仿刺参夏眠抗氧化防御调控功能基因的表达与多态性研究
发布时间：2021-01-30 02:58
仿刺参是我国重要的水产养殖对象,当海水温度升高到一定范围时会进入夏眠。夏眠过程延长养殖周期,增加养殖风险,是仿刺参研究领域的热点。FoxO（Forkhead box O）作为转录调节因子,在调节体内活性氧（ROS）的水平及细胞增殖分化、转录调控、应激调控、免疫调节、信号转导途径等方面起重要作用,Nrf1（NF-E2-related factor1）作为转录因子,在遭到氧化应激时被Keap1（kelch-like ECH-associated protein-1）激活,结合抗氧化反应元素ARE,它调节一系列抗氧化基因并参与氧化应激。过氧化物氧还蛋白（Prx）是生物体抗氧化系统的重要组成部分。因此FoxO、Keap1、Nrf1、及Prxs重要防御调控基因对于抗氧化防御系统有重要作用。本研究将选定的抗氧化防御调控基因与多个物种的氨基酸序列进行比较,进行多重序列比对和同源性分析以确定其序列的可靠性。为了研究夏眠对仿刺参各组织抗氧化功能及FoxO、Keap1、Nrf1、Prxs基因表达的影响,将仿刺参以15士0.5℃暂养7 d后,以1℃/d升温直至达到目的温度,之后保持25±0.5℃范围10 d...
【文章来源】：大连海洋大学辽宁省
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
仿刺参FoxO氨基酸序列与其他物种的FoxO氨基酸序列的多序列比对根据一致性不同用不同程度的暗色背景显示
图 2-2 仿刺参Keap1氨基酸序列与其他物种的Keap1氨基酸序列的多序列比对根据一致性不同用不同程度的暗色背景显示。用来进行比对的序列包括：紫色球海胆Strongylocentrotus purpuratus 的XP_003724241.1，棘冠海星Acanthaster planci的XP_022109754.1，斑马鱼Danio rerio的 NP_878284.2，人Homo sapiens的NP_987096.1。Fig.2-2 Multiple sequence alignment analysis of Keap1 partial sequences from A. japonicus andother species. Different degrees of dark background are displayed according to the consistency.（3）筛选获得的仿刺参 Nrf1 基因片段长为 939bp，推导的氨基酸序列长为313aa，将其氨基酸序列 NCBI 数据库中筛选出的紫色球海胆（S.purpurat-us；XP_011683764.1）、棘冠海星（A. planci; XP_022081665.1）、斑马鱼（D. rerio;AAH44537.1）、人（H.sapiens; AAH16925.1）氨基酸序列进行比对，发现 Nrf1和大多数动物有着较高的序列相似性，相似性为 24%-56% ，其中与棘皮动物的氨基酸相似性为 56% ，非棘皮动物的氨基酸相似性为 24%，与多个物种的氨
图 2-3 仿刺参Nrf1氨基酸序列与其他物种的Nrf1氨基酸序列的多序列比对根据一致性不同用不同程度的暗色背景显示。用来进行比对的序列包括：紫色球海胆Strongylocentrotus purpuratus 的XP_011683764.1，棘冠海星Acanthaster planci的XP_022081665.1，斑马鱼Danio rerio 的AAH44537.1，人Homo sapiens 的AAH16925.1。Fig.2-3 Multiple sequence alignment analysis of Nrf1 partial sequences from A. japonicus andother species. Different degrees of dark background are displayed according to the consistency.（4）筛选获得的仿刺参 PRDX2 基因片段长为 342bp，推导的氨基酸序列长为 114aa，将其氨基酸序列 NCBI 数据库中筛选出的紫色球海胆（S.purpur-atus;AHJ80827.1 ） 、 日 本 沼 虾 （ M.nipponensei; ALD62538.1 ） 、 阿 根 廷 蚁（L.humile；XP_012221533.1）、大蜜蜂（A.dorsata;XP_006621026.1）氨基酸序列进行比对，发现 PRDX2 和大多数软体动物有着较高的序列相似性，相似性为 66%-83% ，其中棘皮动物氨基酸相似性为 83% ，非棘皮动物的氨基酸相
【参考文献】：
期刊论文
[1]异育银鲫过氧化物还原酶基因的克隆及其表达分析[J]. 税典章,陈胜峰,吴萍,叶元土,陈佳,张晶晶. 四川动物. 2018(01)
[2]DNA分子标记技术在小麦遗传育种中的应用综述[J]. 周喜旺,刘鸿燕,王娜,南海,赵尚文,魏志平,岳维云,张耀辉,宋建荣,曹世勤. 甘肃农业科技. 2017(05)
[3]Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白-核因子E2相关因子2-抗氧化反应元件信号通路在氧化应激中的作用及其调控剂[J]. 马燕芬,吴志红,赵磊,高民. 动物营养学报. 2017(04)
[4]大菱鲆生长性状相关单核苷酸多态位点的多家系验证[J]. 田涛,王伟继,陈再忠,胡玉龙,王陌桑,吕丁,李之乡. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2016(12)
[5]氧化应激中ROS对FOXO3a转录因子的调控作用研究进展[J]. 李昂,邢雅琪,李晓霞,章吉威,郭会彩. 中国药理学通报. 2016(09)
[6]猪FOXO3基因的多态性和生长性状关联分析[J]. 陈亚楠,黄涛,唐中林,翟腾蛟,马立鹏,李梦寻,沈永巧. 石河子大学学报(自然科学版). 2016(02)
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[8]三疣梭子蟹生长相关SNP位点的鉴定[J]. 张德宁,吕建建,刘萍,冯艳艳,高保全,李健. 中国水产科学. 2015(03)
[9]影响仿刺参生长的主要因子研究进展[J]. 李乐,王宇辰,高磊,李云峰,高祥刚,苏浩,鲍相渤,刘卫东,赫崇波. 水产科学. 2015(01)
[10]日本沼虾过氧化物还原酶基因的克隆及其表达分析[J]. 孙盛明,戈贤平,傅洪拓,朱健,张世勇. 中国水产科学. 2014(03)
博士论文
[1]Keap1/Nrf2通路在子痫前期氧化应激发病机制中调控作用的研究[D]. 冯浩.山东大学 2017
[2]仿刺参热胁迫响应的分子调控特征研究与SNP标记筛选[D]. 徐冬雪.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2016
[3]郑州地区城市居民2型糖尿病危险因素分析及SIRT1和FOXO1单核苷酸多态性与糖尿病肾病的关联研究[D]. 赵艳艳.郑州大学 2014
[4]仿刺参（Apostichopus japonicus）转录组分析与遗传图谱构建[D]. 杜慧霞.中国海洋大学 2013
[5]刺参Apostichopus japonicus （Selenka）夏眠分子机理的基础研究[D]. 王天明.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2011
[6]中国对虾（Fenneropenaeus chinensis）基因组SNP标记的开发与应用[D]. 张建勇.中国海洋大学 2011
[7]普通牛FoxO1、FoxO3、FoxO4基因的克隆、表达及其对肉质性状的遗传效应分析[D]. 王玲.四川农业大学 2010
[8]海湾扇贝抗氧化相关基因的克隆、表达和结构分析[D]. 李娟.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2010
[9]转录因子NF-E2相关因子在砷诱导的人类HaCaT细胞抗氧化反应和细胞毒性中作用的研究[D]. 赵锐.中国医科大学 2010
[10]刺参（Apostichopus Japonicus）对温度变化的生态生理学响应机制[D]. 纪婷婷.中国海洋大学 2009
硕士论文
[1]刺参5-HT4R活性特征及生理功能初探[D]. 杨振.浙江海洋大学 2017
[2]葱蝇Fox家族基因的鉴定，FoxO基因的克隆、特征及与滞育相关的表达[D]. 申力.重庆师范大学 2014
[3]家蚕Foxo基因的克隆及其在丝腺程序性细胞死亡中的功能研究[D]. 周炳卿.苏州大学 2012
[4]刺参（Apostichopus japonicus）在夏眠过程中生理代谢调控机制的研究[D]. 任庆印.中国海洋大学 2012
[5]人工参礁对刺参诱集效果的试验研究[D]. 张俊波.中国海洋大学 2011
[6]基于表达序列标签的玉米单核苷酸多态性标记开发[D]. 吴玲.四川农业大学 2010
本文编号：3008104
【文章来源】：大连海洋大学辽宁省
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
仿刺参FoxO氨基酸序列与其他物种的FoxO氨基酸序列的多序列比对根据一致性不同用不同程度的暗色背景显示
图 2-2 仿刺参Keap1氨基酸序列与其他物种的Keap1氨基酸序列的多序列比对根据一致性不同用不同程度的暗色背景显示。用来进行比对的序列包括：紫色球海胆Strongylocentrotus purpuratus 的XP_003724241.1，棘冠海星Acanthaster planci的XP_022109754.1，斑马鱼Danio rerio的 NP_878284.2，人Homo sapiens的NP_987096.1。Fig.2-2 Multiple sequence alignment analysis of Keap1 partial sequences from A. japonicus andother species. Different degrees of dark background are displayed according to the consistency.（3）筛选获得的仿刺参 Nrf1 基因片段长为 939bp，推导的氨基酸序列长为313aa，将其氨基酸序列 NCBI 数据库中筛选出的紫色球海胆（S.purpurat-us；XP_011683764.1）、棘冠海星（A. planci; XP_022081665.1）、斑马鱼（D. rerio;AAH44537.1）、人（H.sapiens; AAH16925.1）氨基酸序列进行比对，发现 Nrf1和大多数动物有着较高的序列相似性，相似性为 24%-56% ，其中与棘皮动物的氨基酸相似性为 56% ，非棘皮动物的氨基酸相似性为 24%，与多个物种的氨
图 2-3 仿刺参Nrf1氨基酸序列与其他物种的Nrf1氨基酸序列的多序列比对根据一致性不同用不同程度的暗色背景显示。用来进行比对的序列包括：紫色球海胆Strongylocentrotus purpuratus 的XP_011683764.1，棘冠海星Acanthaster planci的XP_022081665.1，斑马鱼Danio rerio 的AAH44537.1，人Homo sapiens 的AAH16925.1。Fig.2-3 Multiple sequence alignment analysis of Nrf1 partial sequences from A. japonicus andother species. Different degrees of dark background are displayed according to the consistency.（4）筛选获得的仿刺参 PRDX2 基因片段长为 342bp，推导的氨基酸序列长为 114aa，将其氨基酸序列 NCBI 数据库中筛选出的紫色球海胆（S.purpur-atus;AHJ80827.1 ） 、 日 本 沼 虾 （ M.nipponensei; ALD62538.1 ） 、 阿 根 廷 蚁（L.humile；XP_012221533.1）、大蜜蜂（A.dorsata;XP_006621026.1）氨基酸序列进行比对，发现 PRDX2 和大多数软体动物有着较高的序列相似性，相似性为 66%-83% ，其中棘皮动物氨基酸相似性为 83% ，非棘皮动物的氨基酸相
【参考文献】：
期刊论文
[1]异育银鲫过氧化物还原酶基因的克隆及其表达分析[J]. 税典章,陈胜峰,吴萍,叶元土,陈佳,张晶晶. 四川动物. 2018(01)
[2]DNA分子标记技术在小麦遗传育种中的应用综述[J]. 周喜旺,刘鸿燕,王娜,南海,赵尚文,魏志平,岳维云,张耀辉,宋建荣,曹世勤. 甘肃农业科技. 2017(05)
[3]Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白-核因子E2相关因子2-抗氧化反应元件信号通路在氧化应激中的作用及其调控剂[J]. 马燕芬,吴志红,赵磊,高民. 动物营养学报. 2017(04)
[4]大菱鲆生长性状相关单核苷酸多态位点的多家系验证[J]. 田涛,王伟继,陈再忠,胡玉龙,王陌桑,吕丁,李之乡. 中国海洋大学学报(自然科学版). 2016(12)
[5]氧化应激中ROS对FOXO3a转录因子的调控作用研究进展[J]. 李昂,邢雅琪,李晓霞,章吉威,郭会彩. 中国药理学通报. 2016(09)
[6]猪FOXO3基因的多态性和生长性状关联分析[J]. 陈亚楠,黄涛,唐中林,翟腾蛟,马立鹏,李梦寻,沈永巧. 石河子大学学报(自然科学版). 2016(02)
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[8]三疣梭子蟹生长相关SNP位点的鉴定[J]. 张德宁,吕建建,刘萍,冯艳艳,高保全,李健. 中国水产科学. 2015(03)
[9]影响仿刺参生长的主要因子研究进展[J]. 李乐,王宇辰,高磊,李云峰,高祥刚,苏浩,鲍相渤,刘卫东,赫崇波. 水产科学. 2015(01)
[10]日本沼虾过氧化物还原酶基因的克隆及其表达分析[J]. 孙盛明,戈贤平,傅洪拓,朱健,张世勇. 中国水产科学. 2014(03)
博士论文
[1]Keap1/Nrf2通路在子痫前期氧化应激发病机制中调控作用的研究[D]. 冯浩.山东大学 2017
[2]仿刺参热胁迫响应的分子调控特征研究与SNP标记筛选[D]. 徐冬雪.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2016
[3]郑州地区城市居民2型糖尿病危险因素分析及SIRT1和FOXO1单核苷酸多态性与糖尿病肾病的关联研究[D]. 赵艳艳.郑州大学 2014
[4]仿刺参（Apostichopus japonicus）转录组分析与遗传图谱构建[D]. 杜慧霞.中国海洋大学 2013
[5]刺参Apostichopus japonicus （Selenka）夏眠分子机理的基础研究[D]. 王天明.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2011
[6]中国对虾（Fenneropenaeus chinensis）基因组SNP标记的开发与应用[D]. 张建勇.中国海洋大学 2011
[7]普通牛FoxO1、FoxO3、FoxO4基因的克隆、表达及其对肉质性状的遗传效应分析[D]. 王玲.四川农业大学 2010
[8]海湾扇贝抗氧化相关基因的克隆、表达和结构分析[D]. 李娟.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2010
[9]转录因子NF-E2相关因子在砷诱导的人类HaCaT细胞抗氧化反应和细胞毒性中作用的研究[D]. 赵锐.中国医科大学 2010
[10]刺参（Apostichopus Japonicus）对温度变化的生态生理学响应机制[D]. 纪婷婷.中国海洋大学 2009
硕士论文
[1]刺参5-HT4R活性特征及生理功能初探[D]. 杨振.浙江海洋大学 2017
[2]葱蝇Fox家族基因的鉴定，FoxO基因的克隆、特征及与滞育相关的表达[D]. 申力.重庆师范大学 2014
[3]家蚕Foxo基因的克隆及其在丝腺程序性细胞死亡中的功能研究[D]. 周炳卿.苏州大学 2012
[4]刺参（Apostichopus japonicus）在夏眠过程中生理代谢调控机制的研究[D]. 任庆印.中国海洋大学 2012
[5]人工参礁对刺参诱集效果的试验研究[D]. 张俊波.中国海洋大学 2011
[6]基于表达序列标签的玉米单核苷酸多态性标记开发[D]. 吴玲.四川农业大学 2010
本文编号：3008104
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