基于线粒体COI基因对云南省不同水系外来入侵生物福寿螺的系统发育学研究

发布时间：2021-03-05 06:22

　　[目的]福寿螺（Pomacea sp.）是一种水生软体动物,小管福寿螺（P.canaliculata）被认定为全球性入侵生物,并造成严重危害。该螺于上世纪80年代中后期入侵至云南省,随后扩散至10个州市33个县,破坏入侵地的原有生态。小管福寿螺也是广州管圆线虫的主要中间宿主,威胁人类公共卫生安全,近年来云南省已有多例人广州管圆线虫病的病例报道。本论文以云南省地域内的三大水系（澜沧江、怒江、元江）为研究范围,以入侵生物福寿螺为研究对象,基于线粒体氧化色素酶1基因（COI）标志调查福寿螺的分布情况及其种类。同时对所有样本进行单倍型及分子发育分析,拟揭示三大水系的福寿螺分子种群构成,解析其入侵、定殖以及扩散的规律。[方法]本研究采用区域抽样法选择了云南省澜沧江、怒江与元江水系等所流经的9个州/市（区/县）,总共5个区域,27个采样点。对上述调查点州市的农贸市场,以及周边区域田间、地头、池塘、菜地、水沟、鱼塘等福寿螺易孳生地内是否有福寿螺踪迹,若发现存在福寿螺,采样带回实验室,取样本腹足部分抽提全基因组DNA,常规PCR扩增样本的COI序列,并测序。利用MEGA6.0采用最大似然法构建所有测序... 

【文章来源】：昆明医科大学云南省

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２云南福寿螺样本采集分布图??ｉｓＴ??＾临沧市／?、玉溪??飞★★?ｒ?ＳＡ?Ｌ?文山州?Ｊ??Ｖｉｔ卿河州、广？＾??

?昆明医科大学硕士研究生学位论文???２云南不同水系福寿螺ＣＯＩ基因序列测定??２．?１?ＣＯＩ基因ＰＣＲ扩增与序列确认??运用ＣＯＩ通用引物（ＬＣＯ１４９０，ＨＣＯ２１９８）对３４４份ＤＮＡ样本进行ＰＣＲ扩增，凝??胶电泳检测，其扩增产物片段大小为７００ｂｐ?（见图３），送公司经测序后共获得３４４条??ＣＯＩ基因有效序列，将测序所获得的３４４条序列登录到ＮＣＢＩ?ＢＬＡＳＴ数据库中进行比??对，其所有序列比对Ｑｕｅｒｙ?ｃｏｖｅｒａｇｅ覆盖率、一致率均达到９９％以上，可以确定均为福寿??螺序列，其中可初步确认在３４４条序列中，有４条序列为斑点福寿螺序列，但由于样本??量过少，故后续研究分析就不对这几条序列进行进化树、单倍型分析。??图３?ＰＣＲ扩增电泳图（Ｍ：?ＤＬ?２０００?Ｍａｒｋｅｒ；?１－７６为福寿螺样品的基因组ＤＮＡ；?７：阴性对照ｄｄＨ２０）??３云南省不同水系福寿蟪系统发育研宄结果??系统发育分析表明云南省３条水系５个区域存在福寿螺属三个种的入侵，分别为：??小管福寿螺（８４．?５９％）、斑点福寿螺（Ａ?ｆｆｌａｃｗｉａｔａ，１．１６％）以及一个福寿螺未定种??（／＾／ｒａｃｅａｓｐ．，１４．?２４％）。其中，＿沧江上游水系区域的大理州洱源县；中游水系区域，??临沧市爱华镇、耿马镇；下游水系区域，普洱市西盟县、景洪市勐罕镇、嘎栋乡；怒江??２６??

?昆明医科大学硕士研究生学位论文???Ｇｒｏｕｐ?ａ?ＰｃＨ２６Ｖ?ＰｃＨ２？??ＰｃＨ３７ｑ?ＱＪ?Ｑ?ＰｃＨ２２??Ｔ垃恳??ＰｃＨ３９?Ａｘ＾Ｈｉｒ＇ｏ??ＰＭ＆＾／ｒｒ＜Ｓｙ＾ＰｃＨ１Ｊ??ＰｃＨ７?（Ｊ）?Ｐｃ￥ｌ４??ＰｃＨ２４?Ｉ５ｊ?５－?１??Ｇｒｏｕｐ?ｂ??ＰｃＨ２１??〇：??ｉ?上１?＾Ｗ２Ｈ１８??ＰｃＨ２Ｔ?ＰｃＨ４?图?５－２??ＰｃＨ４８??—?Ａ??（Ｊ??Ｏ??ＰｃＨ４９??ｍ?５３??注：图５－１，?５－２，?５－３中ＰｃＨ代表云南以及其他国家小管福寿螺单倍型，饼图大小代表单倍型不??同的数目，饼图中不同的颜色代表不同的国家??３７??


本文编号：3064732