虹鳟热应激相关miRNA及其靶基因鉴定、生物信息学分析及靶向关系验证

发布时间：2021-03-01 23:45

　　虹鳟是典型的冷水性鱼类,对较高水温的耐受能力差,随着全球气候变暖,夏季高温对虹鳟养殖的威胁越来越严重,鉴定虹鳟应答高温刺激的相关基因,在基因表达的不同层次上理解热应激的响应策略和调控机理,可以为虹鳟耐高温遗传选育和改良、发掘虹鳟抗高温的各种措施提供理论基础。microRNA（miRNA）是一类对基因进行转录后调控的单链小分子RNA。目前,热应激下虹鳟miRNA的研究还未见文献报道,因此,本研究选取全同胞家系的虹鳟作为试验材料,取对照组（18℃）和热处理组（24℃）各3尾雌鱼的肝脏和头肾,用llumina HiSeq 2500测序平台和生物信息学方法,对虹鳟肝脏和头肾组织miRNAs进行系统性分析,鉴定热应激下差异表达的miRNAs,并揭示新的虹鳟特异miRNAs;接着分别从肝脏和头肾RNA-seq和small RNA-seq结果中筛选出稳定表达的mRNAs（肝脏5个,头肾5个）和miRNAs（肝脏4个,头肾5个）,通过geNorm,NormFinder,BestKeeper和ComparativeΔCt四种方法同时评估这些基因和四个常用参考基因和一个小的非编码RNA（U6）的表达稳定性... 

【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省

【文章页数】：146 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

miRNA的合成与作用机理Fig.1-1GeneratingandactionmechanismofmiRNA

smallRNA文库制备Fig.2-1ThePreparationofLibraryforsmallRNAs

smallRNA序列生物信息学分析


本文编号：3058198