甘肃高山细毛羊和湖羊HIF-2α基因序列变异特征研究

发布时间：2020-08-02 18:37

【摘要】：低氧诱导因子(HIFs)是一种氧依赖的转录激活因子,由一个调节表达的亚基(HIF-α)和一个持续表达的亚基(HIF-β)所构成,在细胞缺氧调节过程中具有重要作用。HIF-2α为HIFs基因家族成员之一,主要与高原土著居民和动物适应高原低氧环境密切相关。为探讨HIF-2α基因核苷酸多态性,以甘肃高山细毛羊和湖羊为研究对象,采用PCR-SSCP技术和DNA测序技术检测HIF-2α基因3个不同区域(外显子8,外显子9,外显子11)在2个绵羊群体中的单核苷酸多态性等分子遗传特征。主要研究结果为:(1)甘肃高山细毛羊和湖羊HIF-2α基因的3个检测区域共发现27个变异位点,其中2个位点为碱基插入,占突变位点的7.4%;20个位点发生碱基转换,占突变位点的74.1%;5个位点发生碱基颠换,占突变位点的18.5%。两个绵羊品种HIF-2α基因的3个检测区域的多态性信息含量值均在0.5以上,属高度多态。(2)甘肃高山细毛羊和湖羊HIF-2α基因3个检测区域的PCR-SSCP检测结果:外显子8区域共检测出4种等位基因,形成9种基因型;两个绵羊群体的优势等位基因分别为B(60.59%)和A(39.57%),优势基因型分别为BB(48.00%)和AB(23.56%)。外显子9区域共检测出5种等位基因,形成8种基因型;两个绵羊群体的优势等位基因均为B,基因频率分别为61.50%和50.00%,优势基因型分别为BD(43.00%)和BB(27.79%)。外显子11区域共检测出4种等位基因,形成10种基因型;两个绵羊群体的优势等位基因分别为A(43.50%)和B(32.15%),优势基因型均为AB,基因型频率分别为34.50%和16.47%。(3)HIF-2α基因3个扩增区域在两个绵羊品种中具有丰富的多态性,且等位基因频率和基因型在品种间差异显著,具有生物学意义。推测在高原低氧适应过程中,HIF-2α基因可能受到了不同选择,在长期的高原低氧环境中,有利于适应高海拔低氧的基因型个体在高海拔绵羊品种中受到正向选择,频率上升;不利于适应高海拔低氧的基因型个体在高海拔绵羊品种中受到负向选择,导致等位基因频率下降。(4)绵羊HIF-2α基因编码区外显子8和9核苷酸序列与山羊同源性最高,与其亲缘关系远近一致。综上所述,绵羊HIF-2α基因在3个检测区域均高度多态,选育潜力较大,通过分析该基因在两个绵羊群体中的多态性,可为绵羊适应高原低氧环境候选基因的研究提供基础资料。
【学位授予单位】：甘肃农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S826

【参考文献】

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本文编号：2778901