维吾尔族饲鸽者肺DNA异常甲基化基因的筛选

发布时间：2021-03-09 10:53

　　目的:通过对维吾尔族饲鸽者肺全基因组DNA的筛选,得到异常甲基化基因,从而为饲鸽者肺的发生机制研究提供依据。方法:根据纳入及排除标准收集病例资料及血样标本（总纳入12例,其中患病组A组4例,阴性对照组B组4例,正常对照组C组4例）,对所取全血标本进行DNA提取,在Illumina Human Methylation 450K甲基化芯片技术的支持下对提取DNA进行甲基化检测,筛选DNA异常甲基化基因。结果:（1）A vs B:共计226个CpG位点在甲基化水平上存在差异,有138个差异甲基化基因数目。GO分析列出21个差异的基因功能类别条目。KEGG通路的功能注解与分析后得到9个差异甲基化基因通路。（2）B vs C:共计260个CpG位点在甲基化水平上存在差异,有140个差异甲基化基因数目。GO分析仅列出1个差异的基因功能类别条目。KEGG通路的功能注解与分析后得到1个差异甲基化基因通路。（3）B vs C:共计243个CpG位点在甲基化水平上存在差异,有109个差异甲基化基因数目。GO分析列出3个差异的基因功能类别条目。KEGG通路的功能注解与分析后没有得到差异甲基化基因通路。（4）... 

【文章来源】：新疆医科大学新疆维吾尔自治区

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

实验流程Fig.1Experimentalprocess

医院确诊的 4 例饲鸽者肺患者为病例组（A 组照组（B 组）4 例，为维吾尔族饲养鸽子时间在现的维吾尔族人；正常对照组（C 组）为 4 例其中对照组 4 例，年龄、性别、籍贯等均病例）、阴性对照组(B 组)及健康对照组(C析分析，在 Illumina 甲基化 HM450K BeadChip 础之上实现背景数值校正预处理，之后对探针在对原始甲基化数据进行基础处理之后，用各关系数(Pearson Correlation Coefficiency, PCC)，基化谱相关性进行分析，对 A、B、C 三组两两都有较高的相关性，这在一定程度上表明样本。除此之外，对三组的探针进行统计，得到平照组之间的联系进行明确，最终的结果证明患关性检验 P=2.2e-16），见图 4，图 5，图 6。

图 5 病例组与健康对照组甲基化程度全基因相关性ip between the case group and the healthy control group wmethylation whole gene（相关性检验 P=2.2e-16，PCC=0.9968）

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]TNF-α基因多态性与维吾尔族饲鸽者肺易感性的研究[D]. 孟珍芝.新疆医科大学 2014
[2]HLA-DQA1基因多态性与儿童支气管哮喘的相关性及血清IL-4、IFN-γ水平关系的研究[D]. 黄飞燕.泸州医学院 2013



本文编号：3072742