IBS-D肝郁脾虚证候特点与脑肠神经递质基因多态性的相关性研究

发布时间：2020-05-28 12:31

【摘要】：目的:本研究收集IBS-D肝郁脾虚证患者血清及临床信息,通过全外显子高通量测序技术进行全外显子测序,运用生物信息分析技术进行多步骤的比对过滤,以期筛选出IBS-D肝郁脾虚证患者脑肠神经递质相关的易感基因,为下一步基因多态性研究提供依据;同时通过基因注释筛选出IBS-D肝郁脾虚证患者脑肠神经递质相关的多态性基因,分析多态性基因与IBS-D疾病特征及肝郁脾虚证候特征的相关性。方法:临床纳入IBS-D肝郁脾虚证患者,收集并填写临床信息和资料,采集患者外周静脉血,提取外周血DNA,运用全外显子捕获技术进行高通量基因测序,测序结果与人类参考基因组序列(UCSC hg19)进行比对过滤,运用基因注释软件(ANNOVAR软件)对结果进行注释,筛选出与神经递质相关的基因,进一步参考基因频率注释数据库(1000 Genomes Project、ExAC数据库)筛选单核苷酸多态性(SNP)基因,整合外显子区域的非同义变异基因,筛选本病患者的易感基因,同时通过线性回归方法分析非共有基因多态性与IBS-D疾病特征及肝郁脾虚证候特点的相关性。结果:1.一般情况:本研究共纳入10例肝郁脾虚型IBS-D患者,其中男性5人,女性5人,平均年龄为29±9.888岁,平均病程为49.5±71.320月,平均BMI值为20.72±2.84。2.反复比对过滤测序结果,得到与神经递质相关的基因共5507个,符合SNP的有5117个,其中外显子区域非同义变异基因有94个,整合后共筛选出18个共有基因及76个非共有的多态性基因,其中共有的18个基因分别为:rs12437941-UNC13C、rs2402073-TC2N、rs8187730-SLC18A3、rs1390938-SLC18A1、rs631357-KIF17、rs4838544-KIF17、rs7202563-BAIAP3、rs1132356-BAIAP3、rs17099370-SYT16、rs8019076-SYT16、rs61821060-PPFIA4、rs902790-GPR156、rs564271-SYT8、rs822522-SYT11、rs4665855-OTOF、rs6264-DDC、rs2278973-CACNAIB、rs10791893-OR5T2。3.非同义变异的多态性基因与IBS-D疾病特征及肝郁脾虚证候特征的相关性分析;将76个非共有的多态性基因分别与病程、BMI、排便相关症状、IBS-SSS评分、IBS-QOL总积分及各维度评分、HAMA评分、HAMD评分进行相关性分析,得出结果如下:(1)与病程的相关分析:与病程呈线性相关的基因有rs1800762、rs1800762、rs75257288、rs55788818、rs35592366、rs7114672、rs2240229 及 rs4808383,均与病程为负相关关系。(2)与BMI的相关分析:与BMI呈线性相关的基因有rs1801474、rs9690195、rs17150243、rs2296225 及 rs6704505;其中 rs2296225、rs1801474、rs9690195、rs17150243与BMI为正相关关系,rs6704505与BMI为负相关关系。(3)与排便症状的相关分析:与排便次数呈线性相关的基因有rs10985765和rs17099370,其中rs10985765与排便次数为正相关关系,rs17099370与排便次数为负相关关系;与大便性状呈线性相关的基因有rs56218866及rs6704505,均与大便性状为正相关关系;与粘液便呈线性相关的基因有rs143100530、rs6704505、rs3811448、rs2236358、rs12224646、rs11018879、rs4859571、rs2240229、rs4808383、rs7937317、rs6590021及rs6590022,其中rs2236358与粘液便为正相关关系,余均与粘液便为负相关关系;与排便急迫感呈线性相关的有rs2270927、rs754224、rs3744215、rs4859571、rs34662058 及 rs3919907,其中 rs3744215、rs34662058 与排便急迫感为正相关关系,rs2270927、rs754224、rs4859571、rs3919907与排便急迫感为负相关关系;与排便不尽感呈线性相关的有rs4073918、rs6704505,其中rs4073918与排便不尽感为正相关关系,rs6704505与排便不尽感为负相关关系;没有与腹痛线性相关的基因。(4)与IBS-SSS评分、IBS-QOL总积分的相关分析:与IBS-SSS评分呈线性相关的基因为rs3744215,并与IBS-SSS评分呈正相关关系;与IBS-QOL总积分呈线性相关的基因有rs3741231、rs2285906、rs3749952,均与IBS-QOL总积分为正相关关系。(5)与IBS-QOL量表各维度的相关分析:与行为障碍呈线性相关的基因有rs9690195、rs3919907,均与行为障碍为正相关关系;与自体意象呈线性相关的基因有 rs183698487、rs6704505、rs141909159、rs17854256、rs10230714、rs537916、rs1468542、rs2285906、rs112305062、rs2240227、rs2240229、rs4808383.及rs3919907,其中 rs1468542、rs2285906、rs2240227、rs2240229、rs4808383 与自体意象为正相关关系,rs183698487、rs6704505、rs141909159、rs17854256、rs10230714、rs537916、rs112305062、rs3919907与自体意象为负相关关系;与健康担忧呈线性相关的基因有rs141909159、rs61732315、rs3741231、rs2285906、rs112305062、rs2240227 及rs3919907,其中 rs183698487、rs141909159、rs61732315、rs112305062 与健康担忧为正相关关系,rs3741231、rs2285906、rs2240227、rs3919907与健康担忧为负相关关系;与进食逃避呈线性相关的基因有rs7792976、rs2236358、rs35537868、rs13031859、rs10034345、rs11040249、rs2240229 及 rs4808383,其中 rs35537868、rs2240229、rs4808383 与进食逃避为正相关关系,rs7792976、rs2236358、rs13031859、rs10034345、rs11040249与进食逃避为负相关关系;与社会功能呈线性相关的基因有rs754224、rs2240229及rs4808383,均与社会功能为负相关关系;与性行为呈线性相关的基因有 rs28575545、rs6704505、rs189425146 及 rs35537868,其中 rs6704505与性行为呈正相关关系,rs28575545、rs189425146、rs35537868与性行为呈负相关关系;与关系拓展呈线性相关的基因有rs75257288、rs2236358、rs2114084、rs7114672,其中rs2114084与关系拓展为正相关关系,rs75257288、rs2236358、rs7114672与关系拓展为负相关关系;没有与心境恶劣线性相关的基因。(6)与HAMA及HAMD评分的相关分析:与HAMA评分呈线性相关的基因有rs17099370、rs7049042、rs1403811 及 rs7847413,均与 HAMA 评分为正相关关系;与 HAMD 评分呈线性相关的基因有 rs7792976、rs10230714、rs3741231、rs10034345及 rs11040249,其中 rs3741231 与 HAMD 评分为正相关关系,rs7792976、rs10230714、rs10034345、rs11040249与HAMD评分为负相关关系。(7)22个基因与IBS-D肝郁脾虚证相关症状无明确相关性,分别为:rs76762496、rs17731958、rs13233513、rs77758448、rs854524、rs2240026、rs6923492、rs62000403、rs484955、rs1176744、rs12986002、rs2240154、rs55646937、rs6263、rs118160201、rs59666014、rs7873074、rs7030820、rs1966357、rs2240228、rs75716864、rs8040712。结论:1.rs12437941-UNC13C、rs2402073-TC2N、rs8187730-SLC18A3、rs1390938-SLC18A1、rs631357-KIF17、rs4838544-KIF17、rs7202563-BAIAP3、rs1132356-BAIAP3、rs17099370-SYT16、rs8019076-SYT16、rs61821060-PPFIA4、rs902790-GPR156、rs564271-SYT8、rs822522-SYT11、rs4665855-OTOF、rs6264-DDC、rs2278973-CACNAIB、rs10791893-OR5T2这18个基因可能是IBS-D肝郁脾虚证患者脑肠神经递质相关的易感基因。2.IBS-D肝郁脾虚证患者外显子区域与神经递质相关的54个多态性基因与IBS-D疾病特征及肝郁脾虚证候特点具有相关性,可能与IBS-D肝郁脾虚证的发病及疾病进展有关。
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【学位授予单位】：广州中医药大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R574.4

【参考文献】

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本文编号：2685242