绞股蓝转录组测序挖掘三萜合成基因与鲨烯合酶正选择位点突变表达载体构建

发布时间：2021-03-14 20:06

　　第一部分绞股蓝转录组测序挖掘三萜合成通路及相关酶基因目的:通过对绞股蓝（Gynostemma pentaphyllum（Thunb.）Makino,G.pentaphyllum）的根、茎和叶三个部位分别进行转录组测序分析,挖掘绞股蓝三萜合成通路及相关酶基因。使用q PCR技术检验绞股蓝三萜合成通路上呈现部位差异表达的法呢基焦磷酸合酶（Farnesyl diphosphate synthase,FPS）、鲨烯合酶（Squalene synthase,SS）和鲨烯环氧化酶（Squalene epoxidase,SE）基因在转录后水平的表达,验证它们在转录组测序分析中的表达规律。同时,使用紫外分光光度法测量三萜皂苷在根、茎和叶三个部位的含量差异,进一步验证FPS、SS和SE在根、茎和叶的表达差异。最后总结绞股蓝FPS、SS和SE表达的部位差异性规律与三萜皂苷含量差异分布规律,为进一步研究绞股蓝三萜合成相关基因表达调控机制做铺垫。方法:分别提取绞股蓝根、茎和叶三个部位的RNA并进行转录组测序反应,结合KEGG通路数据库查找注释文件当中的绞股蓝三萜合成关键酶基因FPS、SS和SE,寻找三个基因的... 

【文章来源】：广西医科大学广西壮族自治区

【文章页数】：120 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

绞股蓝根、茎和叶三部位RNA电泳图(1-3分图中，M泳道代表DL2000的DNAMaker，泳道1-9分别为叶1、叶2、茎2、叶3、茎3、茎1、根1、根2和根3的RNA；4分图是TaKaRaDL2000

绞股蓝三萜合成通路图(英文缩写注释见附录表1-1)

绞股蓝根茎叶的FPS，SS和SE表达量RPKM值(G，J和Y分别代表绞股蓝的根，茎和叶；

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3082871