Tourette综合征患儿GRIN3B基因突变筛查

发布时间：2020-11-20 04:14

　　 目的:Tourette综合征是一种起病于儿童时期,以多发性运动抽动伴有一种或多种发声抽动为主要临床特点的神经精神障碍性疾病。近年来有关谷氨酸受体基因家族与该病的相关性被关注,研究证明多种谷氨酸受体基因参与Tourette综合征的发病机制,而GRIN3B基因是谷氨酸受体基因家族中的一个主要成员,本研究的目的是对该基因编码区突变进行研究,明确该基因与Tourette综合征的相关性。方法:本研究通过采用illumina二代测序的方法对GRIN3B基因的全部外显子区域进行测序分析;结合测序结果和生物信息学分析,初步筛选TS患者GRIN3B可能与TS相关的突变位点及类型;然后将二代测序初选出的位点用一代测序在相应样本中进行验证。其中选取51例Tourette综合征患儿及60例健康对照组,实验组选取2015年10月至2016年11月就诊于青岛大学附属医院的51例年龄范围在6-16岁的TS患儿,平均年龄9.78±3.64岁,其中男孩41例(80.4%),女孩10例(19.6%);入选标准为:(1)在疾病的某段时间内存在多种运动和一个或更多的发声抽动,尽管不一定同时出现;(2)抽动的频率可以有强有弱,但自第一次抽动发生起持续超过一年;(3)18岁前发病;(4)这种障碍不能归因于某种物质(例如可卡因)的生理效应或其他躯体疾病。健康对照组选取年龄在22-45岁范围内的健康体检者,平均年龄29.08±2.89岁,其中男性49例(81.7%),女性11例(18.3%)。选择标准为:(1)无神经系统和精神疾病及其它重大躯体疾病;(2)无神经、精神疾病家族史;(3)自愿参与此次临床试验并签署知情同意书的健康体检者。提取两组的血液基因组DNA,设计GRIN3B基因片段引物,然后对GRIN3B基因编码区进行PCR扩增,采用Sanger测序法对每一个编码区进行测序,并将测序结果与对照组及NCBI数据库中GRIN3B基因编码区原序列(NM_138690.2)进行比对,检测这些患儿是否携带GRIN3B基因突变。结果:本研究通过Sanger测序法对TS组及对照组的GRIN3B基因进行突变研究,结果在TS组发现两个非同义变异位点p.P154S和p.L396S,其中rs113181909位点变异(c.C460T)导致脯氨酸突变成丝氨酸(p.P154S),该氨基酸位于高度保守序列。rs12978900位点变异(c.T1187C)导致亮氨酸突变为丝氨酸(p.L396S),但该氨基酸位于非保守序列,而对照组rs113181909和rs12978900未发现相应的变异。经生物信息学分析发现,位于GRIN3B蛋白第154位密码子编码的脯氨酸变为丝氨酸(p.P154S),第396位密码子编码的亮氨酸变为丝氨酸(p.L396S)。同时,利用DNAMAN软件将人、牛、小鼠、绵羊、大白鼠以及野猪的GRIN3B蛋白进行多重序列比对,结果发现第154位氨基酸位于保守区内,而位于第396位的氨基酸位于非保守区域。结论:在2例患者中发现了GRIN3B基因c.C460T(p.P154S)变体;在10例患者中发现GRIN3B基因c.T1187C(p.L396S)变体,并通过Sanger测序的方法验证,得到双峰变异测序图。两个GRIN3B变异位点均导致该编码蛋白的改变,但有关GRIN3B基因变异导致Tourette综合征的具体机制尚不明确。
【学位单位】：青岛大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：R749.94
【部分图文】：

8第三章 实验结果3.1 琼脂糖凝胶电泳结果(见图1)图1 琼脂糖凝胶电泳图（注：泳道1为Marker I，自上到下分别为：700bp，600 bp，500 bp，400 bp，300 bp，200 bp，100 bp;其他泳道自左到右分别为GRIN3B 1-9 的PCR产物,其中泳道2-3为外显子1、2的PCR产物；泳道4-6为GRIN3B外显子3的3个片段的PCR产物；7-12泳道为4-9外显子PCR产物)3.2 Sanger测序结果发现两例GRIN3B基因c.460C＞T（图2A）变异和一例c.1187T＞C（图2B）变异

图2 Sanger测序结果到下为：GRIN3B基因c.460C＞T, p.P154S，健康人GRIN3B基因序列；B:自上到下为：GRIN3B基因.L396S，健康人GRIN3B基因序列)生物信息学分析结果生物信息学分析发现，位于GRIN3B蛋白第154位密码子编码的脯氨酸p.P154S），第396位密码子编码的亮氨酸变为丝氨酸（p.L396S）。同AMAN软件将人、牛、小鼠、绵羊、大白鼠以及野猪的GRIN3B蛋白进对，结果发现第154位氨基酸位于保守区内，而位于第396位的氨基酸域(见图3)。

图2 Sanger测序结果(A:自上到下为：GRIN3B基因c.460C＞T, p.P154S，健康人GRIN3B基因序列；B:自上到下为：GRIN3B基因c.1187T＞C, p.L396S，健康人GRIN3B基因序列)3.3 生物信息学分析结果经生物信息学分析发现，位于GRIN3B蛋白第154位密码子编码的脯氨酸变为丝氨酸（p.P154S），第396位密码子编码的亮氨酸变为丝氨酸（p.L396S）。同时，利用DNAMAN软件将人、牛、小鼠、绵羊、大白鼠以及野猪的GRIN3B蛋白进行多重序列比对，结果发现第154位氨基酸位于保守区内，而位于第396位的氨基酸位于非保守区域(见图3)。A
【参考文献】

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1 陈佳禾;张梅;;免疫代谢与调节性T细胞[J];中华微生物学和免疫学杂志;2017年05期

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3 张海艳;刘长云;王永芹;;Tourette综合征发生的危险因素分析[J];中国当代儿科杂志;2012年06期

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5 Jeremy Stern;刘小坤;王刚;;抽动秽语综合征的进展[J];内科理论与实践;2010年05期

6 孙敬;洪杰华;郑世民;;IL-12及其免疫调节作用[J];动物医学进展;2010年02期

7 龙锐;杜俊蓉;;亲代谢型谷氨酸受体和相关神经疾病[J];中国药理学通报;2009年08期

8 HUGANIR Richard L;;受体、突触和记忆[J];生命科学;2008年05期

9 郑素华,薛绛宇,陈燕辉;多动行为问题儿童血5-羟色胺浓度变化相关性探讨[J];中国临床康复;2002年07期

本文编号：2890932