人参和西洋参单拷贝核基因的遗传多样性研究

发布时间：2020-07-31 08:32

【摘要】：人参属(Panax L.)为五加科(Araliaceae)多年生草本植物。分子系统研究结果表明,人参(Panax ginseng C.A.Mey.)和西洋参(Panax quinquefolius L.)是人参属中亲缘关系较近的两个物种。目前对近缘物种的遗传多样性研究已广泛地应用于群体遗传学、分子育种和保护遗传学中。本文基于单拷贝核基因序列,研究了人参和西洋参的遗传差异。研究内容及结果如下:(1)人参单拷贝核基因数据库的构建。本研究通过从NCBI数据库中检索的人参属EST序列,与拟南芥单拷贝核基因数据库比对,筛选与拟南芥单拷贝核基因数据库相似性较高的序列构成拟人参单拷贝序列。运用自行设计的引物对人参单拷贝核序列进行PCR群体扩增。在此基础上,利用第二代测序平台对PCR群体扩增产物测序,序列分析后已成功获得58个人参单拷贝核基因序列构建成人参单拷贝核基因数据库。其中,所开发的引物可用于人参属其他物种的单拷贝核基因片段的扩增。(2)人参和西洋参遗传多样性分析。运用SNP分子标记对20个人参样本和10个西洋参样本16个单拷贝核基因序列进行群体遗传学分析。通过序列比对分别在人参和西洋参中开发160个和171个有效的SNP,以SNP数据为基础统计出人参核基因中单倍型数量变化从1到12;西洋参核基因的单倍型数量变化从1到9,且人参和西洋参没有共享的单倍型。根据人参和西洋参的多态性位点结果分析人参的核苷酸多样性(πT)变化从0.000到0.023;西洋参中核苷酸多样性变异为0.005到0.035。人参总核苷酸多样性0.007,而西洋参总核苷酸多态性0.017。结果表明人参属的两个物种表现出较高的核苷酸多样性水平,且西洋参的遗传多样性高于人参的遗传多样性。近缘物种遗传多样性研究有利于为人参和西洋参的种质资源保护和分子育种奠定理论基础,开发的人参单拷贝核基因为后续的人参系统发育以及人参的驯化研究提供有效的数据基础。
【学位授予单位】：东北师范大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：S567.51;S567.53

【参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 张丁予;章婷曦;王国祥;;第二代测序技术的发展及应用[J];环境科学与技术;2016年09期

2 周龙华;蒋立希;;SNP分子标记及其在甘蓝型油菜中应用的研究进展[J];农业生物技术学报;2016年10期

3 杜淑辉;王兆山;保尔江·阿布都哈米提;邢世岩;张建国;;应用单拷贝核基因标记研究我国欧洲山杨自然居群的遗传多样性[J];林业科学研究;2016年01期

4 邓菁;张甜甜;王迪;金海珠;王洪涛;;利用外转录间隔区对中国人参和西洋参进行分子鉴定[J];食品与生物技术学报;2015年04期

5 杨烨;刘娟;;第二代测序序列比对方法综述[J];武汉大学学报(理学版);2012年05期

6 郭秀丽;高淑莲;;人参化学成分和药理研究进展[J];中医临床研究;2012年14期

7 岳桂东;高强;罗龙海;王军一;许姣卉;尹烨;;高通量测序技术在动植物研究领域中的应用[J];中国科学:生命科学;2012年02期

8 刘志文;韩旭;李莉;李宪臻;陈温福;;叶绿体和线粒体DNA在植物系统发育中的应用研究进展[J];河南农业科学;2008年07期

9 冯夏莲;何承忠;张志毅;安新民;王冬梅;;植物遗传多样性研究方法概述[J];西南林学院学报;2006年01期

10 马兰;黄原;;单拷贝核基因在昆虫分子系统学中的应用[J];昆虫知识;2006年01期

相关硕士学位论文 前1条

1 史凤雪;人参属系统发育与多倍化研究[D];东北师范大学;2016年

本文编号：2776231