Alternaria altrenata诱导下红枣抗黑斑病基因的转录组学分析
发布时间:2021-03-09 14:50
南疆红枣黑斑病的发生,严重影响了当地农民增收致富,阻碍了枣产业的可持续健康发展。当前,众多学者对该病害的防治主要从病原菌的形态结构及生理生化性质方面展开,从分子水平方面鲜有报道。因此,本文尝试探究并分析红枣在链格孢菌(Alternaria altrenata)诱导后转录组水平下的差异变化,挖掘与红枣黑斑病抗性相关的功能基因,从分子角度探究红枣果实中关键基因的调控,为该病害的防治奠定分子理论基础。1.通过探究导致南疆红枣黑斑病的主要病原菌,为后续抗病基因的精准筛选和靶标防治奠定基础。本文以灰枣和骏枣果实为试验材料,采用高通量测序技术和传统分离鉴定相结合的方法,以喀什、和田和阿克苏3个地区患病果实进行发病率调查统计分析、组织分离、形态学观察、分子生物学分析和病理学接种试验为结果依据,明确导致南疆红枣黑斑病的主要病原菌是链格孢菌(A.alternata);骏枣田间患病率比灰枣高出9.4倍,灰枣比骏枣抗病性强。2.为从分子水平研究红枣果实在链格孢菌诱导下的应答机制,筛选出抗病基因。以转录组测序技术为基础对A.alternata侵染0-4 d的灰枣和骏枣果实进行测定,分析其差异基因表达及相关代谢...
【文章来源】:塔里木大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
不同红枣品种患病率统计
DNA提取检测图
塔里木大学硕士学位论文第2章红枣黑斑病病原菌的分离与鉴定15为进一步探究病原菌的种水平情况,将相对丰度排名前10的菌属放入真菌数据库进行比对,进行种水平OTUs数量的统计,结果显示unclassifiedAlternaria的相对丰度占98%以上(如表2-6),推测数据库中数据信息有限,无法准确鉴定至种水平,需通过分子生物学技术进行种水平的探究。图2-3各水平分类单元统计图Figure2-3Statisticsoftaxaatvariouslevels注:J1:喀什地区,J2:和田地区,J3:阿克苏地区;下同Note:J1:Kashiarea,J2:Hetianarea,J3:Aksuarea;thesamebelow表2-5phylum水平的OTU数Table2-5NumberofOTUsatphylumlevelPhylumTaxonJ1J2J3OTUsRelativeabundance(%)OTUsRelativeabundance(%)OTUsRelativeabundance(%)Ascomycota7187199.98%7116898.15%7186599.92%Basidiomycota00%240.03%5(6.95E-5)%Mortierellomycota3(4.17E-5)%00%00%unclassified_Fungi00%4(4.56E-5)%00%unidentified00%6780.94%4(4.17E-5)%
【参考文献】:
期刊论文
[1]芸薹根肿菌侵染早期甘蓝型油菜转录组分析[J]. 罗延青,王云月,俎峰,符明联,赵凯琴,张云云,王敬乔,田正书,陈苇,李劲峰,原小燕,李根泽. 中国油料作物学报. 2019(03)
[2]枣黑斑病防治措施的探究[J]. 王鹏程,王兰,董力畅. 新疆农垦科技. 2019(01)
[3]基于新一代高通量测序技术分析拮抗酵母Cryptoccocus laurentii诱导处理樱桃番茄果实后转录组学的变化[J]. 唐琼,郑晓冬. 食品科学. 2019(18)
[4]转录组测序技术筛选安徽乌菜与普通白菜的差异表达基因[J]. 王明霞,田红梅,江海坤,贾利,王艳,方凌. 中国蔬菜. 2018(12)
[5]应用高通量测序技术研究新疆产区葡萄果实、叶片及果园土壤微生物多样性[J]. 魏玉洁,邹弯,马文瑞,闫寅卓,武运,薛洁. 食品科学. 2018(06)
[6]阿拉尔垦区红枣黑斑病影响因素调查及绿色防控建议[J]. 陈存红,王兰. 新疆农垦科技. 2017(06)
[7]南疆骏枣黑斑病症状表现及病原菌鉴定[J]. 董宁,冯宏祖,王兰,纪显洪,于丝丝. 植物保护学报. 2016(06)
[8]新疆红枣黑斑病病原菌鉴定及拮抗细菌筛选[J]. 包慧芳,王宁,侯敏. 新疆农业科学. 2016(09)
[9]大岩桐花萼和幼叶转录组研究[J]. 费元,韩雪,余红,庞基良. 园艺学报. 2015(12)
[10]南疆骏枣黑斑病病原菌的分离、鉴定及控制研究[J]. 郭东起,蒋卉,牛宁宁,杨保求. 中国植保导刊. 2015(12)
硕士论文
[1]黄瓜产量杂种优势的转录组学分析[D]. 赵阳.东北农业大学 2019
本文编号:3073026
【文章来源】:塔里木大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
不同红枣品种患病率统计
DNA提取检测图
塔里木大学硕士学位论文第2章红枣黑斑病病原菌的分离与鉴定15为进一步探究病原菌的种水平情况,将相对丰度排名前10的菌属放入真菌数据库进行比对,进行种水平OTUs数量的统计,结果显示unclassifiedAlternaria的相对丰度占98%以上(如表2-6),推测数据库中数据信息有限,无法准确鉴定至种水平,需通过分子生物学技术进行种水平的探究。图2-3各水平分类单元统计图Figure2-3Statisticsoftaxaatvariouslevels注:J1:喀什地区,J2:和田地区,J3:阿克苏地区;下同Note:J1:Kashiarea,J2:Hetianarea,J3:Aksuarea;thesamebelow表2-5phylum水平的OTU数Table2-5NumberofOTUsatphylumlevelPhylumTaxonJ1J2J3OTUsRelativeabundance(%)OTUsRelativeabundance(%)OTUsRelativeabundance(%)Ascomycota7187199.98%7116898.15%7186599.92%Basidiomycota00%240.03%5(6.95E-5)%Mortierellomycota3(4.17E-5)%00%00%unclassified_Fungi00%4(4.56E-5)%00%unidentified00%6780.94%4(4.17E-5)%
【参考文献】:
期刊论文
[1]芸薹根肿菌侵染早期甘蓝型油菜转录组分析[J]. 罗延青,王云月,俎峰,符明联,赵凯琴,张云云,王敬乔,田正书,陈苇,李劲峰,原小燕,李根泽. 中国油料作物学报. 2019(03)
[2]枣黑斑病防治措施的探究[J]. 王鹏程,王兰,董力畅. 新疆农垦科技. 2019(01)
[3]基于新一代高通量测序技术分析拮抗酵母Cryptoccocus laurentii诱导处理樱桃番茄果实后转录组学的变化[J]. 唐琼,郑晓冬. 食品科学. 2019(18)
[4]转录组测序技术筛选安徽乌菜与普通白菜的差异表达基因[J]. 王明霞,田红梅,江海坤,贾利,王艳,方凌. 中国蔬菜. 2018(12)
[5]应用高通量测序技术研究新疆产区葡萄果实、叶片及果园土壤微生物多样性[J]. 魏玉洁,邹弯,马文瑞,闫寅卓,武运,薛洁. 食品科学. 2018(06)
[6]阿拉尔垦区红枣黑斑病影响因素调查及绿色防控建议[J]. 陈存红,王兰. 新疆农垦科技. 2017(06)
[7]南疆骏枣黑斑病症状表现及病原菌鉴定[J]. 董宁,冯宏祖,王兰,纪显洪,于丝丝. 植物保护学报. 2016(06)
[8]新疆红枣黑斑病病原菌鉴定及拮抗细菌筛选[J]. 包慧芳,王宁,侯敏. 新疆农业科学. 2016(09)
[9]大岩桐花萼和幼叶转录组研究[J]. 费元,韩雪,余红,庞基良. 园艺学报. 2015(12)
[10]南疆骏枣黑斑病病原菌的分离、鉴定及控制研究[J]. 郭东起,蒋卉,牛宁宁,杨保求. 中国植保导刊. 2015(12)
硕士论文
[1]黄瓜产量杂种优势的转录组学分析[D]. 赵阳.东北农业大学 2019
本文编号:3073026
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3073026.html
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