缢蛏C型凝集素基因ScCTL-1和ScCTL-2的克隆鉴定与免疫功能研究
发布时间：2021-01-16 02:26
缢蛏（Sinonovacula constricta）是我国重要的海水养殖贝类之一。近年来,随着缢蛏高密度养殖的发展和养殖环境的不断恶化,细菌性疾病成为了缢蛏养殖中的一大问题。研究表明,C型凝集素（C-type lectin）作为一种模式识别受体（Pattern recognition receptor,PRR）,广泛参与贝类的免疫防御机制,在贝类免疫中占据着重要的地位。但目前为止,在缢蛏中尚少有关于C型凝集素研究的报道。本文克隆了2个缢蛏C型凝集素基因,并对它们的mRNA表达模式以及重组蛋白的免疫功能进行了研究。1.从之前构建的缢蛏转录组文库中获得了2个C型凝集素基因ScCTL-1和ScCTL-2的序列片段,使用RACE-PCR技术克隆得到它们的cDNA全长序列。序列分析结果表明,ScCTL-1基因cDNA全长2370bp,包含一个长度为1899bp的开放阅读框（Open reading frame,ORF）,编码632个氨基酸,蛋白相对分子量约为70.22kDa;ScCTL-2基因cDNA全长2194bp,包含一个长度为1893bp的ORF,编码630个氨基酸,蛋白相对分子量约为7...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
CTLD空间结构图
LD 的 Ca2+结合位点。4 个 Ca2+结合位点分别在人 ASGPR-I 与大鼠 MBP示，并用箭头指明编号。Ca-binding sites in CTLDs. Shown are ribbon diagrams of two representa, rat MBP-Aand human ASGPR-I, demonstrating the four typical locations of cLD. Ca2+ions are shown as black spheres, and numbers referenced to the diffee indicated next to the arrows[27].a2+依赖的糖类结合TLD 中，直接参与糖类结合的 Ca2+结合位点 2 拥有两个特征化基序和“WND”基序。两个基序与 Ca2+一同参与 CTLD 对糖类鼠 MBP-A 为例：大鼠 MBP-A 的“EPN”基序（E185，P186， 的长环区。位于基序中心顺式构象的脯氨酸是在所有 CTLD 中，它不参与 CTLD 的 Ca2+配合和糖类结合过程中化学键的形成侧氨基酸结构的作用。脯氨酸两侧的谷氨酸和天冬酰胺各自与键。大鼠 MBP-A 的“WND”基序（W204，N205，D206）位
16图 2-2 缢蛏两个 C 型凝集素的系统发育树分析。在 MEGA5 中使用邻近法对经ClustalW-generated 多重比对的 CTLD 序列进行系统发育树的构建。拓扑稳定性使用 10,000 次自动重复，图中数值表示置信度。Fig. 2-2 Phylogenetic tree constructed to show the 8 CTLDs of two C-type lectins from S. constrictawith other CTLDs. The phylogenetic tree was constructed by ClustalW-generated multiple sequencealignment of the amino acid sequences, using neighbor-joining in the MEGA 5 package. Thetopological stability of the neighbor-joining trees was evaluated using 10,000 bootstrappingreplications. The numbers at branches indicate the bootstrap values (%).
本文编号：2979973
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
CTLD空间结构图
LD 的 Ca2+结合位点。4 个 Ca2+结合位点分别在人 ASGPR-I 与大鼠 MBP示，并用箭头指明编号。Ca-binding sites in CTLDs. Shown are ribbon diagrams of two representa, rat MBP-Aand human ASGPR-I, demonstrating the four typical locations of cLD. Ca2+ions are shown as black spheres, and numbers referenced to the diffee indicated next to the arrows[27].a2+依赖的糖类结合TLD 中，直接参与糖类结合的 Ca2+结合位点 2 拥有两个特征化基序和“WND”基序。两个基序与 Ca2+一同参与 CTLD 对糖类鼠 MBP-A 为例：大鼠 MBP-A 的“EPN”基序（E185，P186， 的长环区。位于基序中心顺式构象的脯氨酸是在所有 CTLD 中，它不参与 CTLD 的 Ca2+配合和糖类结合过程中化学键的形成侧氨基酸结构的作用。脯氨酸两侧的谷氨酸和天冬酰胺各自与键。大鼠 MBP-A 的“WND”基序（W204，N205，D206）位
16图 2-2 缢蛏两个 C 型凝集素的系统发育树分析。在 MEGA5 中使用邻近法对经ClustalW-generated 多重比对的 CTLD 序列进行系统发育树的构建。拓扑稳定性使用 10,000 次自动重复，图中数值表示置信度。Fig. 2-2 Phylogenetic tree constructed to show the 8 CTLDs of two C-type lectins from S. constrictawith other CTLDs. The phylogenetic tree was constructed by ClustalW-generated multiple sequencealignment of the amino acid sequences, using neighbor-joining in the MEGA 5 package. Thetopological stability of the neighbor-joining trees was evaluated using 10,000 bootstrappingreplications. The numbers at branches indicate the bootstrap values (%).
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