大豆lox2基因表达方式分析及其启动子预测
发布时间：2020-06-17 00:11
【摘要】：在不同逆境胁迫、激素条件下,检测大豆各器官中lox2基因表达方式,并对其启动子的序列及功能进行预测。利用qPT-PCR方法,检测大豆lox2基因表达方式;此外,通过PCR方法,克隆获得大豆lox2基因5’端上游序列,利用启动子在线软件进行预测分析。结果表明,该基因受干旱诱导,诱导表达量随处理时间增强;在盐、低温、ABA条件处理下,诱导表达下降,下降的表达量不随处理时间而变化。大豆lox2基因在大豆根、茎、叶、花中的相对表达量低,而在种子中的相对表达量高。克隆获得大豆lox2基因5’端上游2016 bp序列,命名为LP。在线软件预测分析,表明LP序列中含有多种典型的种子特异表达元件,如SEF3motif、SEF4motif、E-box、AACACA、ACGT、Skn-1 motif、AATAAA等;及与逆境、激素诱导相关的元件,如LTR、MBS、W-box、AAAG-motif、ABRE等。推测大豆LP启动子具有调控下游基因大量表达在种子中的特性,同时具有受脱落酸及其它逆境诱导表达的特性。
【图文】：
2、5、10和24h处理时间下，相对表达量与处理1h的表达量变化不大(图2)。大豆lox2基因在低温、ABA条件处理下，表现出与盐处理条件下相似的规律(图3～4)。说明大豆lox2基因受盐、低温、ABA9876543210相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图1干旱胁迫下lox2基因的表达Fig．1Expressionoflox2geneunderdroughtstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图2盐胁迫下lox2基因的表达Fig．2Expressionoflox2geneundersaltstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图3低温胁迫下lox2基因的表达Fig．3Expressionoflox2geneundercoldstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图4ABA诱导lox2基因的表达Fig．4Expressionoflox2geneunderABAinduction诱导，诱导表达下降，下降的表达量不随处理时间而变化。2．2大豆lox2基因的器官表达分析利用qＲT-PCＲ方法，大豆持家基因β-tubulin为内参，对大豆根、茎、叶、花、未成熟种子和成熟种子中lox2基因的相对表达量进行分析。结果显示(图相对定量Relative%quantity时间（h）160140120100806040200根茎叶花种子（30DAF）种子（90DAF）图5大豆lox2基因在大豆各器官中的表达Fig．5Expressionofsoybeanlox2geneindifferentsoybeanorgansM%12000%bp1000%bp750%bp500%bp250%bp100%bp2016%bpM．2000bpDNAma
2、5、10和24h处理时间下，相对表达量与处理1h的表达量变化不大(图2)。大豆lox2基因在低温、ABA条件处理下，表现出与盐处理条件下相似的规律(图3～4)。说明大豆lox2基因受盐、低温、ABA9876543210相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图1干旱胁迫下lox2基因的表达Fig．1Expressionoflox2geneunderdroughtstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图2盐胁迫下lox2基因的表达Fig．2Expressionoflox2geneundersaltstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图3低温胁迫下lox2基因的表达Fig．3Expressionoflox2geneundercoldstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图4ABA诱导lox2基因的表达Fig．4Expressionoflox2geneunderABAinduction诱导，诱导表达下降，下降的表达量不随处理时间而变化。2．2大豆lox2基因的器官表达分析利用qＲT-PCＲ方法，大豆持家基因β-tubulin为内参，对大豆根、茎、叶、花、未成熟种子和成熟种子中lox2基因的相对表达量进行分析。结果显示(图相对定量Relative%quantity时间（h）160140120100806040200根茎叶花种子（30DAF）种子（90DAF）图5大豆lox2基因在大豆各器官中的表达Fig．5Expressionofsoybeanlox2geneindifferentsoybeanorgansM%12000%bp1000%bp750%bp500%bp250%bp100%bp2016%bpM．2000bpDNAma
【图文】：
2、5、10和24h处理时间下，相对表达量与处理1h的表达量变化不大(图2)。大豆lox2基因在低温、ABA条件处理下，表现出与盐处理条件下相似的规律(图3～4)。说明大豆lox2基因受盐、低温、ABA9876543210相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图1干旱胁迫下lox2基因的表达Fig．1Expressionoflox2geneunderdroughtstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图2盐胁迫下lox2基因的表达Fig．2Expressionoflox2geneundersaltstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图3低温胁迫下lox2基因的表达Fig．3Expressionoflox2geneundercoldstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图4ABA诱导lox2基因的表达Fig．4Expressionoflox2geneunderABAinduction诱导，诱导表达下降，下降的表达量不随处理时间而变化。2．2大豆lox2基因的器官表达分析利用qＲT-PCＲ方法，大豆持家基因β-tubulin为内参，对大豆根、茎、叶、花、未成熟种子和成熟种子中lox2基因的相对表达量进行分析。结果显示(图相对定量Relative%quantity时间（h）160140120100806040200根茎叶花种子（30DAF）种子（90DAF）图5大豆lox2基因在大豆各器官中的表达Fig．5Expressionofsoybeanlox2geneindifferentsoybeanorgansM%12000%bp1000%bp750%bp500%bp250%bp100%bp2016%bpM．2000bpDNAma
2、5、10和24h处理时间下，相对表达量与处理1h的表达量变化不大(图2)。大豆lox2基因在低温、ABA条件处理下，表现出与盐处理条件下相似的规律(图3～4)。说明大豆lox2基因受盐、低温、ABA9876543210相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图1干旱胁迫下lox2基因的表达Fig．1Expressionoflox2geneunderdroughtstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图2盐胁迫下lox2基因的表达Fig．2Expressionoflox2geneundersaltstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图3低温胁迫下lox2基因的表达Fig．3Expressionoflox2geneundercoldstress1111000相对定量Relative%quantity0%1%2%510%24时间（h）图4ABA诱导lox2基因的表达Fig．4Expressionoflox2geneunderABAinduction诱导，诱导表达下降，下降的表达量不随处理时间而变化。2．2大豆lox2基因的器官表达分析利用qＲT-PCＲ方法，大豆持家基因β-tubulin为内参，对大豆根、茎、叶、花、未成熟种子和成熟种子中lox2基因的相对表达量进行分析。结果显示(图相对定量Relative%quantity时间（h）160140120100806040200根茎叶花种子（30DAF）种子（90DAF）图5大豆lox2基因在大豆各器官中的表达Fig．5Expressionofsoybeanlox2geneindifferentsoybeanorgansM%12000%bp1000%bp750%bp500%bp250%bp100%bp2016%bpM．2000bpDNAma
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