胃癌上皮间质转化关键基因TNS1的识别和验证及临床关联研究

发布时间：2021-03-09 21:06

　　胃癌是我国最常见的消化道恶性肿瘤,且世界上近一半的新发胃癌位于我国。胃癌以高度侵袭性和易远处转移为特征,死亡率在我国所有恶性肿瘤中位列第三,但其侵袭转移的具体机制仍远不清楚。上皮间质转化（Epithelial-mesenchymal transition,EMT）可以使肿瘤细胞获得侵袭转移的能力,是肿瘤转移的开端,但其分子基础仍有待深入研究。近年来,高通量测序技术促进了我们对肿瘤分子特征的认识,也为EMT的研究带来新的契机。胃癌的高通量测序研究揭示了以高侵袭转移性为特征的间质样胃癌即EMT分子亚型的存在。为了进一步认识胃癌EMT的具体分子机制,本课题利用公共数据库研究了间质样胃癌相关的基因表达谱,并通过生信方法筛选出了胃癌EMT的潜在关键基因TNS1。我们提出TNS1通过激活EMT上游关键驱动基因从而促进胃癌EMT及侵袭转移,且影响胃癌患者预后的科学假说,并通过细胞功能实验、机制研究及临床关联研究予以验证。本课题初步揭示了 TNS1在胃癌侵袭转移中的作用和机制,为抑制胃癌侵袭转移提供了理论依据和潜在的治疗靶点,有利于胃癌精准治疗的发展。第一部分 间质样胃癌的分子特征及EMT关键基因筛选... 

【文章来源】：江苏大学江苏省

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

间质样胃癌和上皮样胃癌间差异表达基因.A:火山图;B:TOP50基因热图

胃癌上皮间质转化关键基因TNS1的识别和验证及临床关联研究6图2.基因集富集分析结果Fig2.Genesetenrichmentanalysisresults2.3WGCNA及关键基因筛选间质样和上皮样胃癌两组间表达量比值对数值(logFC)大于1的显著差异表达基因共1230个。WGCNA将这些基因分为3种颜色的模块，我们关注与间质样胃癌正相关的蓝绿色模块，模块内基因与间质样胃癌呈现高度的正相关(SpearmanR=0.83;p<0.001)。通过对基因的功能关联程度评分并排序，我们从中筛选出了最为核心的30个基因。其中，TNS1基因与胃癌EMT的关系尚未见报道。

江苏大学硕士学位论文7图3.加权基因共表达网络分析.A:聚类树状图；B:模块-特质关系图；C:；D:通过对蓝绿色模块内基因的功能关联程度评分并排序，我们从中筛选出了最为核心的30个基因。Fig3.Weightedgeneco-expressionnetworkanalysis.A:clusteringdendrogram;B:module-traitrelationshipdiagram;C:relationshipbetweengenesinblue-greenmodulesandPNISignificance;D:Byscoringandrankingthedegreeoffunctionalassociationofthegenesintheblue-greenmodule,weselectedthe30coregenesfromthem.

【参考文献】：
期刊论文
[1]Tensin1蛋白与胃癌临床病理特征及预后的关系[J]. 曹一鑫,李小琴,王宏宇,任琎,顾汉刚,严玲花,陈文琪,王德强.  中华消化外科杂志. 2018 (06)
[2]亚洲癌症研究组新近提出胃癌分子分型的浅析[J]. 于颖彦.  诊断学理论与实践. 2015(06)
[3]Snail2在子宫内膜癌中的表达及意义[J]. 王洪伟,胡建国.  现代预防医学. 2012(17)



本文编号：3073476