甜菜CPD基因家族生物信息学分析

发布时间：2021-03-13 20:01

　　BvCPD基因编码细胞色素P450类固醇侧链羟化酶（CYP90）,调控油菜素甾醇（BRs）的生物合成。为探索BvCPD基因在甜菜生长发育中的功能,通过HMM和BLAST在甜菜基因组数据中检索P450保守结构域序列,并对其家族成员进行分析。结果表明:共检测到76个BvCPD家族成员,聚为10个亚组,其中,第Ⅱ亚组的BvCPD家族成员最多（16个）;染色体定位结果显示,甜菜9条染色体上均有BvCPD基因分布,其中第7条染色体上分布最多,但仍有10个家族成员尚未明确定位;BvCPD蛋白共有10个保守性模体,模体2和模体7存在于所有BvCPD家族成员中。进一步对BvCPD家族成员中的Bv2_qyup进行分析发现,该基因编码473个氨基酸,相对分子量为54.11 kDa,等电点为8.85,其编码的蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,可能定位于细胞质中,是一种含信号肽的亲水跨膜蛋白,存在44个磷酸化位点;同源多重比对发现,Bv2_qyup与藜麦、菠菜、毛果杨、黄瓜和拟南芥CPD的同源性较高。研究结果将为BvCPD基因克隆和功能鉴定提供理论依据。 

【文章来源】：中国糖料. 2020,42(04)

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

CPD基因家族系统进化树分析

CPD家族蛋白保守性模体分布

BvCPD家族成员的染色体分布

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
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本文编号：3080824