乌珠穆沁羊Hoxd11、Hoxa11、Hoxc8基因克隆与多态分析

发布时间：2020-12-19 02:24

　　乌珠穆沁羊是内蒙古自治区独特的优良地方品种。在它基因中许多变异既有适应意义,又有生产应用的价值。多脊椎现象是乌珠穆沁羊生产性能中最普遍的,也是乌珠穆沁羊特有的现象,多脊椎羊比普通羊产肉量多,因此多脊椎乌珠穆沁羊受到普遍好评和欢迎,越来越引起科技工作者和广大牧民的重视。本研究选择可能影响多脊椎现象的Hoxa11、Hoxd11、Hoxc8基因作为候选基因,旨在分子水平上探索这三个基因的多态性与多脊椎乌珠穆沁羊的四种表型(T13L6、T13L7、T14L6、T14L7)中的关系进行研究,为展开多脊椎乌珠穆沁羊四种表型Hoxa11、 Hoxd11、Hoxc8基因的遗传学研究提供科学依据,为培育我国肉用绵羊品种奠定基础。本实验以40只乌珠穆沁羊作为研究对象,其中包含10只没有多脊椎现象的乌珠穆沁羊(T13L6),10只多一枚腰椎的乌珠穆沁羊(T13L7),10只多一枚胸椎的乌珠穆沁羊(T14L6),10只胸椎和腰椎各多一枚的乌珠穆沁羊(T14L7),采集了40个血液样本作为实验材料,根据已发布的特克赛尔绵羊的Hoxa11、Hoxd11和hoxc8三个基因的cDNA序列设计引物,扩增四种表型乌珠穆... 

【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
1 引言
    1.1 概述
    1.2 同源异形盒基因的研究
        1.2.1 同源异形盒基因的特点
        1.2.2 基因克隆与Homeobox基因的发现
        1.2.3 同源异形盒基因对脊椎动物的调控与控制
        1.2.4 同源异形盒基因的分类
    1.3 不同物质的Hox基因的研究现状
        1.3.1 果蝇的同源异位基因
        1.3.2 鼠的Homeobox基因
        1.3.3 鸡的Homeobox基因
        1.3.4 其它动物的Homeobox基因
        1.3.5 绵羊的Homeobox基因
    1.4 多脊椎乌珠穆沁羊候选基因研究的意义
        1.4.1 保护优质品种需加强遗传多样性研究
        1.4.2 培育新品种要基于标记辅助选择
    1.5 绵羊分子标记研究进展
        1.5.1 SNP分析方法
    1.6 试验中所涉及的实验方法的原理
        1.6.1 PCR技术的基本原理
        1.6.2 PCR的反应体系与反应条件
        1.6.3 引物设计与合成
    1.7 本研究的目的和意义
2 乌珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的克隆及序列分析
    2.1 材料与方法
        2.1.1 材料来源
        2.1.2 主要仪器设备及分析软件
        2.1.3 主要试剂
        2.1.4 主要溶液的配制
    2.2 实验方法
        2.2.1 血液基因组DNA提取试剂盒操作步骤
        2.2.2 PCR反应
        2.2.3 PCR产物的回收（DNA凝胶回收试剂盒）
        2.2.4 链接反应
        2.2.5 转化反应
        2.2.6 测序的拼接
        2.2.7 向数据库提交基因序列
    2.3 结果与分析
        2.3.1 DNA浓度和纯度检测
        2.3.2 乌珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll和Hoxc8基因的PCR扩增结果
        2.3.3 序列的拼接结果
        2.3.4 乌珠穆沁羊和几种动物Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的外显子比对
        2.3.5 小结
3 乌珠穆沁羊Hoxall、Hoxdll、Hoxc8基因的多态分析
    3.1 序列分析
    3.2 基因多态性的统计方法
        3.2.1 等位基因频率
        3.2.2 基因型频率
        3.2.3 多态信息含量、基因纯合度、基因杂合度和有效等位基因数
        3.2.4 群体Hardy-Weinberg平衡状态的检验
        3.2.5 基因型的独立性检验
        3.2.6 方差分析
    3.3 结果与分析
4 讨论
    4.1 样品DNA提取
    4.2 PCR扩增
    4.3 Hoxall、Hoxdll和Hoxc8基因多态与多脊椎的关系
        4.3.1 果蝇的Homeobox基因
        4.3.2 鼠的Homeobox基因
        4.3.3 鱼类的Homeobox基因
        4.3.4 鸡的Homeobox基因
        4.3.5 绵羊的Homeobox基因
        4.3.6 创新点
5 结论
附图
致谢
参考文献
附录1
附录2
附录3
作者简介



本文编号：2925075