铁皮石斛转录因子基因DoWRKY3的克隆与分子特性分析

发布时间：2020-12-24 03:07

　　目的克隆珍稀濒危药用植物铁皮石斛转录因子基因DoWRKY3,并进行生物信息学和表达模式分析。方法采用RT-PCR和RACE技术获取基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用软件DNASTAR 6.0和MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助定量PCR检测基因表达模式。结果分离到DoWRKY3基因（GenBank注册号KT957549）,cDNA全长2 065 bp,编码1条由509个氨基酸组成的多肽,相对分子质量55 580,等电点6.58;推定的DoWRKY3氨基酸序列具有植物WRKY蛋白家族保守的2个WRKY结构域（217²79、381⁴49）、2个WRKYGQK位点和2个C₂H₂型锌指结构元件(C-X₄-C-X_22-23-H-X₁-H);该蛋白预测无信号肽或跨膜域,定位在细胞核;DoWRKY3蛋白与多种植物WRKY蛋白一致性较高（46.3%⁵7.4%... 

【文章来源】：中草药. 2017年14期 北大核心

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料
2 方法
    2.1 RNA提取和c DNA合成
    2.2 RACE和q PCR验证
    2.3 序列分析
    2.4 定量PCR分析
3 结果与分析
    3.1 Do WRKY3基因全长克隆
    3.2 Do WRKY3基因编码的蛋白理化特性分析
    3.3 Do WRKY3蛋白结构域、定位和跨膜区分析
    3.4 Do WRKY3蛋白的三维建模
    3.5 Do WRKY3与植物WRKY蛋白序列比对分析
    3.6 Do WRKY3基因编码蛋白的系统进化树分析
    3.7 基因表达模式分析
4 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]铁皮石斛转录因子基因(DoWRKY2)的克隆与表达分析[J]. 赵俊,孟灿灿,赵亦帆,王晨曦,樊洪泓,金青,李大辉,林毅,蔡永萍.  农业生物技术学报. 2015(08)
[2]铁皮石斛转录因子基因DoWRKY1的克隆与表达分析[J]. 赵俊,孙时伟,孟灿灿,金青,樊洪泓,林毅,蔡永萍.  中国中药杂志. 2015(14)
[3]铁皮石斛化学成分研究[J]. 周佳,周先丽,梁成钦,苏小建,李伯林,卿亚艳,吴园娥.  中草药. 2015(09)
[4]铁皮石斛咖啡酰辅酶A氧甲基转移酶基因的分离与表达分析[J]. 张岗,胡本祥,张大为,陈伟,郭顺星.  中草药. 2014(08)



本文编号：2934857