缬草内生、根际放线菌中安莎类和卤代类抗生素生物合成基因簇的筛选及研究

发布时间：2020-12-18 05:21

　　药用植物内生及根部微生物种类、数量以及活性代谢产物相对比较丰富,是生物活性物质的重要来源。本研究旨在分离缬草内生及根际放线菌,筛选其中含安莎霉素类和卤代酶类抗生素生物合成基因簇的菌株,挖掘鉴定新的次级代谢产物。本研究通过分离纯化共获得143株缬草内生及根际放线菌,检测其对细菌和真菌病原菌的抑菌活性,结果显示22.4%的放线菌对病原菌具有抑制效果。基于AHBA合酶基因和卤代酶基因设计安莎类和卤代类抗生素简并引物,对抑菌效果较好的菌株DNA进行PCR扩增。结果表明:菌株AJ21和AJ56分别含有安莎类和卤代类抗生素生物合成基因。通过对两株菌进行16S rDNA鉴定、形态特征观察、生理生化研究以及系统发育分析,发现菌株AJ21和AJ56均为链霉菌属。基于菌株AJ21和AJ56的抑菌效果以及抗生素生物合成基因片段,进行基因组分析发现:菌株AJ21的基因组序列长约10 Mb,有8415个编码基因,GC含量达到73.73%。菌株AJ56的基因组序列长约8 Mb,有7259个编码基因,GC含量为71.85%。基因功能分析发现两者均含有特曲霉素抗性,并拥有丰富的次级代谢基因簇,其中菌株AJ21有54个... 

【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：70 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

AHBA的生物合成途径（QianjinKetal.2012）

图 1-2 不同的 AHBA 生物合成基因簇（Qianjin K et al. 2012）Fig 1-2 DifferentAHBA biosynthetic gene clusters（Qianjin K et al. 2012）注意的是，来自于萘型和苯型安莎类基因簇的 AHBA 合成酶表现出特征据了系统发育树的不同分支 (图 1-3)。更有意思的是，介于这两种类型的聚酮合成酶的结构域的不同。还原型结构域的冗余广泛存在于萘型安莎在苯安莎类抗生素的 myc 基因簇中克隆到 PKS 基因。目前仍有一些基因征不清楚的安沙霉素类化合物，如土霉素，它们代表着修饰异常的 AHB类抗生素比较，它们的生物合成是从 AHBA 开始，通过在聚酮合成酶上最初的 ANSA 结构经过氧化和/或重排发生较大的改变，形成这些不寻常

图 1-2 不同的 AHBA 生物合成基因簇（Qianjin K et al. 2012）Fig 1-2 DifferentAHBA biosynthetic gene clusters（Qianjin K et al. 2012）意的是，来自于萘型和苯型安莎类基因簇的 AHBA 合成酶表现出特了系统发育树的不同分支 (图 1-3)。更有意思的是，介于这两种类型酮合成酶的结构域的不同。还原型结构域的冗余广泛存在于萘型安苯安莎类抗生素的 myc 基因簇中克隆到 PKS 基因。目前仍有一些基不清楚的安沙霉素类化合物，如土霉素，它们代表着修饰异常的 AH抗生素比较，它们的生物合成是从 AHBA 开始，通过在聚酮合成酶初的 ANSA 结构经过氧化和/或重排发生较大的改变，形成这些不寻

【参考文献】：
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博士论文
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本文编号：2923432