比较转录组分析揭示参与树莓顶端生根调节的候选基因
发布时间：2020-12-16 16:54
悬钩子属（Rubus spp.）树莓（Raspberry）有丰富的营养价值和药用价值,被国际农粮组织誉为“第三代水果”,作为近年开发的功能性食品热点小浆果类树种之一,树莓的发展前景非常广阔。树莓表现出一种独特的顶端生根方式,即从其基生枝茎尖端开始生根,而这种基生枝顶端生根是一种独特的无性生殖方式。对于其生根机制进行研究有利于树莓种植业的发展。而时至今日,还没有与树莓顶端生根的基生枝与不生根的花果枝之间差异表达基因的筛选相关的研究,树莓基生枝与花果枝差异表达基因的功能分析也未见报道,参与树莓顶端生根过程的基因尚未鉴定。本次研究将树莓基生枝顶端生根过程划分为三个时期,分别命名为:SAP1（primocane at developmentalstage 1）,SAP2（primocane at developmentalstage 2）,SAP3（primocane at developmentalstage 3）。其中:SAP1代表树莓基生枝延伸生长时期;SAP2代表树莓基生枝生长停滞,且顶端开始出现向地性弯曲的时期;SAP3则代表树莓基生枝尖端分化出短根的时期。同时期花果枝,分别命名为:...
【文章来源】：吉林师范大学吉林省
【文章页数】：45 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
表达谱测序标准流程
图 2. 典型的“四季红”红树莓晚季茎图Fig. 2 Diagrams of typical late season stems of “Sijihong” red raspberry状态如图所示,（A）为去除顶芽后的基生枝的特征（茎在当前季节的生长）。芽2，3和芽4是芽1被去除后新诱导的侧枝；（B）在它第一个生长季节去除两年生花果枝的顶芽。ified from Heslop-Harrison, 1959).The state of the buds is as indicated in the key. (A) Characteristicsimocane after terminal bud was removed (stem of the current season’s growth). Shoot 2, 3, and 4 arely induced lateral branches after the terminal bud 1 was cut off; (B) A 2-year-old floricane, terminalwas cut during its first growth season.
图 3.树莓基生枝茎尖顶端生根的三个发育阶段Fig. 3 Three rooting developmental stages of Rubus spp图示（a-c）分别对应（A-C）中用红色圈出的部分。（A，a）SAP1，在这一时期，树莓茎尖的枝叶生长活跃；（B，b）SAP2，在此时期，茎尖叶子枯萎，尖变钝，茎端直径显著增加；（C，c）SAP3，在此时期，茎尖端变枯黄，短根开始形成。图中的黑色箭头显示了轴的方向性。PM代表基生枝；PMA代表基生枝尖端；FO代表叶子；RT代表不定根。A，b和c的比例尺等于2.0mm。stem apex (modified from Heslop-Harrison, 1959. Panels (a-c) are enlarged views of the parts circled in redin panels (A-C), respectively. (A, a) SAP1, foliage on the tapering apex remains active; (B, b) SAP2,foliage on the apex withers, apex becomes blunt and its diameter increased dramatically; (C, c) SAP3, theapex becomes chlorotic and short roots began to form. Black arrows in above panels show axis orientations.PM, primocane; PMA, primocane apex; FO, foliage; RT, root. Scale bars in a, b, and c = 2.0 mm.2.2 实验方法2.2.1 RNA 的提取及质量检测
【参考文献】：
期刊论文
[1]发展树莓前景广阔[J]. 刘秀娟. 农业与技术. 2017(12)
[2]阜新地区树莓品种选择及省力栽培技术要点[J]. 齐金海. 现代园艺. 2017(07)
[3]多重PCR靶向富集结合高通量测序筛查结直肠癌中MMR基因的突变[J]. 黄凯,陈慧杰,刘方奇,徐烨,李轩,南蓬. 复旦学报(医学版). 2016(02)
[4]转录组技术在果树研究中的应用[J]. 薛辉,曹尚银,李好先,牛娟,张富红,赵弟广. 江西农业学报. 2015(05)
[5]大豆转录组测序研究进展综述[J]. 刘佳伟,姚丹,赵东海,石放放. 安徽农学通报. 2015(08)
[6]小鼠颌骨发育过程中长链非编码RNA的表达谱变化[J]. 夏昕,伍虹,陈绛媛,孔祥波,阮毅. 中华口腔医学研究杂志(电子版). 2014(06)
[7]高通量转录组测序技术及其在鳞翅目昆虫上的应用[J]. 杨帆,黄立华,张爱兵. 昆虫学报. 2014(08)
[8]树莓扦插繁育技术[J]. 李红秀. 青海农林科技. 2014(02)
[9]转录组测序技术在玉米中的应用研究进展[J]. 许波,张伟强,冯晓曦,王成业,张海申,许海涛,王友华,张今瀚. 玉米科学. 2014(01)
[10]树莓的研究现状及开发利用[J]. 杨婷婷. 四川林业科技. 2013(03)
博士论文
[1]甘蓝型油菜粒重母体调控机理解析[D]. 李娜.中国农业科学院 2015
[2]黄芪次生代谢途径调控诱导子筛选及转录组学研究[D]. 刘秀波.东北林业大学 2013
[3]银杏和木兰属植物的转录组、叶绿体基因组及其相关研究[D]. 林小涵.北京协和医学院 2011
硕士论文
[1]黑龙江省树莓产业发展现状及对策[D]. 张岩.东北农业大学 2016
[2]树莓果实中多糖的降解、结构及生物活性研究[D]. 刘璐.东北农业大学 2016
[3]树莓引种的栽培区划研究[D]. 芦霞.江西农业大学 2016
[4]小菜蛾免疫Bt动力学的DGE分析及其PGRP-LB基因的克隆[D]. 张玉清.华南农业大学 2016
[5]银杏转录组测序及叶片与胚珠数字基因表达谱分析[D]. 路兆庚.扬州大学 2015
[6]基于转录组和VIGS技术发掘棉花抗黄萎病相关基因[D]. 郑永杰.南京农业大学 2015
[7]纳米TiO2对家蚕饲料效率影响的研究[D]. 张华.苏州大学 2015
[8]花生种子不同发育时期的表达谱及DGAT基因的表达分析[D]. 胡晓锋.河南农业大学 2015
[9]水稻无中叶脉dl2突变体转录组与蛋白组的相关性分析[D]. 彭小燕.重庆大学 2015
[10]洋葱转录组分析及雄性不育细胞质类型鉴定[D]. 李满堂.南京农业大学 2014
本文编号：2920473
【文章来源】：吉林师范大学吉林省
【文章页数】：45 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
表达谱测序标准流程
图 2. 典型的“四季红”红树莓晚季茎图Fig. 2 Diagrams of typical late season stems of “Sijihong” red raspberry状态如图所示,（A）为去除顶芽后的基生枝的特征（茎在当前季节的生长）。芽2，3和芽4是芽1被去除后新诱导的侧枝；（B）在它第一个生长季节去除两年生花果枝的顶芽。ified from Heslop-Harrison, 1959).The state of the buds is as indicated in the key. (A) Characteristicsimocane after terminal bud was removed (stem of the current season’s growth). Shoot 2, 3, and 4 arely induced lateral branches after the terminal bud 1 was cut off; (B) A 2-year-old floricane, terminalwas cut during its first growth season.
图 3.树莓基生枝茎尖顶端生根的三个发育阶段Fig. 3 Three rooting developmental stages of Rubus spp图示（a-c）分别对应（A-C）中用红色圈出的部分。（A，a）SAP1，在这一时期，树莓茎尖的枝叶生长活跃；（B，b）SAP2，在此时期，茎尖叶子枯萎，尖变钝，茎端直径显著增加；（C，c）SAP3，在此时期，茎尖端变枯黄，短根开始形成。图中的黑色箭头显示了轴的方向性。PM代表基生枝；PMA代表基生枝尖端；FO代表叶子；RT代表不定根。A，b和c的比例尺等于2.0mm。stem apex (modified from Heslop-Harrison, 1959. Panels (a-c) are enlarged views of the parts circled in redin panels (A-C), respectively. (A, a) SAP1, foliage on the tapering apex remains active; (B, b) SAP2,foliage on the apex withers, apex becomes blunt and its diameter increased dramatically; (C, c) SAP3, theapex becomes chlorotic and short roots began to form. Black arrows in above panels show axis orientations.PM, primocane; PMA, primocane apex; FO, foliage; RT, root. Scale bars in a, b, and c = 2.0 mm.2.2 实验方法2.2.1 RNA 的提取及质量检测
【参考文献】：
期刊论文
[1]发展树莓前景广阔[J]. 刘秀娟. 农业与技术. 2017(12)
[2]阜新地区树莓品种选择及省力栽培技术要点[J]. 齐金海. 现代园艺. 2017(07)
[3]多重PCR靶向富集结合高通量测序筛查结直肠癌中MMR基因的突变[J]. 黄凯,陈慧杰,刘方奇,徐烨,李轩,南蓬. 复旦学报(医学版). 2016(02)
[4]转录组技术在果树研究中的应用[J]. 薛辉,曹尚银,李好先,牛娟,张富红,赵弟广. 江西农业学报. 2015(05)
[5]大豆转录组测序研究进展综述[J]. 刘佳伟,姚丹,赵东海,石放放. 安徽农学通报. 2015(08)
[6]小鼠颌骨发育过程中长链非编码RNA的表达谱变化[J]. 夏昕,伍虹,陈绛媛,孔祥波,阮毅. 中华口腔医学研究杂志(电子版). 2014(06)
[7]高通量转录组测序技术及其在鳞翅目昆虫上的应用[J]. 杨帆,黄立华,张爱兵. 昆虫学报. 2014(08)
[8]树莓扦插繁育技术[J]. 李红秀. 青海农林科技. 2014(02)
[9]转录组测序技术在玉米中的应用研究进展[J]. 许波,张伟强,冯晓曦,王成业,张海申,许海涛,王友华,张今瀚. 玉米科学. 2014(01)
[10]树莓的研究现状及开发利用[J]. 杨婷婷. 四川林业科技. 2013(03)
博士论文
[1]甘蓝型油菜粒重母体调控机理解析[D]. 李娜.中国农业科学院 2015
[2]黄芪次生代谢途径调控诱导子筛选及转录组学研究[D]. 刘秀波.东北林业大学 2013
[3]银杏和木兰属植物的转录组、叶绿体基因组及其相关研究[D]. 林小涵.北京协和医学院 2011
硕士论文
[1]黑龙江省树莓产业发展现状及对策[D]. 张岩.东北农业大学 2016
[2]树莓果实中多糖的降解、结构及生物活性研究[D]. 刘璐.东北农业大学 2016
[3]树莓引种的栽培区划研究[D]. 芦霞.江西农业大学 2016
[4]小菜蛾免疫Bt动力学的DGE分析及其PGRP-LB基因的克隆[D]. 张玉清.华南农业大学 2016
[5]银杏转录组测序及叶片与胚珠数字基因表达谱分析[D]. 路兆庚.扬州大学 2015
[6]基于转录组和VIGS技术发掘棉花抗黄萎病相关基因[D]. 郑永杰.南京农业大学 2015
[7]纳米TiO2对家蚕饲料效率影响的研究[D]. 张华.苏州大学 2015
[8]花生种子不同发育时期的表达谱及DGAT基因的表达分析[D]. 胡晓锋.河南农业大学 2015
[9]水稻无中叶脉dl2突变体转录组与蛋白组的相关性分析[D]. 彭小燕.重庆大学 2015
[10]洋葱转录组分析及雄性不育细胞质类型鉴定[D]. 李满堂.南京农业大学 2014
本文编号：2920473
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