西南桦肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析

发布时间：2021-02-09 02:53

　　为研究肉桂酰辅酶A还原酶基因（CCR）在西南桦木质素合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到1个具完整开放阅读框的肉桂酰CoA还原酶基因（BaCCR）,该基因全长975 bp,编码324个氨基酸。序列比对分析显示西南桦CCR蛋白序列与胡桃、欧洲栓皮栎、梅、甜樱桃的蛋白序列相似性均在80%以上。BaCCR拥有CCR蛋白的NADP结合域和底物结合域KNWYCYGK。进化分析表明,BaCCR与梅、甜樱桃、亚洲棉、葡萄聚为一个枝系。转录模式分析表明,BaCCR基因在根和小枝中高量表达。 

【文章来源】：西部林业科学. 2020,49(05)北大核心

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

CCR蛋白序列比对

图1 CCR蛋白序列比对由图2可知,进化树分为3个支系,西南桦与亚洲棉(Gossypium arboreum,XP_017617353.1)、葡萄(Vitis vinifera,XP_010648113.1)、梅、甜樱桃聚为1个支系,其中与梅、甜樱桃的亲缘关系较近。

该蛋白由324个氨基酸残基组成,其分子式为C1602H2561N423O464S14,分子质量为35 620.35,理论等电点为7.04。BaCCR蛋白无跨膜结构域,为亲水性蛋白。对BaCCR氨基酸序列的二级结构进行预测,有α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲和延伸链4种二级结构,以α-螺旋和无规则卷曲为主(图4)。图4 BaCCR蛋白二级结构预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于Maxent模型的贵州省天然黄杉林的潜在分布预测研究[J]. 李望军,冯图,周瑞伍,何斌,崔涛,邓芳芳,彭明春.  西部林业科学. 2019(03)
[2]基于Maxent模型的假臭草潜在分布区预测[J]. 郭燕青,史梦竹,李建宇,傅建炜,吴梅香.  热带亚热带植物学报. 2019(03)
[3]猴耳环中抗炎活性成分3,3’-新木质素的含量测定及指纹图谱研究[J]. 陈少茹,张诚光,李智勇,詹利之.  江西中医药. 2019(02)
[4]人参潜在地理分布以及气候变化对其影响预测[J]. 赵泽芳,卫海燕,郭彦龙,顾蔚.  应用生态学报. 2016(11)
[5]物种分布模型理论研究进展[J]. 李国庆,刘长成,刘玉国,杨军,张新时,郭柯.  生态学报. 2013(16)
[6]木质素的结构研究与应用[J]. 路瑶,魏贤勇,宗志敏,陆永超,赵炜,曹景沛.  化学进展. 2013(05)
[7]8种植物CHI基因的生物信息学分析[J]. 原晓龙,周军,辛培尧,董娇,孟富宣,付海辉.  西南林业大学学报. 2013(02)
[8]五味子中木质素类活性成分的高效液相色谱分析[J]. 白晶,于治国.  化学工程师. 2009(05)
[9]植物肉桂酰辅酶A还原酶基因的结构功能及应用潜力[J]. 李魏,谭晓风,陈鸿鹏.  经济林研究. 2009(01)
[10]我国西南桦研究的回顾与展望[J]. 曾杰,郭文福,赵志刚,翁启杰,尹光天,郑海水.  林业科学研究. 2006(03)

硕士论文
[1]基于MaxEnt的物种空间分布预测不确定性分析[D]. 尚忠慧.陕西师范大学 2016



本文编号：3024925