甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析

发布时间：2021-03-16 18:22

　　为揭示HD-ZIP蛋白家族成员在甘蓝型油菜全基因组中的分布及相关特征,通过生物信息学方法共鉴定出74个HD-ZIP转录因子,分别被定位到甘蓝型油菜的19条染色体和8条随机序列;这74个HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP结构域;系统发育进化树将该家族成员聚为4大类;共线性分析发现大部分基因不仅在A和C染色体组间存在共线性,而且在各自染色体组内也存在串联重复事件;基因表达分析发现,大部分HD-ZIP家族基因在根和叶中均有表达,并且在根中表达的基因多于叶片,受到盐胁迫处理时,大部分基因表达量会增加。初步明确了甘蓝型油菜HD-ZIP家族成员结构特点和相关功能,为进一步研究甘蓝型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物学功能奠定了基础,为油菜抗性育种工作提供科学依据。 

【文章来源】：西北农业学报. 2020,29(09)北大核心

【文章页数】：13 页

【部分图文】：

甘蓝型油菜HD-ZIP转录因子的系统进化发生树

甘蓝型油菜HD-ZIP家族基因结构

甘蓝型油菜HD-ZIP转录因子进化树和保守基序

【参考文献】：
期刊论文
[1]葡萄全基因组DELLA蛋白基因家族鉴定及其应答外源赤霉素调控葡萄果实发育的特征[J]. 张文颖,王晨,朱旭东,马超,王文然,冷翔鹏,郑婷,房经贵.  中国农业科学. 2018(16)
[2]甘蓝型油菜HMG基因家族的生物信息学分析[J]. 李春金,郭媛媛,杨启航,王彤,王秋梅,冯书燕,胡静静,裴巧英,李野默,丁洪玲,宋小明.  中国油料作物学报. 2018(03)
[3]油菜miR156基因家族及其靶基因生物信息学分析及鉴定[J]. 李晓康,刘红芳,刘婧琳,郑明,华玮.  中国油料作物学报. 2018(02)



本文编号：3086403