SPGE技术优化及在溪荪花色调控相关基因表达研究中的应用
发布时间:2020-12-30 01:36
本实验以溪荪(Iris sanguinea)和白花溪荪(Iris sanginea f.albiflora)为研究材料,首先对从国外引进的用于mRNA直接提取的固相基因提取技术进行研究优化;其次,根据溪荪转录组数据库,运用RT-PCR方法从花瓣中分离出ANS、DFR、3GT基因,并对其进行生物信息学分析;最后将优化后的固相基因提取技术应用到ANS、DFR、3GT基因表达特性分析中探究花色呈色调控相关机理,其研究主要成果如下:(1)优选出价格便宜且操作更加简便快捷的国产探针(0.16*7mm,06Cr19Ni10)替代进口探针(0.14*6mm,0Cr18Ni9)应用于固相基因提取技术,并发明了探针处理使用的新型玻璃瓶固定架(专利号为ZL201720392787.X)和新型探针放置架(专利号为ZL201720192234.4)两项实用新型专利,其优化后的操作流程为:探针的预处理:依次用适量正丁烷、丙酮、乙醇分别清洗探针15min,80℃烘干箱烘干,之后加入固定比例的(3-糖氧丙基)三甲氧基硅烷、二甲苯、二异丙基乙胺混合液于80℃烘干箱孵化培养4h;探针的包埋:用适量乙酸乙酯清洗孵化培养后...
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:80 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2-1探针提取溪荪RNA??Figure?2-1?Probe?extracts?RNA?of?I.?sanguinea??
2.2.1不同规格探针对RNA提取质量的影响??2.2.1.1试验材料??固相基因提取技术优化所选用的实验探针如图2-2所示,分为0.22*5_、??0.16*7mm、0.14*6mm、0.25*13mm?四种规格,2?号为进口针,材质为?0Crl8Ni9,其余??三种为国产针,材质为〇6Crl9NilO。3号和4号探针可直接用手拿取,操作更加方便??快捷,而1号和2号探针则需要使用镊子夹取探针,其余试验材料同2.1.1。??■|n??图2-2不同规格的探针??Figure2-2?Probe?of?different?specifications??2.2.1.2试验方法??固相基因提取技术操作流程同2.1.2,其中预处理操作中探针孵化培养时间为12h,??-12-??
10Obp?U_??图2-7不同浓度Oligo?dt25对RNA提取质量的影响??Figure?2-7?Influence?of?different?concentrations?of?Oligo?dt25?on?the?extraction?quality?of?RNA??M:?DNA?标准分子量;CK:阴性对照;1:?lnM01igodt25,PCR产物;2:?3nM01igodt25,??PCR?产物;3:?5nM01igodt25,?PCR?产物.??M:?DNA?Marker?2000;?CK:?negative?control;?1:?product?of?1?|^M?Oligo?dt25;?2:?product?of?3|iM??Oligo?dt25;?3?:?product?of?5|xM?Oligo?dt25.??2.3.6贮存条件及时间优化??将优化处理后的探针置于干净的PCR管中,并置于封口袋中抽真空密封保存至4°C??冰箱中,分别于0d、7d、14d、21d、28d后取出提取溪荪叶片RNA,以此为模板反转??录成cDNA?—条链,经PCR扩增后的产物,1%琼脂糖凝胶电泳结果如图2-8所示,条??带1?(0d)、2?(7d)、3?(14d)亮度基本一致,条带4?(21d)亮度略有降低,条带5??(28d)
本文编号:2946719
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:80 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2-1探针提取溪荪RNA??Figure?2-1?Probe?extracts?RNA?of?I.?sanguinea??
2.2.1不同规格探针对RNA提取质量的影响??2.2.1.1试验材料??固相基因提取技术优化所选用的实验探针如图2-2所示,分为0.22*5_、??0.16*7mm、0.14*6mm、0.25*13mm?四种规格,2?号为进口针,材质为?0Crl8Ni9,其余??三种为国产针,材质为〇6Crl9NilO。3号和4号探针可直接用手拿取,操作更加方便??快捷,而1号和2号探针则需要使用镊子夹取探针,其余试验材料同2.1.1。??■|n??图2-2不同规格的探针??Figure2-2?Probe?of?different?specifications??2.2.1.2试验方法??固相基因提取技术操作流程同2.1.2,其中预处理操作中探针孵化培养时间为12h,??-12-??
10Obp?U_??图2-7不同浓度Oligo?dt25对RNA提取质量的影响??Figure?2-7?Influence?of?different?concentrations?of?Oligo?dt25?on?the?extraction?quality?of?RNA??M:?DNA?标准分子量;CK:阴性对照;1:?lnM01igodt25,PCR产物;2:?3nM01igodt25,??PCR?产物;3:?5nM01igodt25,?PCR?产物.??M:?DNA?Marker?2000;?CK:?negative?control;?1:?product?of?1?|^M?Oligo?dt25;?2:?product?of?3|iM??Oligo?dt25;?3?:?product?of?5|xM?Oligo?dt25.??2.3.6贮存条件及时间优化??将优化处理后的探针置于干净的PCR管中,并置于封口袋中抽真空密封保存至4°C??冰箱中,分别于0d、7d、14d、21d、28d后取出提取溪荪叶片RNA,以此为模板反转??录成cDNA?—条链,经PCR扩增后的产物,1%琼脂糖凝胶电泳结果如图2-8所示,条??带1?(0d)、2?(7d)、3?(14d)亮度基本一致,条带4?(21d)亮度略有降低,条带5??(28d)
本文编号:2946719
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