宏基因组学揭示鳗鲡养殖环境微生物抗性基因的赋存特征

发布时间：2021-02-07 19:22

　　为揭示鳗鲡养殖环境中抗生素抗性基因（Antibiotic resistance genes,ARGs）的赋存特征,采集鳗鲡养殖环境样品（底泥和养殖水）,利用高通量测序技术及功能宏基因组学分析方法对鳗鲡养殖环境中的ARGs种类和丰度进行研究。结果显示:鳗鲡养殖底泥和养殖水中的优势菌群结构组成具有明显差异,底泥的优势群体门类为Proteobacteria、Chloroflexi、Actinobacteria、Cyanobacteria、Gemmatimonadetes和Bacteroidetes;养殖水中的优势菌群门类为Proteobacteria、Bacteroidetes和Verrucomicrobia。比对抗性基因数据库,在底泥中共存在10类38种ARGs,在养殖水中共注释得到9类29种ARGs,其中高丰度的抗性类型为四环素类、磺胺类和杆菌肽类抗生素。研究结果可为抗生素在鳗鲡养殖过程中合理使用提供参考依据,同时也显示宏基因组测序技术在检测环境ARGs的可行性和优越性。 

【文章来源】：福建农业科技. 2020,(09)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 基因组DNA提取
    1.3 Illumina测序及高通量数据处理
2 结果与分析
    2.1 高通量测序序列数据分析
    2.2 鳗鲡养殖环境菌群结构和多样性分析
    2.3 鳗鲡养殖环境微生物基因组抗性基因分析结果
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]草鱼肠道微生物抗生素抗性基因研究[J]. 赵帝,徐在言,吴山功,熊凡,郝耀彤.  水生态学杂志. 2019(06)
[2]海南东寨港海水和沉积物中抗生素抗性基因污染特征研究[J]. 姜春霞,黎平,李森楠,刁晓平,黄炜,王道儒,叶翠杏.  生态环境学报. 2019(01)
[3]养殖水域抗生素抗性基因污染的研究概况与展望[J]. 李云莉,高权新,张晨捷,施兆鸿,彭士明,王建钢.  海洋渔业. 2017(03)
[4]环境微生物的抗生素抗性和抗性组[J]. 田宝玉,马荣琴.  中国生物工程杂志. 2015(10)

博士论文
[1]低剂量抗生素刺激条件下耐药基因水平传播的机制研究[D]. 鲁曦.华南理工大学 2012



本文编号：3022706