DTNBP1基因单核苷酸多态性与中国汉族精神分裂症的关联研究

发布时间：2020-07-11 01:31

【摘要】：背景精神分裂症是一种严重的精神疾病,症状复杂多变。人群中终生患病率约为1%,给社会及家庭带来巨大负担。由于缺少病理学标记,目前该病的病因未明。研究表明遗传因素在精神分裂症的病理机制中发挥了重要作用,是一种复杂的多基因遗传病。随着研究技术的发展,大量的易感位点(lq21-22、6p22-24、8p21-22、13q14-32等)和易感基因(DISC1、COMT、BDNF、RELN等)被发现。编码小肌蛋白结合蛋白(dysbindin-1)的基因DTNBP1位于易感区域,且和神经信号转导、突触结构以及神经发育等相关。但该基因与精神分裂症关联研究的结果不尽相同。目的1.探讨中国河南豫北地区汉族人群中DTNBP1基因14个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)与精神分裂症的关联。2.对DTNBP1基因的14个SNP位点的基因型与精神分裂症临床症状进行关联分析,了解该基因与中国汉族精神分裂症的临床症状是否存在关联。方法1.应用病例-对照的研究方法,按照美国精神障碍诊断与统计手册第四版(DSMIV-TR)中关于精神分裂症的诊断标准收集河南豫北地区汉族人群的精神分裂症患者900例,筛选出符合入组的528例偏执型精神分裂症患者,作为病例组;在同一时间同一地区纳入900例健康汉族人群,筛选出与病例组年龄和性别相匹配的528例为正常对照组。2.对所有入组人员的一般资料进行收集,并采集入组人员的外周静脉血5ml,保存于-80℃超低温冰箱。3.应用阳性和阴性症状评定量表(PANSS)在入组时对病例组中228例首发精神分裂症患者进行评估。4.应用北京天根生化科技的Relax Gene血液基因组DNA提取试剂盒提取血细胞中的DNA。5.用Illumina系统Golden Gate订制SNP芯片对所有入组人员DTNBP1基因14个SNP位点的基因型进行检测。6.采用gplink V2.05软件对病例组-对照组DTNBP1基因的14个SNP位点的等位基因频率和基因型频率进行关联分析和哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinberg,HWE)。SNP位点的连锁不平衡分析和单体型分析采用Haploview V4.1软件进行。7.采用SPSS20.0统计软件包分析病例组SNP位点不同基因型与入组时PANSS总分、阳性因子分、阴性因子分、焦虑抑郁因子分、认知因子分、兴奋敌对因子分的关联。结果1.病例组和对照组的一般人口学资料如年龄、性别差异无统计学意义(P0.05)。2.研究所选择的14个SNP位点都完成了基因型的测定,样本基因型测定的成功率为99.84%。3.软件分析结果示:14个SNP位点均符合HWE平衡,rs742106位点的等位基因频率和基因型频率在病例组和对照之间的分布有差异(P0.05),未发现其他13个位点的等位基因频率和基因型频率在病例组和对照之间分布存在显著差异。4.在按照性别分组后,男性组中14个位点均符合HWE平衡,发现3个位点(rs742106、rs4712253和rs9370823)的基因型频率和等位基因频率在病例组和对照组的分布有统计学差异(P0.05);女性组中2个位点在正常对照组中不符合HWE平衡,剩余的12个位点中,只有rs9358063位点的基因频率和等位基因频率在病例组和对照组之间的分布有统计学差异(P0.05)。5.在14个位点组成的2个连锁不平衡区域中,只有1个单倍体型(G-A-A)在病例组和对照组之间分布的频率有统计学差异(P0.05)。6.SNP位点的基因型与临床症状的关联分析结果显示:只有rs742106位点的基因型与精神分裂症患者的PANSS总分、阴性因子分、抑郁焦虑因子分以及兴奋敌对因子分有显著关联(P0.05)。结论1.研究发现DTNBP1基因与河南省豫北地区汉族精神分裂症存在关联,可能是精神分裂症患者风险基因。2.DTNBP1基因对精神分裂症的易感性存在性别方面的差异。3.DTNBP1基因与精神分裂症患者的临床症状存在关联,可能参与精神分裂症的发生发展。
【学位授予单位】：新乡医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R749.3
【图文】：

不平衡系数,连锁不平衡,等位基因频率,程度

6 A G 0.320 3.916 0.047 0.7264 154(0.292) 374(0.708)264 184(0.348) 344(0.652)数据为基因型的频率值，MAF 表示最小等位基因频率 ,#表示对照组不符合点的连锁不平衡分析结果锁不平衡系数 D′和 r2为标准，应用 HaploviewV4.1 软件分析基因上 14 个 SNP 位点的区域中存在 2 个连锁不平衡区域rium block, LD block），按其在染色体上的位置分别是：rs16876575、r3 组成的 LD block1，rs9358063、rs2619533、rs4715986、rs12199640、r9、rs2619542、rs1011313 组成的 LD block2，其中每一个模块的颜的程度，模块的颜色越深，连锁程度越强（见图 1）。针对这些连锁样本中进一步进行单体型分析。

位点,基因型,存在差异,总分

28图 2 rs742106 位点不同基因型与 PANSS 各因子分值的比较：横轴代表不同的基因型，纵轴代表 PANSS 各因子分值;*为 P<0.05,**为 P<0.01;A:不同基因之间 PANSS 总分存在差异,且 GG<AA; B:不同基因型之间阳性因子的分值没有差异; C:不同基型之间阴性因子分值存在差异，且 GG<AG; D:各个基因型之间抑郁/焦虑因子分值之间都有差，且 GG<AG<AA;E:不同基因型之间认知因子的分值存在差异,且 AA<AG;F:各个基因型之间奋/敌对因子分值之间都有差异,且 GG<AA

【参考文献】