家族性肾性糖尿致病基因SLC5A2与肾糖阈的相关性及RNA剪接分析
发布时间:2021-01-16 11:12
研究目的:家族性肾性糖尿(FRG)是一种罕见的肾小管疾病,其特征是孤立的持续性葡萄糖尿,无糖代谢异常和任何其他近端肾小管功能障碍的症状。绝大多数FRG患者由SLC5A2基因(OMIM182381)突变所致。本研究旨在进一步扩大FRG患者的SLC5A2基因突变分析,探讨基因型与肾糖阈(RTG)之间的联系。再者,基于所报道的SLC5A2外显子变异缺乏mRNA水平的研究,本研究也探索了点突变对前体mRNA剪接的影响。研究方法:1检测9个FRG家系25位家庭成员的24小时尿葡萄糖定量和肾葡萄糖阈值。PCR法扩增SLC5A2全部编码区及其侧翼序列,直接测序法分析基因突变特点。比较不同基因型患者(杂合子和复合杂合子;c.886(-10-31)del杂合子和其他杂合子)肾糖阈的差异。2运用生物信息学在线软件(BDGP和HSF 3.1)预测人类基因突变数据库(HGMD,2019.01)已经报道的假定的SLC5A2错义突变,筛选对经典剪接位点和剪接调控序列如外显子剪接增强子(ESEs)和外显子剪接沉默子(ESSs)有潜在影响的点突变。采用构建迷你基因的方法验证候选外显子突变对剪接的...
【文章来源】:青岛大学山东省
【文章页数】:52 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2本研宄中的复合杂合突变与杂合突变患者以及c.886(-10_-31>del与其他杂合突变患者间肾??
图3本研宄中纳入的从C5A错义变异的位置和迷你基因的示意图
结果??内含子序列(距3号外显子5’末端的内含子序列大小:55bp,距3号外显子3’末端??的内含子序列大小:203bp)及相应的突变型迷你基園。野生型(pSPL3Ex3)和突??变型(c.216C>A和c.294C>A)迷你基因被转染入HEK293T细胞中RT-PCR实验??结果示,对照组产生2条电泳带(368?bp的含有3号外甚子的条带,263?bp不含该??外显子的条带),而两个突变型的均只产生一条263?bp的条带(图5)?直接测序??结果表明263?bp的条带为pSPL3载体上两个0有的外显子序列。因此,这两个突变??均导致3号外显子的跳跃。mRNA转录本中缺失3号外显子将导致SGLT2蛋白缺??失35个氣基酸(第67-101位氨基酸),但并不引起开放阅读框的移码突变。我们??考虑c.216C>A和c.294C>A突变产生剪接突变的原_为突变所在的3号外显子存在??较弱的剪接供点(得分〇.〇〇,BDGP分析),相应位.点的突变导致ESEs的破坏及??ESSs的形成,ESSs招募hnRNPAl,抑制临近剪接位点的识别力量和剪接效应,进??而抑制剪接识别力_^最终导致3号外显子跳跃。??500bpB??bp?250?bp?■??100?bp?|??B?/?C?,\???pSPL3?exon?5*?i?<pSPL3?exon?3’???pSPL3?exon?5*?j?pSPL3?exon?3’???CTCTAGAGTCGACCCAGCAACCTG?6?AGATCTCCCGAGGG?C?TCTAGAGTCGACCCA6?CAACCTG?GAGATCTCCCGAGGG??WT?B?Ex3?KB
本文编号:2980727
【文章来源】:青岛大学山东省
【文章页数】:52 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2本研宄中的复合杂合突变与杂合突变患者以及c.886(-10_-31>del与其他杂合突变患者间肾??
图3本研宄中纳入的从C5A错义变异的位置和迷你基因的示意图
结果??内含子序列(距3号外显子5’末端的内含子序列大小:55bp,距3号外显子3’末端??的内含子序列大小:203bp)及相应的突变型迷你基園。野生型(pSPL3Ex3)和突??变型(c.216C>A和c.294C>A)迷你基因被转染入HEK293T细胞中RT-PCR实验??结果示,对照组产生2条电泳带(368?bp的含有3号外甚子的条带,263?bp不含该??外显子的条带),而两个突变型的均只产生一条263?bp的条带(图5)?直接测序??结果表明263?bp的条带为pSPL3载体上两个0有的外显子序列。因此,这两个突变??均导致3号外显子的跳跃。mRNA转录本中缺失3号外显子将导致SGLT2蛋白缺??失35个氣基酸(第67-101位氨基酸),但并不引起开放阅读框的移码突变。我们??考虑c.216C>A和c.294C>A突变产生剪接突变的原_为突变所在的3号外显子存在??较弱的剪接供点(得分〇.〇〇,BDGP分析),相应位.点的突变导致ESEs的破坏及??ESSs的形成,ESSs招募hnRNPAl,抑制临近剪接位点的识别力量和剪接效应,进??而抑制剪接识别力_^最终导致3号外显子跳跃。??500bpB??bp?250?bp?■??100?bp?|??B?/?C?,\???pSPL3?exon?5*?i?<pSPL3?exon?3’???pSPL3?exon?5*?j?pSPL3?exon?3’???CTCTAGAGTCGACCCAGCAACCTG?6?AGATCTCCCGAGGG?C?TCTAGAGTCGACCCA6?CAACCTG?GAGATCTCCCGAGGG??WT?B?Ex3?KB
本文编号:2980727
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