番茄PIN基因家族的全基因组分析及抗逆相关基因筛选鉴定
发布时间：2021-01-14 22:16
番茄原产于南美洲、波利维亚、厄瓜多尔等地。16世纪开始做观赏栽培,从20世纪20年代初开始作为我国蔬菜栽培,到20世纪20年代现已成为我国主要的蔬菜。番茄具有栽培方式容易多样、果实色泽鲜艳、营养价值丰富、产量高等优点。但其在生长发育过程中容易受逆境条件的影响而导致品质和产量下降。尤其是在蔬菜供应不足的季节,番茄常常会受到土壤盐渍化、洪涝、干旱等逆境的影响,严重制约着番茄的供应和生产。生长素是一类主要的植物激素,在植物的整个生命周期中自始至终扮演着关键作用,包括调控植物的茎干及花分生组织的形成、胚胎发育、顶端优势、向重力性及响应内外刺激等多个方面。因此,生长素极性运输、生长素信号转导以及生长素与逆境胁迫的关系逐渐引起了人们的兴趣,已有的研究成果表明生长素几乎参与植物生长发育的多个方面。生长素运输蛋白在膜上的极性定位可调控生长素极性运输,而PIN蛋白家族是一种公认的生长素输出载体。总之,一系列的的环境应激反应均会导致特殊区域极化并重新调整生长素的方向,其中就包括PINs蛋白亚细胞转运的下游调节。但是,例如重力因素,光照因素,和盐浓度等外界信号接受条件是如何影响PINs蛋白转运的正确机制还不...
【文章来源】：东北农业大学黑龙江省 211工程院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
SlPIN蛋白质的三级结构
注：红色表示 Short PINs；蓝色表示 Long PINs图 3-2 番茄、拟南芥、水稻、和高粱 PIN 生长素转运蛋白的进化分析Fig. 3-2 Phylogenetic relationships of PIN auxin transporters from tomato (Sl), Athaliana(At), Rice (Os) and Sorghum (Sb)番茄 PIN 基因家族保守结构域分析 DNAMAN Vesion 9 软件对番茄 PIN 基因的氨基酸序列进行多序列对比。结）番茄 PIN 氨基酸序列 N 端和 C 端具有高度保守的跨膜结构域，保守区域的央亲水区分开，且亲水区的长度是不均匀的。中央亲水区的长度在 317-382度在 47aa（SlPIN10）-243aa（SlPIN6）。long PINs 组的亲水环包含 C1、 V1、V2 特殊的可变结构域，而 short PINs 组的亲水区仅有恒定区 C1 和可变 C 端与可变区之间有一个对内吞作用中的膜蛋白与受体蛋白的互作非常重要NPXXY，其中仅有 SlPIN8 的酪氨酸（Y）由组氨酸（I）代替。表 1 中 PIN主要是由于位于蛋白两端的跨膜结构域之间的亲水区域长度不同而引起的。含 2 个可能的磷酸化位点（图中用黑色三角标记），中央亲水环的这些位点苏氨酸蛋白酶磷酸化。
27注： 为磷酸化位点； 为 NPXXY 保守结构；蓝色线为疏水区；红色线为亲水环图 3-3 SlPIN 蛋白的氨基酸序列比对Fig. 3-3 Alignment of amino acid sequences of SlPIN proteins3.1.5 SlPINs 保守基序的分析及染色体定位
【参考文献】：
期刊论文
[1]番茄抗旱基因工程研究进展[J]. 李金华,王亚玲,潘宇,苏承刚,张兴国. 中国蔬菜. 2017(12)
[2]苹果全基因组PIN成员鉴定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌发中的表达分析[J]. 刘小杰,樊胜,李国防,檀鸣,默宁,马娟娟,张东,韩明玉. 园艺学报. 2017(11)
[3]十字花科植物PIN3基因调控元件及表达分析[J]. 李玉军,赵燕,黄丽华,汤宾,黄妤,张学文. 中国农业大学学报. 2017(07)
[4]人参生长素极性运输基因PIN的表达谱研究[J]. 刘娟,陈同,袁媛,纪瑞锋,郭娟,王英平,王国良,黄璐琦. 药学学报. 2017(04)
[5]番茄PIN2基因的生物信息学分析[J]. 张春利,袁岐,赵婷婷,许向阳. 分子植物育种. 2017(07)
[6]生长素运输载体研究进展[J]. 俞晨良,董文其,张成浩. 延边大学农学学报. 2016(04)
[7]植物生长素响应冷胁迫反应的研究进展[J]. 陈丹,王卫安,岳全奇,赵琴. 植物生理学报. 2016(07)
[8]植物非生物胁迫的研究进展[J]. 于新海,李濛,周红昕. 农业与技术. 2016(09)
[9]番茄对非生物胁迫响应机制研究进展[J]. 徐佳宁,徐艳群,严振,张利云,高建伟. 山东农业科学. 2015(12)
[10]茶树生长素外运载体基因CsPIN3的克隆与表达分析[J]. 王博,曹红利,黄玉婷,胡玉荣,钱文俊,郝心愿,王璐,杨亚军,王新超. 作物学报. 2016(01)
博士论文
[1]干旱诱导基因TaDLea3的功能及在小麦不同生长期的时空表达规律研究[D]. 陈娟.西北农林科技大学 2016
[2]玉米WRKY转录因子Ⅱd亚族抗逆相关基因的鉴定及ZmWRKY17的功能分析[D]. 蔡荣号.安徽农业大学 2016
[3]棉花抗冷性鉴定及相关基因的表达研究[D]. 王俊娟.中国农业科学院 2016
[4]棉花（Gossypium hirsutum）DREB/CBF基因的筛选鉴定及其在植物抗逆应答中的功能研究[D]. 马刘峰.华中师范大学 2015
[5]两个E3泛素连接酶基因在水稻耐非生物逆境胁迫中的作用研究[D]. 方慧敏.南京农业大学 2014
[6]番茄SpMPKs基因响应非生物胁迫的功能分析[D]. 李翠.西北农林科技大学 2014
[7]陆地棉逆境胁迫相关同源基因的克隆及其在非生物胁迫下的表达特性分析[D]. 孟超敏.南京农业大学 2008
[8]番茄中病毒诱导基因沉默体系的建立及LeEIN2基因功能分析[D]. 傅达奇.中国农业大学 2005
硕士论文
[1]拟南芥NHX5和NHX6调节生长素转运蛋白PIN6的功能研究[D]. 徐艳丽.兰州大学 2017
[2]陆地棉GhSPO11-3基因的克隆与功能分析[D]. 梅丽琴.郑州大学 2017
[3]LYC-B沉默对番茄果实挥发性物质和品质性状的影响[D]. 吕洁.西北农林科技大学 2016
[4]万寿菊（Tagetes erecta）VIGS体系的建立与优化[D]. 张洪义.华中农业大学 2015
[5]利用VIGS技术沉默烤烟MYB基因的研究[D]. 曹晓玉.湖南农业大学 2014
[6]荠菜PIN基因表达与其心皮形态建成的相关性[D]. 朱占伟.湖南农业大学 2013
[7]增强UV-B辐射对番茄幼苗生理生化特性及内源激素含量的影响[D]. 张昌达.甘肃农业大学 2009
[8]水分胁迫下番茄幼苗多胺代谢变化及其与抗旱性的关系[D]. 张志新.西北农林科技大学 2009
[9]水稻PIN家族基因表达模式研究[D]. 王继荣.浙江大学 2008
本文编号：2977657
【文章来源】：东北农业大学黑龙江省 211工程院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
SlPIN蛋白质的三级结构
注：红色表示 Short PINs；蓝色表示 Long PINs图 3-2 番茄、拟南芥、水稻、和高粱 PIN 生长素转运蛋白的进化分析Fig. 3-2 Phylogenetic relationships of PIN auxin transporters from tomato (Sl), Athaliana(At), Rice (Os) and Sorghum (Sb)番茄 PIN 基因家族保守结构域分析 DNAMAN Vesion 9 软件对番茄 PIN 基因的氨基酸序列进行多序列对比。结）番茄 PIN 氨基酸序列 N 端和 C 端具有高度保守的跨膜结构域，保守区域的央亲水区分开，且亲水区的长度是不均匀的。中央亲水区的长度在 317-382度在 47aa（SlPIN10）-243aa（SlPIN6）。long PINs 组的亲水环包含 C1、 V1、V2 特殊的可变结构域，而 short PINs 组的亲水区仅有恒定区 C1 和可变 C 端与可变区之间有一个对内吞作用中的膜蛋白与受体蛋白的互作非常重要NPXXY，其中仅有 SlPIN8 的酪氨酸（Y）由组氨酸（I）代替。表 1 中 PIN主要是由于位于蛋白两端的跨膜结构域之间的亲水区域长度不同而引起的。含 2 个可能的磷酸化位点（图中用黑色三角标记），中央亲水环的这些位点苏氨酸蛋白酶磷酸化。
27注： 为磷酸化位点； 为 NPXXY 保守结构；蓝色线为疏水区；红色线为亲水环图 3-3 SlPIN 蛋白的氨基酸序列比对Fig. 3-3 Alignment of amino acid sequences of SlPIN proteins3.1.5 SlPINs 保守基序的分析及染色体定位
【参考文献】：
期刊论文
[1]番茄抗旱基因工程研究进展[J]. 李金华,王亚玲,潘宇,苏承刚,张兴国. 中国蔬菜. 2017(12)
[2]苹果全基因组PIN成员鉴定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌发中的表达分析[J]. 刘小杰,樊胜,李国防,檀鸣,默宁,马娟娟,张东,韩明玉. 园艺学报. 2017(11)
[3]十字花科植物PIN3基因调控元件及表达分析[J]. 李玉军,赵燕,黄丽华,汤宾,黄妤,张学文. 中国农业大学学报. 2017(07)
[4]人参生长素极性运输基因PIN的表达谱研究[J]. 刘娟,陈同,袁媛,纪瑞锋,郭娟,王英平,王国良,黄璐琦. 药学学报. 2017(04)
[5]番茄PIN2基因的生物信息学分析[J]. 张春利,袁岐,赵婷婷,许向阳. 分子植物育种. 2017(07)
[6]生长素运输载体研究进展[J]. 俞晨良,董文其,张成浩. 延边大学农学学报. 2016(04)
[7]植物生长素响应冷胁迫反应的研究进展[J]. 陈丹,王卫安,岳全奇,赵琴. 植物生理学报. 2016(07)
[8]植物非生物胁迫的研究进展[J]. 于新海,李濛,周红昕. 农业与技术. 2016(09)
[9]番茄对非生物胁迫响应机制研究进展[J]. 徐佳宁,徐艳群,严振,张利云,高建伟. 山东农业科学. 2015(12)
[10]茶树生长素外运载体基因CsPIN3的克隆与表达分析[J]. 王博,曹红利,黄玉婷,胡玉荣,钱文俊,郝心愿,王璐,杨亚军,王新超. 作物学报. 2016(01)
博士论文
[1]干旱诱导基因TaDLea3的功能及在小麦不同生长期的时空表达规律研究[D]. 陈娟.西北农林科技大学 2016
[2]玉米WRKY转录因子Ⅱd亚族抗逆相关基因的鉴定及ZmWRKY17的功能分析[D]. 蔡荣号.安徽农业大学 2016
[3]棉花抗冷性鉴定及相关基因的表达研究[D]. 王俊娟.中国农业科学院 2016
[4]棉花（Gossypium hirsutum）DREB/CBF基因的筛选鉴定及其在植物抗逆应答中的功能研究[D]. 马刘峰.华中师范大学 2015
[5]两个E3泛素连接酶基因在水稻耐非生物逆境胁迫中的作用研究[D]. 方慧敏.南京农业大学 2014
[6]番茄SpMPKs基因响应非生物胁迫的功能分析[D]. 李翠.西北农林科技大学 2014
[7]陆地棉逆境胁迫相关同源基因的克隆及其在非生物胁迫下的表达特性分析[D]. 孟超敏.南京农业大学 2008
[8]番茄中病毒诱导基因沉默体系的建立及LeEIN2基因功能分析[D]. 傅达奇.中国农业大学 2005
硕士论文
[1]拟南芥NHX5和NHX6调节生长素转运蛋白PIN6的功能研究[D]. 徐艳丽.兰州大学 2017
[2]陆地棉GhSPO11-3基因的克隆与功能分析[D]. 梅丽琴.郑州大学 2017
[3]LYC-B沉默对番茄果实挥发性物质和品质性状的影响[D]. 吕洁.西北农林科技大学 2016
[4]万寿菊（Tagetes erecta）VIGS体系的建立与优化[D]. 张洪义.华中农业大学 2015
[5]利用VIGS技术沉默烤烟MYB基因的研究[D]. 曹晓玉.湖南农业大学 2014
[6]荠菜PIN基因表达与其心皮形态建成的相关性[D]. 朱占伟.湖南农业大学 2013
[7]增强UV-B辐射对番茄幼苗生理生化特性及内源激素含量的影响[D]. 张昌达.甘肃农业大学 2009
[8]水分胁迫下番茄幼苗多胺代谢变化及其与抗旱性的关系[D]. 张志新.西北农林科技大学 2009
[9]水稻PIN家族基因表达模式研究[D]. 王继荣.浙江大学 2008
本文编号：2977657
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