樱桃谷鸭OASL基因全长cDNA的克隆及其生物信息学分析

发布时间：2021-03-14 13:40

　　为了获得樱桃谷鸭寡腺苷酸合成酶样蛋白质基因（OASL）全长cDNA,并且初步了解其生物学特性,采用RT-PCR和RACE方法从鸭脾脏组织总RNA中扩增OASL基因cDNA片段,应用生物信息学方法,系统分析鸭OASL的遗传进化以及蛋白质的理化性质、二级结构和亚细胞定位。结果表明,樱桃谷鸭OASL基因（Gen Bank登录号:KX255654）全长1 630 bp,其中包含19 bp的5’UTR（Untranslated region,UTR）、99 bp的3’UTR（Untranslated region,UTR）和PolyA尾巴、1 512 bp的编码区（Coding region,CDS）,翻译编码504个氨基酸多肽。鸭OASL蛋白具有寡腺苷酸合成酶（OAS）蛋白家族的典型特征,即N端为寡腺苷酸合成酶样结构域（OAS-like domain,OLD）,C端为2个串联的泛素化样结构域（Ubiquitin-like domains,Ub LDs）,不具有信号肽和跨膜区。序列比对和系统进化分析结果表明,OASL氨基酸序列在同种之间比较保守,与已报道的鸭OASL的同源性高达100%,与鹅同源... 

【文章来源】：江苏农业学报. 2017,33(02)北大核心

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

鸭和其他物种OASL氨基酸序列的系统进化树

鸭OASL蛋白质结构域预测

鸭OASL蛋白质相互作用模型


本文编号：3082288