JAM3基因在食管癌中的甲基化及表达调控
发布时间:2021-02-25 23:30
背景食管癌是常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率在全球分别位居第7位和第6位。食管癌的分布具有地域性特点,在我国食管癌主要分布在太行山地区,食管鳞状细胞癌(ESCC)是主要的病理类型。环境因素通过改变遗传学和表观遗传学修饰在食管癌的发生、发展中起着重要的作用。连接黏附分子-3(JAM3)是JAM家族中的一员,又称连接黏附分子-C(JAMC)。最近发现JAM3在结直肠癌中频繁发生甲基化,且JAM3在结直肠癌中为抑癌基因,但是JAM3基因在食管癌中的甲基化情况尚不清楚。目的探讨JAM3基因启动子区在食管癌中的甲基化情况及其表达调控以及JAM3基因启动子区异常甲基化作为食管鳞癌的潜在诊断标志物的可能性。方法1.用半定量RT-PCR检测5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-Aza-dc)处理前后食管癌细胞系KYSE140、KYSE150、KYSE410、KYSE450、COLO680N、KYSE520和TE13中JAM3基因的表达情况。2.应用甲基化特异性PCR(MSP)检测食管癌细胞系中JAM3基因启动子区的甲基化状态。3.用MSP技术检测正常食管粘膜组织中JAM3基因启动子区的甲基化状态,排除JA...
【文章来源】:新乡医学院河南省
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
-Aza-dc处理前后食管癌细胞系中JAM3的表达情况;
25胞中JAM3表达水平不变,KYSE150、KYSE410、COLO680N、TE13细胞JAM3表达恢复(见图2.1)。上述结果表明JAM3基因在食管癌细胞系中的表达受到甲基化的调控。图2.15-Aza-dc处理前后食管癌细胞系中JAM3的表达情况;(-)未处理的细胞系;(+):处理的细胞系;ddH2O:双蒸馏水,作为空白对照,排除体系污染;GAPDH:作为参照检测cDNA质量;KYSE520、KYSE140、KYSE450、KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150为人的食管癌细胞系名称2.2食管癌细胞中JAM3基因启动子区甲基化情况2.2.1对照组DNA对甲基化特异性PCR的引物及体系进行验证我们应用JAM3基因特异性的甲基化的引物进行PCR扩增之后,MSP检测硫化后IVD和NL,结果显示:硫化后IVD为甲基化所对应的清晰明亮条带,硫化后NL无甲基化对应条带;JAM3基因特异性的非甲基化的引物进行PCR扩增之后,MSP检测硫化后IVD和NL,结果显示:仅以硫化后的NL为非甲基化清晰明亮条带,硫化后IVD无非甲基化所对应的条带出现。阴性对照即双蒸馏水中无任何条带出现(见图2.2)。上述结果表明:JAM3的MSP引物具有特异性,反应体系无污染。图2.2MSP检测对照组DNAJAM3基因启动子区甲基化情况IVD:体外甲基化DNA;ddH2O:双蒸馏水;NL:正常人外周血淋巴细胞DNA;M:甲基化;U:非甲基化;
262.2.2食管癌细胞系中JAM3基因启动子区甲基化情况本实验所应用MSP技术检测JAM3基因启动区在食管癌细胞系中甲基化情况。MSP检测结果示:JAM3基因启动子区在细胞KYSE520、KYSE140、KYSE450表现为非甲基化;在细胞KYSE150、KYSE410、TE13、COLO680N中呈完全甲基化状态(见图2.3)。图2.3MSP检测食管癌细胞系JAM3基因启动子区甲基化情况IVD:体外甲基化DNA;ddH2O:双蒸馏水;NL:正常人外周血淋巴细胞DNA;M:甲基化;U:非甲基化;KYSE520、KYSE140、KYSE450、KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150为人的食管癌细胞系名称2.2.3正常食管黏膜中JAM3基因启动子区甲基化状态本研究应用MSP技术对5例正常食管黏膜组织中JAM3基因启动子区的甲基化状态进行检测,结果显示正常食管黏膜组织中JAM3均为非甲基化,排除了JAM3基因甲基化的组织特异性(见图3.1)。图3.1MSP检测正常食管粘膜组织中JAM3基因启动子区域的甲基情况IVD:体外甲基化DNA;ddH2O:双蒸馏水;NL:正常人外周血淋巴细胞DNA;EN1-EN5:正常食管黏膜组织;M:甲基化;U:非甲基化
本文编号:3051738
【文章来源】:新乡医学院河南省
【文章页数】:57 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
-Aza-dc处理前后食管癌细胞系中JAM3的表达情况;
25胞中JAM3表达水平不变,KYSE150、KYSE410、COLO680N、TE13细胞JAM3表达恢复(见图2.1)。上述结果表明JAM3基因在食管癌细胞系中的表达受到甲基化的调控。图2.15-Aza-dc处理前后食管癌细胞系中JAM3的表达情况;(-)未处理的细胞系;(+):处理的细胞系;ddH2O:双蒸馏水,作为空白对照,排除体系污染;GAPDH:作为参照检测cDNA质量;KYSE520、KYSE140、KYSE450、KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150为人的食管癌细胞系名称2.2食管癌细胞中JAM3基因启动子区甲基化情况2.2.1对照组DNA对甲基化特异性PCR的引物及体系进行验证我们应用JAM3基因特异性的甲基化的引物进行PCR扩增之后,MSP检测硫化后IVD和NL,结果显示:硫化后IVD为甲基化所对应的清晰明亮条带,硫化后NL无甲基化对应条带;JAM3基因特异性的非甲基化的引物进行PCR扩增之后,MSP检测硫化后IVD和NL,结果显示:仅以硫化后的NL为非甲基化清晰明亮条带,硫化后IVD无非甲基化所对应的条带出现。阴性对照即双蒸馏水中无任何条带出现(见图2.2)。上述结果表明:JAM3的MSP引物具有特异性,反应体系无污染。图2.2MSP检测对照组DNAJAM3基因启动子区甲基化情况IVD:体外甲基化DNA;ddH2O:双蒸馏水;NL:正常人外周血淋巴细胞DNA;M:甲基化;U:非甲基化;
262.2.2食管癌细胞系中JAM3基因启动子区甲基化情况本实验所应用MSP技术检测JAM3基因启动区在食管癌细胞系中甲基化情况。MSP检测结果示:JAM3基因启动子区在细胞KYSE520、KYSE140、KYSE450表现为非甲基化;在细胞KYSE150、KYSE410、TE13、COLO680N中呈完全甲基化状态(见图2.3)。图2.3MSP检测食管癌细胞系JAM3基因启动子区甲基化情况IVD:体外甲基化DNA;ddH2O:双蒸馏水;NL:正常人外周血淋巴细胞DNA;M:甲基化;U:非甲基化;KYSE520、KYSE140、KYSE450、KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150为人的食管癌细胞系名称2.2.3正常食管黏膜中JAM3基因启动子区甲基化状态本研究应用MSP技术对5例正常食管黏膜组织中JAM3基因启动子区的甲基化状态进行检测,结果显示正常食管黏膜组织中JAM3均为非甲基化,排除了JAM3基因甲基化的组织特异性(见图3.1)。图3.1MSP检测正常食管粘膜组织中JAM3基因启动子区域的甲基情况IVD:体外甲基化DNA;ddH2O:双蒸馏水;NL:正常人外周血淋巴细胞DNA;EN1-EN5:正常食管黏膜组织;M:甲基化;U:非甲基化
本文编号:3051738
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