三个品系大白猪的ESR、FSHβ和PRLR基因多态性及其与产仔性状的关联分析

发布时间：2021-02-26 13:04

　　本研究以美系、丹系和加系三个品系的大白猪为实验对象:（1）共测定201头三个品系大白猪个体的线粒体D-loop区核苷酸序列,结合从NCBI下载的227个来自中国、韩国、日本、俄罗斯以及印度尼西亚的野猪个体信息,分析三个品系间大白猪的遗传多态性及亲缘关系;（2）选取影响母猪产仔性状的三个候选基因雌激素受体（ESR）、促卵泡激素β亚基（FSHβ）和催乳素受体（PRLR）,采用PCR扩增及直接测序法对ESR基因的3号、6号以及8号外显子区域、FSHβ基因的3号外显子区域、PRLR基因的10号外显子区域进行SNPs位点检测,并将检测到的SNPs位点与母猪产仔性状进行关联性分析,从而筛选出有利于提高母猪产仔性状的优势基因型。结果如下:（1）三个品系的大白猪亲缘关系研究结果:在201头大白猪D-loop区域中共检测到了34个多态位点,其中包括单一多态位点7个,简约信息位点27个,检测到19种单倍型,单倍型多样性为0.891±0.008,核苷酸多样性为0.01198±0.00034。系统发育分析表明三个品系大白猪间的种群分化情况不明显,初步发现大白猪与中国、日本、韩国、俄罗斯等亚洲东北部地区猪种的遗... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：79 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
符号说明
第一章 文献综述
    1 前言
    2 大白猪品种及不同品系介绍
        2.1 大白猪
        2.2 美系、丹系、加系大白猪
    3 分子标记技术的研究概述
        3.1 扩增片段长度多态性技术（AFLP）
        3.2 随机扩增多态性DNA技术（RAPD）
        3.3 限制性片段长度多态性技术（RFLP）
        3.4 单核苷酸多态性（SNP）
        3.5 单链构象多态性技术（SSCP）
        3.6 简单重复序列技术（SSR）
    4 线粒体基因研究概况
        4.1 线粒体D-loop基因简介
        4.2 线粒体基因多态性在猪种分子系统学研究中的应用
    5 雌激素受体基因（ESR）研究概况
        5.1 ESR基因的发现与结构
        5.2 ESR的生物学作用
        5.3 ESR基因与产仔数性状的相关性研究
    6 卵泡刺激素β亚基基因（FSHβ）研究概况
        6.1 FSHβ基因的发现与结构
        6.2 FSHβ的生物学作用
        6.3 FSHβ基因与产仔数性状的相关性研究
    7 催乳素受体基因（PRLR）研究概况
        7.1 PRLR基因的发现与结构
        7.2 PRLR的生物学作用
        7.3 PRLR基因与产仔数性状的相关性研究
    8 研究目的与意义
第二章 材料与方法
    1 试验材料
        1.1 试验动物
        1.2 主要试验仪器及设备
        1.3 主要试验试剂及配制
        1.4 分析软件
    2 试验方法及步骤
        2.1 基因组DNA提取
        2.2 DNA纯度及浓度检测
        2.3 目的片段PCR扩增
    3 数据处理及分析
        3.1 遗传多态性分析及系统发育树构建
        3.2 基因及基因型频率计算
        3.3 Hardy-Weinberg平衡检验
        3.4 多态信息含量（PIC）计算
        3.5 连锁不平衡及单倍型构建
        3.6 ESR、FSHβ、PRLR基因与产仔性状的相关性分析
第三章 结果与分析
    1 毛囊基因组DNA提取效果
    2 线粒体基因D-loop区多态性及系统发育分析
        2.1 PCR扩增产物检测
        2.2 遗传多样性分析
        2.3 系统发育树构建
    3 ESR基因多态性及关联分析
        3.1 ESR基因PCR扩增产物检测
        3.2 ESR基因SNPs位点检测
        3.3 ESR基因的等位基因频率及基因型频率
        3.4 ESR基因连锁不平衡及单倍型分析
        3.5 ESR基因与大白猪产仔性状的关联性分析
    4 FSHβ基因多态性及关联分析
        4.1 FSHβ基因PCR扩增产物检测
        4.2 FSHβ基因SNPs位点检测
        4.3 FSHβ基因的等位基因频率及基因型频率
        4.4 FSHβ基因连锁不平衡及单倍型分析
        4.5 FSHβ基因与大白猪产仔性状的关联性分析
    5 PRLR基因多态性及关联分析
        5.1 PRLR基因PCR扩增产物检测
        5.2 PRLR基因SNPs位点检测
        5.3 PRLR基因的等位基因频率及基因型频率
        5.4 PRLR基因连锁不平衡及单倍型分析
        5.5 PRLR基因与大白猪产仔性状的关联性分析
第四章 讨论
    1 关于毛囊基因组DNA提取
    2 线粒体DNA多态性
    3 ESR基因
        3.1 ESR基因多态性
        3.2 ESR基因与猪产仔性状的关系
    4 FSHβ基因
        4.1 FSHβ基因多态性
        4.2 FSHβ基因与猪产仔性状的关系
    5 PRLR基因
        5.1 PRLR基因多态性
        5.2 PRLR基因与猪产仔性状的关系
第五章 结论
参考文献
致谢
作者简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]大白母猪PTGS2基因内含子3的SNP检测及其与繁殖性状的关联分析[J]. 高玉森,董新星,张燕林,兰国湘,计春律,严达伟,苟潇,李明丽,鲁绍雄.  云南农业大学学报(自然科学). 2018(06)
[2]嘉兴黑猪FSHβ和RFRP基因外显子多态性与繁殖性状的相关分析[J]. 吴芬,宋倩倩,李海虹,汪海峰,许明曙,刘国良,张金枝.  中国畜牧杂志. 2018(09)
[3]丹系母猪断奶后发情和排卵规律的研究[J]. 赵云翔,邓浩辉,黄山珊,张豪,马胤,周玉,朱晓萍.  畜牧与兽医. 2018(04)
[4]FSH-β、PRLR和FUT1基因多态性与母猪繁殖性状的关联性分析[J]. 李梦寻,胡九英,孙敬礼,鲁慧文,汪德明,王忻,刘乙,马力鹏,李涛,沈永巧,来红霞,黄涛.  江苏农业科学. 2018(03)
[5]大自然:丹系种猪营养配方先行官[J]. 满少鹏.  今日养猪业. 2017(05)
[6]分子标记技术在家禽育种中的应用[J]. 魏倩倩.  农民致富之友. 2017(17)
[7]大白猪ESR基因多态性与繁殖性状的相关性研究[J]. 胡闪耀,姜佳佳,杨华,毛翠,毛慧敏,王利通,王国水,左波.  猪业科学. 2017(07)
[8]FSHβ基因对从江香猪母猪繁殖性能的影响[J]. 李俊,陈大芳,张勇,熊胜利,龙清孟,张雄,白优,陆静,冯文武,李平,王燕,李波,侯萍.  养猪. 2017(03)
[9]PRLR和ITGB1基因多态性对大白猪繁殖性能的影响[J]. 沈永巧,胡九英,孙敬礼,鲁慧文,汪德明,黄涛.  石河子大学学报(自然科学版). 2017(02)
[10]黑龙江省规模化猪场ESR基因多态性检测分析[J]. 张冬杰,曹越,汪亮,刘娣.  黑龙江畜牧兽医. 2017(07)

博士论文
[1]猪PRLR基因和FSHβ亚基基因多态性研究[D]. 曹果清.山西农业大学 2004

硕士论文
[1]嘉兴黑猪繁殖性状相关基因ESR、FSHβ、PRLR多态性及其关联分析研究[D]. 镡忠斌.浙江农林大学 2015
[2]3个猪种的PRLR和ESR基因多态性及其与繁殖性能的关联分析[D]. 陈耀闽.福建农林大学 2013
[3]豫南黑猪与引进猪种FSHβ和PRLR基因多态性及其与繁殖性能的关联性分析[D]. 冯富彦.河南农业大学 2010



本文编号：3052627