上海市伪狂犬病病毒相关毒力基因分子变异分析

发布时间：2021-03-01 19:53

　　为了解伪狂犬病病毒（pseudorabies virus,PRV）4种主要毒力基因（gB、gC、gD和gE）的分子特征和变异情况,采用PCR技术,对2010—2015年分离到的28株PRV进行基因扩增和测序。结果显示:2010—2015年分离毒株的gB、gC、gD和gE基因均存在多位点突变,且位于抗原表位区;与2010年分离毒株的gD基因相比,2012年后分离毒株存在6个连续氨基酸插入。基于gB、gC、gD和gE基因的进化树显示:上海市2010年分离的4个毒株与2012年以后分离的毒株虽属于同一大的分支,但与经典毒株亲缘关系近,处于同一小的分支中;2012年分离毒株与2011年后国内变异株亲缘关系近,处于另一分支中。这些毒力基因抗原表位区域氨基酸的突变可能导致其毒力及抗原性发生改变;2012年以后分离毒株均为变异株,并已成为上海市的主要流行毒株。本研究为PRV分子致病机制及分子流行病学研究提供了依据。 

【文章来源】：中国动物检疫. 2020,37(07)

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

PRV gB基因扩增产物

测序结果显示，上海市2010—2015年分离毒株gB基因序列全长为2.8 kb，编码914个氨基酸残基组成的多肽。它们之间的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为99.6%～100%和98.7%～100%，与GeneBank上国内外其他18株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为98.2%～100%和96.0%～100%（图2）。与国内Ea毒株的氨基酸序列相比，存在6个位点的氨基酸一致性替换，即T82A、G393D、R451K、H560K、P735L、T737A。应用Mega 5.0软件中的Clustal W方法，将测出的10株PRV gB基因核苷酸序列与GenBank上已登录的国内外其他18株PRV相应序列进行遗传距离分析，利用NeighborJoining方法绘制了系统发育进化关系（图3）。基于gB基因进化树，PRV毒株可划分为2个基因型Group1和Group2。上海市2010年分离毒株与2012年以后分离毒株处于不同的进化分支，均与国内Ea株亲缘关系较近，属于同一大进化分支（Group2），而与以欧美洲毒株为代表的Group1亲缘关系较远。图3 PRV gB基因进化树分析结果

PRV gB基因进化树分析结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]伪狂犬病病毒湖北株糖蛋白gD基因的克隆及序列测定[J]. 王家富,张楚瑜,丁建华,周荣,温淑娟,黄镇华.  病毒学报. 2000(01)



本文编号：3057951