蜡质合成机制的较好材料。本项目组前期开展了大葱表皮转录组分析,筛选出了两个与蜡质合成相关的基因AfCER1和AfKCS6。本文以野生型和突变型大葱为实验材料,结合形态学、生物信息学、生理生化学对蜡质代谢特性进行研究,旨在为大葱蜡质合成的分子机制提供理论基础。主要的结果如下:1.扫描电镜可以观察到野生型大葱的叶表面覆盖有尖状晶体,突变型中未发现蜡质晶体;野生型的株高、茎粗、蒸腾速率、及单位面积上的气孔数高于突变型;野生型的叶绿素含量,净光合速率低于突变型。2.利用RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术获得AfCER1(Allium fistulisum CER1)的全长cDNA序列,并通过生物信息学手段分析基因的序列;利用RT-PCR和Real-time PCR分析AfCER1基因在大葱野生型和突变型植株中的空间表达模式。实验结果表明,AfCER1基因全长为2144bp,包含一个1857 bp完整的开放阅读框(ORF),编码618个氨基酸。AfCER1与其他物种的CER1具有相似结构域:脂肪酸羟化酶结构域和WAX2-C结构域。AfCER1基因在大葱的根、叶鞘、叶片等部位均有表达,且在野生型和突变型植株中的表达量有差异。在大葱的根和叶鞘及刚见光的叶片中,AfCER1在突变型植株中的表达量相对野生型少,而在见光较多的叶片部位,AfCER1在突变型植株中的表达量却比野生型多。3.野生型和突变型大葱中克隆得到的AfKCS6序列存在差异性碱基,但预测的氨基酸序列是相同的。基因全长包含一个1491bp完整的开放阅读框(ORF),编码497个氨基酸。AfKCS6基因在大葱叶片部位显著表达,且在野生型和突变型植株的叶片部位表达量也有显著性差异,野生型明显高于突变型。4.将大葱蜡质相关基因AfKCS6克隆至原核表达载体PET-28a上,重组质粒命名为PET28a-AfKCS6。
【图文】:
大葱蜡质相关基因4/a:化/和4/KCS6的克隆与表达分析:(3-径憸-ACP脱水生成反式-A2-Zf憸-ACP(trans-A2-enoyl-ACI>)脱水酶催化;(4)还原反应:由反式-A2-赌憸-ACP还原酶催化反增加了邋2个碳的憸基-ACP。每次反应增加两个碳原子,直到合成C再由憸基-ACP硫解酶(acyl-ACPthioesterase,FATB)催化裂解憸C16或C18脂肪酸["]。质体内有S种很重要的脂肪酸合成2-C4)[i9]、KASI(C4-C16)和邋KASII(C16邋—邋C18)[气其中有几个特异性,在质体内的多酶复合物中都存在PN。逡逑酸的延伸及各种衍生物的合成逡逑长链脂肪酸(VLCFAs)的合成逡逑C18逡逑
质成分可W跨过细胞壁到法表皮。有研究表明当蜡质成分穿过角质层后,,会有目的逡逑的到达蜡质晶体的合成位点,进一步装配成各种晶体,因此蜡质成分被运输到表皮逡逑区域后,就会表现出一个自我组织的系统[56](图1.2)。逡逑f逦V\逦Cytoplasm逦、-逡逑-逦图1.2蜡质运输途径【巧]逡逑Figure邋1邋.2邋The邋transport邋of邋wax逡逑1.3蜡质相关基因的研究进展逡逑目前关于表皮蜡质研究还是挺多的,随着蜡质合成相关基因被陆续克隆成功,逡逑蜡质合成过程也渐渐清晰,在合成的过程中有很多的基因都非常重要。逡逑有证据表明,在植物中可能存在多个延伸酶对不同的链的长度有不同的特异性,逡逑产生不同链长的VLCFAs口2]。KCR,HCD和ECR酶具有广泛的底物特异性且可W共逡逑享所有FAE复合物特异性口4]。因此,在拟南芥基因组中21个KCS已被注释[57],但逡逑5逡逑
【学位授予单位】:山西大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S633.1;Q943.2
本文编号:2533842
【图文】:
大葱蜡质相关基因4/a:化/和4/KCS6的克隆与表达分析:(3-径憸-ACP脱水生成反式-A2-Zf憸-ACP(trans-A2-enoyl-ACI>)脱水酶催化;(4)还原反应:由反式-A2-赌憸-ACP还原酶催化反增加了邋2个碳的憸基-ACP。每次反应增加两个碳原子,直到合成C再由憸基-ACP硫解酶(acyl-ACPthioesterase,FATB)催化裂解憸C16或C18脂肪酸["]。质体内有S种很重要的脂肪酸合成2-C4)[i9]、KASI(C4-C16)和邋KASII(C16邋—邋C18)[气其中有几个特异性,在质体内的多酶复合物中都存在PN。逡逑酸的延伸及各种衍生物的合成逡逑长链脂肪酸(VLCFAs)的合成逡逑C18逡逑
质成分可W跨过细胞壁到法表皮。有研究表明当蜡质成分穿过角质层后,,会有目的逡逑的到达蜡质晶体的合成位点,进一步装配成各种晶体,因此蜡质成分被运输到表皮逡逑区域后,就会表现出一个自我组织的系统[56](图1.2)。逡逑f逦V\逦Cytoplasm逦、-逡逑-逦图1.2蜡质运输途径【巧]逡逑Figure邋1邋.2邋The邋transport邋of邋wax逡逑1.3蜡质相关基因的研究进展逡逑目前关于表皮蜡质研究还是挺多的,随着蜡质合成相关基因被陆续克隆成功,逡逑蜡质合成过程也渐渐清晰,在合成的过程中有很多的基因都非常重要。逡逑有证据表明,在植物中可能存在多个延伸酶对不同的链的长度有不同的特异性,逡逑产生不同链长的VLCFAs口2]。KCR,HCD和ECR酶具有广泛的底物特异性且可W共逡逑享所有FAE复合物特异性口4]。因此,在拟南芥基因组中21个KCS已被注释[57],但逡逑5逡逑
【学位授予单位】:山西大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S633.1;Q943.2
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1 奥娜;大葱蜡质相关基因AfCER1和AfKCS6的克隆与表达分析[D];山西大学;2016年
本文编号:2533842
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