基于实时荧光定量PCR分析的北柴胡内参基因的筛选及验证

发布时间：2019-10-29 11:25

【摘要】：目的筛选出在北柴胡不同生长时期及不同器官中表达均稳定的内参基因并进行验证。方法利用实时荧光定量PCR获得18个候选内参基因所有Ct值,通过3种不同算法(Bestkeeper、Norm Finder、Ge Norm)的软件对内参基因稳定性进行分析,采用皮尔森相关系数(Pearson correlation coefficient)分析3个软件给出的稳定性排名结果。结果所有候选内参基因的Ct值相对宽泛,ADF1b、ADF5、ADF7、e IF2b和ACT2为最为合适的内参基因,而e IF6被认为稳定性最差的内参基因。3个软件计算结果均呈现显著性相关。结论采用实时荧光定量PCR结合3种不同算法进行北柴胡内参基因的筛选及验证是可行的。在北柴胡柴胡分子遗传研究中,发掘到的内参基因对目的基因进行均一化处理有助于提高目的基因表达分析的精确性及可信度。
【作者单位】： 西南科技大学生命科学与工程学院
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81603223) 四川省“十三五”育种攻关(2006NYZ0036-4-2) 四川省科技扶贫专项(2016NZYZF0071)
【分类号】：Q943.2;S567.79

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本文编号：2553508