紫薇叶片转录组分析及叶绿素和类胡萝卜素等途径基因的鉴定

发布时间：2020-02-18 12:26

【摘要】：应用新一代高通量测序技术,对紫薇金叶突变体的叶片进行转录组测序和生物信息学分析。本研究中共组装获得45 308条unigenes,平均长度987.51 bp。21 339(47.10%)条可以匹配到蛋白数据库获得注释信息。Unigenes在各数据库中注释的基因数分别为:在COG数据库中有11 512(25.41%)条,在GO数据库中有12 196条(26.92%),在KEGG数据库中有5 709条(27.73%)。通过与NCBI和Uniprot蛋白数据库的比对,共22条叶绿素代谢相关基因和17条类胡萝卜素代谢相关基因被鉴定出来,为突变体基因的筛选提供了候选基因。

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 韦海忠;延安发现无籽辣椒突变体[J];长江蔬菜;1996年04期

2 王聪田,向佐湘;宫川高糖早熟辐射突变体的初步研究[J];浙江柑桔;1998年01期

3 赵心爱,薛庆中;利用番茄突变体进行功能基因组学研究[J];生命科学;2003年04期

4 张焕丽;韩建明;郭晋太;黄江涛;朱永;杨爱国;张俊平;郭瑛;;辣椒黄绿苗突变体9906M的选育及遗传机理研究[J];中国瓜菜;2006年01期

5 郭士伟,张云华,金永庆,师素云,谭秀云,刘蔼民;小白菜(Brassica chinensis L.)黄苗突变体的叶绿素荧光特性[J];作物学报;2003年06期

6 张玉,许向阳,李景富;番茄成熟突变体果实贮藏过程中细胞超微结构的变化[J];园艺学报;2005年04期

7 李景富;孟凡娟;许向阳;康立功;;番茄“白化”突变体的发现及作为育种材料的鉴定[J];园艺学报;2006年02期

8 李景富;徐磊;张贺;许向阳;赵越;齐风坤;;番茄黄化突变体叶片蛋白双向电泳技术体系的优化[J];东北农业大学学报;2014年04期

9 苗晗;顾兴芳;张圣平;王晓武;;蔬菜叶色突变体研究进展[J];中国蔬菜;2007年06期

10 范曾丽;王三根;张秀丽;杨军;;凤仙花花逆转突变体光合特性研究[J];西南大学学报(自然科学版);2014年09期

相关会议论文 前7条

1 李鹏丽;王宁宁;;微型番茄黄叶突变体的获得与鉴定[A];中国植物生理学会第十次会员代表大会暨全国学术年会论文摘要汇编[C];2009年

2 方智远;刘玉梅;杨丽梅;庄木;张扬勇;孙培田;;甘蓝突变体材料的初步研究[A];中国园艺学会十字花科蔬菜分会第十届学术研讨会论文集[C];2012年

3 吴永杰;李玉生;吴亚琴;赵艳华;程禾禾;;苹果离体诱变及突变体快速检测技术研究[A];2008年园艺植物染色体倍性操作与遗传改良学术研讨会论文摘要集[C];2008年

4 王波;贾定洪;高俭;鲜灵;唐利民;;毛木耳突变体菌株的遗传差异与产量分析[A];第十届全国食用菌学术研讨会论文汇编[C];2014年

5 叶春海;粱元冈;;柑桔无核突变体的同工酶分析研究[A];中国园艺学会成立六十周年纪念暨第六届年会论文集（Ⅰ果树）[C];1989年

6 吴飞宏;曾涛;曾会才;;尖孢镰刀菌古巴专化型4号小种T-DNA插入突变体Focr4-1562及其基因敲除子的生物学表型研究[A];2011年海南省微生物学会学术年会论文汇编[C];2011年

7 杨冲;方智远;张扬勇;刘玉梅;杨丽梅;庄木;孙培田;;甘蓝叶色黄化突变体的发现和叶色遗传的初步分析[A];中国园艺学会2012年学术年会论文摘要集[C];2012年

相关博士学位论文 前1条

1 Syed Noor Muhammad Shah;黄瓜品系9930诱导突变体的研究[D];西北农林科技大学;2015年

相关硕士学位论文 前10条

1 谷慧英;芥菜开花整合子SOC1与开花抑制因子SVP、FLC蛋白相互作用[D];西南大学;2015年

2 贾彦彦;离子注入诱变莲花突变体的鉴定及分子机理初探[D];河南师范大学;2011年

3 谢璐;低能N~+离子注入诱变的凤仙花突变体组织培养及其诱变机制分析[D];河南师范大学;2011年

4 胡丽丽;黄瓜“银杏叶”突变体遗传规律及生理特性的研究[D];山东农业大学;2014年

5 王静静;杂交兰矮化突变体形态及相关生理生化特性分析[D];南京农业大学;2014年

6 张丽丽;柿树炭疽菌突变体致病性及相关基因的克隆[D];浙江大学;2008年

7 陈云云;番茄黄果突变体果实的基因差异表达研究[D];海南大学;2013年

8 许爱娇;西瓜矮小突变体dsh的突变类型和相关机理的研究[D];河南大学;2015年

9 马志虎;辣椒黄绿苗突变体特异种质应用研究[D];南京农业大学;2005年

10 豆玉娟;‘幸香’草莓白肉突变体与野生型花色素相关基因表达及序列分析[D];沈阳农业大学;2014年

，

本文编号：2580708