下调FOXK1表达对结直肠癌细胞系SW480基因表达谱的影响

发布时间：2020-11-13 02:28

　　 目的及意义结直肠癌的早期发现及早期治疗可提高患者的远期生存率及其生存质量;但由于结直肠癌早期并无明显的、特异性的临床症状或体征,早期诊治该疾病仍有困难。虽然目前已经发现多种和结直肠癌相关的肿瘤标记物,仍难以用于诊断及靶向治疗。此外结直肠癌的高死亡率主要是由于术后肿瘤复发和转移所导致的。因此对结直肠癌发生、侵袭和转移的分子机制的深入研究给早期结直肠癌的发现及相关的靶向治疗提供可能,进而提高患者的生存率及生存质量。研究发现FOXK1能够调控胚胎发育、维持代谢平衡,参与细胞代谢及生长,其与结直肠癌的发生发展有着密切的相关性。实验研究表明其下调能抑制结直肠癌细胞的增殖、侵袭以及转移。本课题主要通过基因芯片检测技术了解下调FOXK1的表达对结直肠癌细胞系SW480基因表达谱的影响以让课题组最终探究其下游基因及其相关机制,为未来开展对结直肠癌的新的靶向治疗提供可能。实验研究方法根据课题组前期实验结果,本课题选取SW480细胞系进行实验,将其分别设置为对照组及实验组,实验组转染FOXK1-siRNA,对照组转染Scrambled-siRNA,通过该RNA干扰技术在肠癌细胞系中靶向敲低癌基因FOXK1,利用蛋白质免疫印迹试验验证转染后的FOXK1表达情况,通过Nanodrop2000超微量分光光度计及Agilent 2100 Bioanalyzer对RNA进行质检,采用基因芯片技术了解下调FOXK1的表达对肠癌细胞系SW480基因表达谱的影响,以符合|Fold Change|大于2同时P-value小于0.05的条件作为显著差异的筛选标准。结果结果显示相对于对照组,实验组中有888个基因有显著差异表达,其中有491个基因的表达是上调的,有397个基因的表达是下调的。结论基因芯片结果提示相对于对照组,许多参与肿瘤发生发展的基因发生了改变。通过KEGG数据库进行pathway分析提示FOXK1可能通过参与多条信号通路调控肿瘤细胞的发生发展。
【学位单位】：南方医科大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：R735.34
【部分图文】：

２８Ｓ／１８Ｓ＜０．７均考虑样品存在部分降解，若２１００ＲＩＮ＜＝６．０则考虑样品降解，故??质检标准为Ａｇｉｌｅｎｔ?２１００?Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ?ＲＩＮ值大于等于７．０同时２８Ｓ／１８Ｓ比值大于??０．７，表３－１及图３－２、３－３结果提示所检测样品均为合格的样品，可进行下一步??的实验。??２６??

ｉ?Ｉ?ｉ?Ｉ?Ｉ?ｉ?Ｉ?Ｉ￣ｉ?ｉ??２０?２５?３０?３５?４０?４５?５０?５５?Ｗ?６５?（ｊ）??图３－３?Ａｇｉｌｅｎｔ?２１００?Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ检测到的各个样品总ＲＮＡ的结果图。??Ｆｉｇｕｒｅ?３－３?Ｔｈｅｓｅ?ｇｒａｐｈｓ?ｓｈｏｗ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｅｒｏｇｒａｍｓ?ｄｅｔｅｃｔｅｄ?ｂｙ?Ａｇｉｌｅｎｔ?２１００??Ｂｉｏａｎａｌｙｚｅｒ．??３．２．２基因芯片的数据??（１）基因芯片的原始数据??－?．??■?－－??（：?＾?■?＼??Ｉ?ｒ??．?．??＇??ｉ?ｉｒ．?Ｉ??图３－４基因芯片的原始数据，Ａ图为样本Ｃ７１－１，?Ｂ图为样本Ｃ７２－１，?Ｃ图为样本Ｃ７１－２，?Ｄ??图为样本Ｃ７２－２，?Ｅ图为样本Ｃ７卜３，?Ｆ图为样本Ｃ７２－３。??Ｆｉｇｕｒｅ?３－４?Ｏｒｉｇｉｎａｌ?Ｄａｔａ?ｏｆ?ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ？?ｆｉｇｕｒｅ?Ａ?ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ?Ｃ７１?－１？?ｆｉｇｕｒｅ?Ｂ?ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ?Ｃ７２－１，??２８??

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【参考文献】

相关期刊论文 前4条

1 曹明楠;崔俊;李卫东;;基因芯片技术在抗肿瘤药物研究和肿瘤诊断中的应用[J];中国药理学与毒理学杂志;2014年06期

2 滕牧洲;马文丽;;走近医学研究领域中的基因芯片技术[J];分子诊断与治疗杂志;2014年06期

3 张国栋;张德保;;基因芯片技术在肿瘤研究与治疗中的应用[J];肿瘤药学;2011年05期

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本文编号：2881594