星豹蛛CYP3313A3基因克隆与生物信息学分析

发布时间：2021-01-23 06:47

　　[目的]星豹蛛是农业害虫的重要捕食性天敌,本课题组通过转录组测序鉴定出66条星豹蛛细胞色素P450基因,筛选分析出5条基因预测其与外源物质代谢有关,选取其中一条基因进行克隆并进行生物信息学分析。[方法]本试验采用RT-PCR技术,将提取的星豹蛛总RNA进行反转录PCR扩增,用割胶回收的扩增产物完成克隆及测序,并对CYP3313A3基因编码产物进行生物信息学分析。[结果]克隆到CYP3313A3基因序列,该基因开放阅读框为906bp,编码301个氨基酸,其相对分子质量为34. 38 kDa,等电点6. 12,原子总数4 865,分子式C₁₅₄₆H₂₄₅₁N₄₀₃O₄₄₉S₁₆;其中正电荷残基36个,占氨基酸总数的12%,负电荷残基39个,占氨基酸总数的13%,编码蛋白存在细胞色素P450 3A亚族特征基序,其编码的蛋白的二级结构中,α螺旋为45. 18%,β折叠为14. 29%,β转角为3. 32%,无规则卷曲为37. 21%,亚细胞定位结果显示在内质网上。对其编码的蛋白进行信号... 

【文章来源】：山西农业大学学报(自然科学版). 2020,40(04)北大核心

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 试验材料
    1.2 主要试剂
    1.3 星豹蛛总RNA的提取及cDNA的合成
    1.4 CYP3313A3基因克隆
    1.5 CYP3313A3基因及其编码产物的生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 CYP3313A3基因克隆
    2.2 CYP3313A3编码的蛋白理化性质分析
    2.3 CYP3313A3跨膜预测、信号肽和亚细胞定位分析
    2.4 CYP3313A3编码的蛋白二级结构预测分析
    2.5 CYP3313A3编码的蛋白三级结构预测
    2.6 系统发育分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]家蚕抗性基因细胞色素P450的研究进展[J]. 高瑞娜.  特种经济动植物. 2019(04)
[2]薇甘菊颈盲蝽细胞色素P450 PmCYP4基因克隆及表达分析[J]. 张传光,泽桑梓,朱家颖,季梅,刘凌,张乃明.  生物安全学报. 2019(01)
[3]除草剂对星豹蛛活动行为的影响[J]. 袁泽斌,郭钢钢,白晓雪,常俊楠,李慧芳,李锐.  植物保护学报. 2017(02)
[4]3种重金属对星豹蛛SOD与CAT活性的影响[J]. 张晓阳,马敏,李锐,李生才.  内蒙古农业大学学报(自然科学版). 2015(06)
[5]温度诱导对星豹蛛热激蛋白hsp70和hsp90基因表达的影响[J]. 李锐,刘佳,李萨丽,李娜,李生才,洪坚平.  植物保护学报. 2015(03)
[6]低剂量杀虫剂对星豹蛛捕食效应的影响及其机理[J]. 李锐,李娜,刘佳,李生才,洪坚平.  生态学报. 2014(10)
[7]家蚕细胞色素P450基因CYP6AE2的分子克隆与序列分析[J]. 艾均文,董元凌,孔卫青,杨金宏,刘劲,张永亮,张学松,柳照应,朱勇.  蚕业科学. 2007(03)
[8]昆虫细胞色素P450基因的克隆及其策略[J]. 李显春,王荫长,韩召军.  华东昆虫学报. 1999(02)

博士论文
[1]飞蝗细胞色素P450基因的分子特性及功能研究[D]. 郭艳琼.山西大学 2012

硕士论文
[1]星豹蛛生物学研究及卵黄蛋白特性分析[D]. 姬娜.山西农业大学 2017
[2]基于转录组测序的星豹蛛细胞色素P450的基因鉴定与差异表达分析[D]. 李萨丽.山西农业大学 2017



本文编号：2994760