甚于全基因组甲基化芯片技术筛选和验证结直肠癌相关基因异常甲基化研究

发布时间：2021-03-08 19:25

　　研究背景和目的结直肠癌（colorectal cancer,CRC）是威胁人类健康的最常见恶性肿瘤之一。2018年,全球结直肠癌发病例数约为180万,结直肠癌死亡例数约为86万。我国是上世纪的结直肠癌低发国家之一。然而,近年来随着我国社会经济的高速发展,传统的饮食结构和生活方式被打破,居民的肿瘤发生率和肿瘤谱已发生明显变化。结直肠癌发病率呈明显上升趋势,已成为威胁我国居民健康的重要公共卫生问题。结直肠癌的发生发展是环境因素、遗传因素和表观遗传因素共同参与下的多因素、多阶段、多步骤过程,具有较长的癌前病变阶段。现阶段对于结直肠癌的遗传变异因素研究已相对成熟,而表观遗传学研究则方兴未艾。DNA甲基化是表观遗传学中最重要的调控机制之一,可通过调控编码基因转录水平,参与胚胎发育、印记失活、细胞分化以及衰老等多种重要生物学过程。通过以往的候选基因分析以及表观基因组关联研究（epigenome-wide association study,EWAS）,已识别出不少与结直肠癌发生相关的异常甲基化基因,并发现异常甲基化改变在癌前病变阶段已经存在。然而目前很少有研究系统性地定义肠上皮细胞恶性转化过程中异... 

【文章来源】：浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：136 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

研究总体技术路线图

浙江大学博士学位论文2材料与方法19表6样本DNA提取质量结果样本编号浓度(ng/μl)体积(μl)总量(μg)A260/A280A260/A23001258.509023.271.902.2402138.609012.471.902.3803234.009021.061.912.4004298.309026.851.922.4005141.809012.761.912.4006108.90909.801.942.4507167.609015.081.922.4208301.509027.141.932.3909294.309026.491.922.4010326.109029.351.912.3711174.009015.661.902.4412262.109023.591.892.1313180.409016.241.902.3514226.609020.391.922.4215199.909017.991.912.371699.90908.991.922.4717270.809024.371.912.3718179.309016.141.932.411999.10908.921.892.4620115.709010.411.892.4021211.308016.901.912.1522263.209023.691.912.4123323.109029.081.902.2724404.709036.421.902.31图3DNA完整性琼脂凝胶电泳图

浙江大学博士学位论文2材料与方法202.7.3焦磷酸测序质量控制在焦磷酸测序实验的准备阶段，合成目标DNA序列完全未甲基化标准品（甲基化程度0%）和完全甲基化标准品（甲基化程度100%）。将0%甲基化标准品和100%甲基化标准品按比例稀释为0%，25%，50%，75%和100%浓度，以5梯度标准品对焦磷酸测序进行质量控制，评价检测结果的准确性。如图4所示，采用Pearson相关系数分析检测结果显示，检测值与标准值之间的相关系数R大于0.99（P<0.001），表明焦磷酸测序检测结果的准确度高。图4焦磷酸测序检测结果准确性分析图

【参考文献】：
期刊论文
[1]2015年中国恶性肿瘤流行情况分析[J]. 郑荣寿,孙可欣,张思维,曾红梅,邹小农,陈茹,顾秀瑛,魏文强,赫捷.  中华肿瘤杂志. 2019 (01)



本文编号：3071544