版纳微型猪近交系RNF4基因克

发布时间：2020-12-08 15:35

　　RNF4基因调节精细胞分化和增殖过程,文章以Gen Bank下载的猪及近缘物种RNF4 mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增版纳微型猪近交系(BMI)RNF4基因。应用qPCR分析15个重要组织mRNA表达谱,并对蛋白质序列作功能生物信息学分析,构建多物种系统进化树。研究获得BMI RNF4 573 bp编码区序列(Gen Bank登录号:KU705638,对应氨基酸登录号:AOC89056),编码190个氨基酸,蛋白质分子质量(Mw)为21.43 ku,等电点(pI)为6.95。多组织荧光定量表达分析表明RNF4基因在尿道球腺、睾丸、肝、肺中高水平表达;在其他11个组织中呈中低水平表达。功能生物信息学分析表明RNF4蛋白质存在1个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端疏水;有4类功能活性位点,位于细胞核概率为94.1%。系统进化分析表明,BMI与狗亲缘关系最近。结果为研究RNF4基因在猪精细胞分化和增殖方面作用奠定基础。 

【文章来源】：东北农业大学学报. 2017年03期 第24-30页 北大核心

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品与试剂
        1.1.1 样品
        1.1.2 试剂
    1.2 方法
        1.2.1 RNA提取和c DNA合成
        1.2.2 引物设计及合成
        1.2.3 PCR扩增反应体系及程序
        1.2.4 多组织荧光定量表达分析
        1.2.5 序列确定和数据分析
2 结果与分析
    2.1 RNF4基因PCR扩增结果
    2.2 RNF4基因序列及其编码氨基酸序列
    2.3 多组织荧光定量表达分析
    2.4 RNF4蛋白质一级结构信息
    2.5 RNF4蛋白质二级结构
    2.6 RNF4蛋白质功能域
    2.7 RNF4蛋白质疏水性
    2.8 RNF4蛋白质功能位点分析
    2.9 RNF4蛋白质跨膜结构、信号肽及在细胞中定位位置分析
    2.10 RNF4蛋白质序列多物种系统进化分析
3 讨论
4 结论



本文编号：2905305