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马铃薯CDPKs家族基因的全基因组鉴定和分析

发布时间:2020-01-30 14:04
【摘要】:钙离子是真核生物信号转导中重要的第二信使。在植物中,细胞内Ca2+的水平受到多种因素的影响,包括激素水平、光信号、物理损伤、非生物胁迫和病原菌侵染。在植物中,CDPKs代表具有蛋白激酶和钙调蛋白两种结构域的一类新型的Ca2+传感器。CDPKs可以直接与钙离子结合,它们的激酶活性不依赖于钙调素蛋白。对马铃薯CDPKs家族进行全基因组分析,发现马铃薯基因组中共有21个CDPKs基因,这些基因都有CDPKs关键的结构域。马铃薯CDPKs基因不均等地分布在各个染色体上,其中一号和十号染色体最多。而且一号和十号染色体上的基因亲缘关系非常近,可能来源于基因扩增。我们的研究有助于积累马铃薯的基因资源,推动马铃薯育种进程。
【图文】:

马铃薯,结构域,等电点,分子量


78535509分子量Molecularmass64626.4167601.1660004.6157665.8763596.5264172.5860960.6656374.2556453.5561050.8657847.7163366.6960369.4759424.7068348.0370172.7356997.0558971.0264801.7159662.6656625.80等电点Isoelectricpoint5.715.426.445.239.349.015.405.025.695.975.795.565.315.955.585.175.495.775.355.446.07EFh结构域数目EFhdomainnumber444344444444444444444图1马铃薯CDPKs基因的结构分析Figure1GenestructureofSolanumtuberosumCDPKsgenes4345

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