利用全外显子组测序鉴定非综合征型唇腭裂的候选致病基因

发布时间：2020-12-18 17:35

　　目的(1)通过全外显子组测序搜寻非综合征型唇腭裂的候选致病基因。(2)通过对候选致病基因的验证,确定NSCL/P的致病基因。(3)探索致病基因在NSCL/P发病机制中的作用,为将来的基因诊断与基因治疗奠定基础。方法(1)在青岛大学附属医院口腔颌面外科收集30名非综合征型唇腭裂的患儿进行全外显子组测序。(2)通过过滤千人基因组数据库变异位点,保留1000G中频率低于0.01的变异位点;保留位于外显子区或剪接位点区的变异;过滤掉同义突变等不影响基因功能的突变,只保留影响基因功能的非同义突变、剪切位点等的突变;利用SIFT、Polyphen、MutationTaster、CADD这4个软件对位点有害性进行评估。(3)参考ACMG的证据对突变位点有害性进行分类,减少候选基因的数目。(4)对基因功能进行进一步的分析,预测NSCL/P可能的致病基因。(5)用PCR测序方法,在测序过的30名患儿中验证外显子组测序发现的突变位点以及在其他100名NSCL/P的患儿中检验候选致病基因的外显子中是否发生功能性突变。结果(1)经过全基因组外显子测序后,发现了506144个单核苷酸变异(single nucl... 

【文章来源】：青岛大学山东省

【文章页数】：49 页

【学位级别】：硕士

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期刊论文
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本文编号：2924337