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高通量技术检测抑癌基因Pitx2静默后PanIN细胞中下游基因改变

发布时间:2021-01-08 01:27
  目的:运用小鼠基因转录本的全基因表达谱芯片,研究Pitx2基因静默前后胰腺上皮内瘤变(pancreatic intraepithelial neoplasia, PanIN)细胞下游基因表达谱的变化。方法 :应用小鼠全基因芯片检测Pitx2基因静默前后PanIN细胞基因表达谱的变化,并运用实时荧光定量多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)对部分芯片结果进行验证。结果:根据基因芯片筛选出差异倍数3倍以上的差异表达基因共97条。其中上调58条,涉及细胞增殖的基因包括Rac1、Ccr1、Fut9、PPP3CA、Sox5、Bmp7、Chtf18、Btg4、Flt4、Dscaml1和Pftk1;涉及细胞转移的基因包括Sesn1、Rpl7a、PPP3CA、Sox5、Bmp7、PIK3C2G、Cxcl12、Btg4和Kcnj14。下调39条,涉及细胞增殖的基因包括PPP2R2A、Nav1、PPP2R3C、Katnb1、Gpbp1、Nat3、Tgm5和PRKRA;涉及细胞转移的基因包括PPP2R2A、Lce1c、Hcn1、PPP2R3C、Tbxas1、Chrna1、... 

【文章来源】:内科理论与实践. 2020,15(04)

【文章页数】:7 页

【文章目录】:
材料与方法
    一、细胞株
    二、基因芯片
    三、细胞复苏与培养
    四、RNA提取
    五、单标记芯片实验
    六、实时定量PCR
    七、统计学方法
结果
    一、基因芯片结果
    二、Pan IN-P细胞与Pan IN-C细胞差异基因功能汇总
    三、实时定量PCR对部分芯片结果进行验证
讨论



本文编号:2963632

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