基于全基因组数据对丹参普遍胁迫蛋白基因的研究

发布时间：2021-03-08 19:39

　　丹参（Salvia miltiorrhiza Bunge）是唇形科鼠尾草属植物,其药用部位根和根茎中含有多种活性成分,被广泛应用于心血管类疾病的治疗。丹参具有外源基因转化体系成熟、基因组小等优势,被认为是一种“模式药用植物”。随着全球气候变暖、土壤盐渍化等环境问题加重,人工种植丹参的产量越来越受到各种逆境胁迫的制约。普遍胁迫蛋白（USP）是一种能广泛响应多种胁迫,提高微生物和植物抗逆能力的蛋白,目前在丹参中对该类蛋白的研究非常有限。本实验基于丹参基因组数据库,利用拟南芥中的UspA保守结构域序列在丹参的数据库中检索并确认了 32个含有UspA结构域的丹参普遍胁迫蛋白基因（SmUSP）家族成员,利用生物信息学方法研究了 32个成员的基本性质以及它们的进化关系。然后,通过qRT-PCR技术研究了 32个成员在丹参的根、茎、叶、花和种子中的表达模式,以及它们对盐、热、盐和热的共同胁迫的响应情况。最后,从克隆得到的9个成员中选择了 3个构建到原核表达载体中,检测过表达SmUSP基因的大肠杆菌对盐、热以及它们的共同胁迫的抵御能力。本研究为深入研究SmUSP基因的功能,培育抗逆能力强的丹参新品种提... 

【文章来源】：陕西师范大学陕西省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

不同胁迫共同作用对植物造成的影响总结}syFigI-2Summaryofeffectsforvariousstresscombinationsonplants.

第１章文献综述述??构是由一系列ａ螺旋和ｐ折叠组成，这些结构都跟ＵＳＰ蛋白的ＡＴＰ结，如图１－３［６３］。随后，Ｓｏｕｓａ等对流感嗜血杆菌中的ＵＳＰ蛋白（１ＪＭＶ）究，发现其序列与大肠杆菌中ＵｓｐＡ蛋白具有６８％的一致性，但和ＭＪ０的是，１ＪＭＶ蛋白不能结合ＡＴＰ［６７］。这些证据表明，ＵｓｐＡ结构域可以一种可以结合ＡＴＰ，以ＭＪ０５７７蛋白为代表；另一种不能结合ＡＴＰ，以为代表［６８］。Ｚａｒｅｍｂｉｎｓｋｉ等人通过对ＭＪ０５７７及其亚家族中其他ＵｓｐＡ对比发现，ＵｓｐＡ蛋白的空间结构与人的电子转运黄素蛋白、ＤＮＡ光酰ｔＲＮＡ合成酶空间结构十分相似％］，Ａｒａｖｉｎｄ等人的进化分析也发现在进化上的亲缘关系，于是他们提出，ＵｓｐＡ家族是－个功能分化程度族［６９］。??

拟南芥基因６个，丹参基因６个。Ｃ组中有９个成员，其中拟南芥基因４个，丹参??基因５个。Ｂ组最少，共有２个成员，拟南芥和丹参中各１个。??对丹参中３２个ＵＳＰ家族成员进行保守基序分析结果如图２－２：??１００［??ＳｔｎＵＳＰ４?？?—?———??Ａ＇ｊｌ?＇??ＳｍＵＳＰ１３？?Ｍ??１?Ｓｎ，ＵＳＰ２０．?？??ＳｍＵＳＰ１４？??１００＞??ＳｍＵＳＰ３１？??＊－Ｊ．?Ｉ?ＳｍＵＳＰＩＳ＊?＿＿??ＳｔｎＵＳＰＯ?？??Ａ１???ＳｍＵＳＰ２４?？?＊＊＊??１００１??ＳｍＵＳＰ２５？?—?—?—???ＳｍＵＳＰ２３？??■?－－???—?ＳｍＵＳＰ”??．?－ＳｍＵＳＰＢ＊?＊＊?＊?１??ｗ??—?Ｉ?１００１??Ｓｍ〇ＳＰ１９？?ｆ＾３Ｃ５ｒ：＾＾＊??［?Ｉ?ＳｍＵＳＰ２６？?■■■■??＿〇ｓ｜?Ｉ??ＳｍＵＳＰ２７？?＿＿＿＿＿＿??１?＇?＜ｔｍ￣｜?！??ＳｍＵＳＰＩＢ＊?■■■■??ｌＯＯ?＞?ＳｍＵ８Ｐ３２？?■■■■■■■■■??．?ＳｍＵＳＰＩＯ＊?＿＿＿＿＿?????—Ｉ????ＳｍＵＳＰ２?？?麵＾＾＾＊??ｈｄ，—￣?ｓｍｕｓｐｓ．?—?■＾■圓???〇〇［－＾＼—?Ｓｎ

【参考文献】：
期刊论文
[1]丹酚酸B在心血管疾病中药理作用研究进展[J]. 林超,刘兆国,钱星,姚远,徐斌,卞慧敏.  中国药理学通报. 2015(04)
[2]气候变化对中国农业生产的影响研究进展[J]. 郭建平.  应用气象学报. 2015(01)
[3]丹参转录因子SmbHLH93的克隆及表达模式分析[J]. 周宏骏,武玉翠,晋鑫鑫,饶丽华,王喆之.  中草药. 2014(23)
[4]丹参普遍胁迫蛋白基因（SmUSP）的克隆及表达模式分析[J]. 邝静,生华,武玉翠,葛茜,张媛,王喆之.  植物生理学报. 2013(04)
[5]丹参:一种中药研究的模式生物[J]. 王庆浩,陈爱华,张伯礼.  中医药学报. 2009(04)
[6]探讨道地药材研究的模式生物及模型[J]. 黄璐琦,戴住波,吕冬梅,袁媛.  中国中药杂志. 2009(09)
[7]药用丹参资源分布与开发利用[J]. 赵宝林,钱枫,刘学医.  现代中药研究与实践. 2009(02)
[8]云南丽江丹参化学成分研究[J]. 张义平,陈鸿雁,程伟贤,冯宇,唐智杰,杨丽君.  中药材. 2008(02)
[9]丹参种质资源遗传多样性的AFLP分析[J]. 温春秀,吴志明,田伟,刘铭,周巧梅,谢晓亮.  华北农学报. 2007(S2)
[10]不同产地丹参脂溶性成分指纹图谱的比较研究[J]. 徐德然,王康才,丁静,王峥涛.  中国野生植物资源. 2006(06)

博士论文
[1]基于联合测序技术的丹参活性成分生物合成及调控机制研究[D]. 徐志超.北京协和医学院 2016

硕士论文
[1]水杨酸诱导的丹参转录组测序[D]. 张晓茹.西北农林科技大学 2016
[2]基于EST技术的丹参大规模基因克隆及其外源基因转化技术研究[D]. 闫亚平.陕西师范大学 2005



本文编号：3071562